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요약

human CD59/intermedilysin cell ablation 도구를 사용하여 신장 대식세포의 재생을 연구하기 위한 신장 대식세포의 선택적 절제에 대한 프로토콜이 여기에 보고되어 있습니다. 이 방법은 신장, 간 및 지방 조직에 있는 다른 세포 집단의 기능 및 재생을 연구하는 데에도 적용할 수 있습니다.

초록

신장 대식세포(RM)는 신장 건강, 면역 감시, 조직 항상성 및 부상에 대한 반응을 조율하는 데 필수적입니다. 이전에 우리는 human CD59 (hCD59)/intermedilysin (ILY) 세포 절제 도구를 사용하여 골수 또는 배아 기원의 RM의 뚜렷한 운명, 역학 및 틈새를 연구했다고 보고했습니다. RM은 난황낭 유래 대식세포, 태아 간 단핵구, 골수 유래 단핵구에서 유래하며, 순환 단핵구의 국소 증식 및 모집을 통해 성인이 되어서도 유지됩니다. 여기에서는 1) 마우스 RM에서 hCD59의 Cre-inducible 발현의 생성 및 특성화, 2) ILY의 정제 및 ILY 활성의 특성화, 3) 복합 마우스에서 RM의 hCD59 발현 유도, 4) ILY 매개 RM 절제 후 재생의 특성화를 포함하여 RM의 재생을 연구하기 위한 선택적 절제에 대한 자세한 프로토콜을 보고합니다. ILY는 복합 마우스에서 RM을 특이적이고 빠르게 고갈시키며, ILY 투여 후 1일 이내에 효율적인 대식세포 절제를 실시합니다. 신장 대식세포 재생은 절제 후 3일째에 시작되어 7일째까지 ~88%의 회복율을 보였습니다. 이 모델은 대식세포 생물학을 연구하기 위한 강력한 도구를 제공하며 신장, 간 및 지방 조직의 다른 세포 집단을 선택적으로 절제하여 이들의 기능과 재생을 조사하는 데 사용할 수 있습니다.

서문

신장 대식세포(RM)는 신장의 항상성을 유지하고, 면역 반응을 조절하며, 손상 후 조직 복구를 촉진하는 필수 면역 세포입니다. 그들은 phagocytosis, 항원 제시, 염증 및 항염증 반응의 오케스트레이션을 포함한 다양한 기능을 수행합니다 1,2,3. 지역 환경에 따라 RM은 전염증성(M1) 또는 항염증성(M2) 표현형으로 분극화될 수 있으며, 이는 부상을 악화시키거나 치유를 촉진할 수 있습니다 4,5,6. RM의 조절 장애는 급성 신장 손상(AKI) 및 만성 신장 질환(CKD)의 발병 및 진행과 관련이 있어 신장 건강 및 병리학에 중요한 역할을 합니다 7,8. RM은 배발생 시 난황낭 유래 대식세포, 태아 간 단핵구, 성인기 골수 유래 단핵구를 포함한 다양한 출처에서 발생합니다. RM은 출생 후 신장 성장과 병행하여 확장 및 성숙하며, 주로 출생 전 태아 간 단핵구에서 유래하며, 성인이 될 때까지 자가 유지는 말초 단핵구에 의해 보충됩니다9. 성인의 경우, 순환하는 단핵구는 항상성 또는 부상 신호에 의해 신장으로 모집되며, 국소 미세환경적 영향에 따라 대식세포로 분화됩니다. RM 유지는 국소 증식과 순환 단핵구 9,10,11,12의 주기적인 보충을 통해 유지됩니다.

우리는 이전에 골수 또는 배아 기원에서 유래한 RM의 뚜렷한 운명, 역학 및 미세환경적 틈새를 조사하기 위한 도구13,14로 human CD59 (hCD59)/intermedilysin (ILY) 세포 절제 시스템의 사용을 입증했습니다9. ILY는 표적 세포막에 공극을 형성하여 몇 초 내에 인간 세포를 선택적으로 용해시킵니다15. 이러한 특이성은 인간 CD59 (hCD59)에 대한 ILY의 독점적인 결합 친화력에서 발생하며, 이 수용체가 결핍된 다른 종의 세포에는 상호 작용이나 용해 효과가 없습니다15. 이 개념을 기반으로 우리는 인터메디신(ILY)14의 적용을 통해 형질전환 마우스 모델에서 인간 CD59 발현 세포의 빠르고 조건적이며 표적화된 절제를 가능하게 하는 도구를 설계했습니다. 이 도구의 사용을 용이하게 하기 위해 인간 CD59의 발현이 Cre 매개 재조합13 후에만 발생하는 플록스된 STOP-CD59 노킨 마우스(ihCD59)를 생성하여 조건부 및 표적 세포 절제 모델을 개발했습니다. 이전에는 신장 대식세포로 정의되는 CD11bintF480hi에서만 발현되는 CX3CR1cre-EFP 유전자가 발견되었습니다9. 따라서 신장 대식세포에서 hCD59를 발현하기 위해 CX3CR1CreER2+/+ lines를 사용하여 ihCD59 마우스와 교차했습니다. 유전자형 ihCD59+/-/CX3CR1CreER+/-9(+/-, +/+ 및 -/-는 각각 동형접합체, 반접합체 및 비캐리어 형질전환 마우스를 나타냄)를 가진 복합 마우스를 성공적으로 생성했습니다. hCD59+/-/CX3CR1CreER+/- 화합물 마우스에 타목시펜 투여 hCD59 발현에 의해 조건부로 표지 및 표시된 RM9. ILY 치료를 통해 RM 틈새가 고갈된 후, 말초 단핵구는 즉시 골수 유래 RM으로 분화되어 앞서9에서 설명한 바와 같이 틈새를 효과적으로 다시 채웠습니다. 이 재생은 CX3CR1/CX3CL1 신호축에 결정적으로 의존했으며, 이는 RM 개체군의 유지 및 복원9 모두에 필수적인 역할을 강조했습니다. 또한, 배아 유래 RM은 뚜렷한 해당작용 능력으로 인해 골수 유래 RM보다 면역 복합체를 제거하는 능력이 더 높고 면역 공격에 더 민감하다는 것을 보여줍니다9.

ILY 투여 후 Cre-inducible hCD59(ihCD59) 매개 신속 세포 절제를 사용하여 RM의 재생을 조사하기 위해 RM의 선택적 절제에 대한 자세한 프로토콜을 제시합니다. ILY 주입은 CX3CR1CreER+/-/ihCD59+/- compound 마우스에서 hCD59를 조건부 및 특이적으로 발현하는 RM의 표적 절제를 유발했습니다. 절제 후 유세포분석을 사용하여 대식세포 역학 변화를 모니터링한 결과 대식세포가 급격히 고갈된 후 RM이 재생되는 것을 발견했습니다. 재조합 ILY는 E. coli BL21(DE3) 세포에서 발현되었으며 니켈-NTA 친화성 크로마토그래피를 사용하여 정제되었습니다. 재조합 ILY의 순도와 기능성은 SDS-PAGE, 분광광도법 및 용혈 분석에 의해 확인되어 특징적인 콜레스테롤 의존성 사이토리신 활성을 입증했습니다. ILY를 사용하여 마우스의 RM을 고갈시켜 ILY 투여 후 1일 이내에 효율적인 대식세포 절제를 달성했습니다. 신장 대식세포 재생은 절제 후 3일째에 시작되어 7일째까지 ~85%의 회복율을 보였습니다. 데이터는 재생이 주로 단핵구 모집에 의해 주도된다는 것을 시사합니다. 이 모델은 대식세포 생물학을 연구하기 위한 강력한 도구를 제공하며 신장 질환에서 대식세포 개체군의 표적 조작을 위한 치료 잠재력을 가지고 있습니다. ihCD59/ILY 세포 절제 도구는 신장, 간, 지방 조직 및 기타 장기의 세포 기능 및 재생을 연구하는 데 사용할 수 있습니다.

프로토콜

동물 연구 프로토콜은 Tulane University School of Medicine의 IACUC(Institutional Animal Care and Use Committee)의 승인을 받았습니다(프로토콜 번호 1482). 생후 10-12주, 체중 25-30g의 실험용 마우스 Cx3cr1CreER+/+ihCD59+/+는 대학의 동물 시설에서 특정 병원체가 없는(SPF) 조건에서 사육되었습니다. 신장 격리와 관련된 모든 절차는 무균 환경에서 진행되었으며, 연구원들은 오염을 방지하기 위해 장갑과 안면 마스크를 착용했습니다. 연구에 사용된 시약 및 장비에 대한 자세한 내용은 재료 표에서 확인할 수 있습니다.

1. 동물 준비

  1. 잭슨 연구소에서 CX3CR1CreER+/+마우스를 구합니다. Tulane University School of Medicine(SOM)의 특정 SPF(Riskogen-Free) 시설에 생쥐를 수용합니다. 통제된 환경 조건에서 12시간의 명암 주기로 동물을 유지하십시오.
  2. 번식을 위해 C57BL/6 유전적 배경을 가진 이전에 생성된 ihCD59+/+ 마우스를 사용합니다. 동형접합 CX3CR1CreER+/+ 마우스(CX3CR1 발현 부족)와 ihCD59+/- 마우스를 교배하여 CX3CR1CreER+/-/ihCD59-/-CX3CR1CreER+/-/ihCD59+/-의 자손 유전자형을 생성합니다.
  3. Anti-CX3CR1 항체9를 사용한 유세포 분석을 통해 이형접합 CX3CR1CreER+/- 마우스는 기능적 CX3CR1 발현을 유지하는 반면, 동형접합 CX3CR1CreER+/+ 마우스는 CX3CR1이 결핍되어 있는지 확인합니다.

2. ILY 생산 (14,15에서 파생)

  1. 0일차
    1. -80°C에서 보관된 pTrcHis-A 플라스미드 (보충 그림 1) 에서 His-tagged ILY 염기서열을 운반하는 ILY 박테리아 균주 BL21-DE3-RIPL의 동결 스톡을 회수합니다. 10μL의 박테리아 스톡을 1μg/mL 농도의 암피실린을 함유한 40μL의 루리아 브로스(LB) 배지에 접종합니다.
    2. 접종된 혼합물을 암피실린(1μg/mL)이 보충된 LB 한천 플레이트에 펴 바릅니다. 박테리아 인큐베이터에서 37 °C의 하룻밤 동안 플레이트를 배양합니다.
  2. 1일차
    1. LB 한천 플레이트에서 6개의 개별 콜로니를 선택합니다. 각 콜로니를 암피실린을 함유한 3.5mL의 LB 배지에 접종합니다. 37 ° C에서 밤새 배양하십시오.
  3. 2일차
    1. 각 3.5mL 스타터 배양액을 암피실린이 보충된 250mL의 LB 배지로 옮깁니다. 박테리아가 성장할 수 있도록 230 x g 에서 흔들면서 37°C에서 3시간 동안 배양합니다.
    2. 3시간 후 1M 원액(-20°C에서 보관)의 이소프로필 β-D-1-티오갈락토피라노사이드(IPTG)를 1:1000 희석으로 첨가하여 최종 농도 1mM를 달성합니다. 단백질 발현을 유도하기 위해 추가로 4시간 동안 배양을 계속합니다.
    3. 빈 원심분리기 병의 무게를 측정하고 무게를 기록합니다. 약 250mL의 유도 배양액을 원심분리기 병에 옮깁니다.
    4. 10,000 x g 에서 4°C에서 15분 동안 원심분리하여 세포를 펠렛화합니다. 상등액을 버리고 펠릿이 들어있는 병의 무게를 잰다. 원심분리 후 총 중량에서 빈 병 중량을 빼서 펠릿 중량을 계산합니다.
    5. ILY의 후속 추출 및 정제를 위해 박테리아 펠릿을 -20°C에서 보관하십시오.
  4. Day 3 : ILY 추출 및 정제
    1. 50mL 원심분리 튜브에 30mL의 Bug Buster Protein Extraction 시약과 30μL의 benzonase nuclease(1200 Kunitz 단위) 및 0.9μL의 lysozyme(10,000 단위의 효소 활성)을 결합하여 용해 완충액을 준비합니다.
    2. 용해 완충액이 균질하도록 용액을 부드럽게 혼합합니다. 준비된 용해 완충액을 박테리아 펠릿(2-5g)에 추가합니다. 박테리아 세포를 완전히 재현 탁시키기 위해 30-60 초 동안 혼합물을 철저히 소용돌이칩니다.
    3. 재현탁액을 두 개의 50mL 원심분리 튜브 간에 균등하게 나눕니다. 튜브를 얼음 위에 놓고 30-90분 동안 배양합니다. 배양 중에는 오비탈 셰이커를 사용하여 튜브를 부드럽게 흔들고 10-15초 동안 5-10분마다 짧게 와류를 사용하여 세포 용해를 향상시킵니다.
    4. 배양 후 4,900 x g 에서 4°C에서 30분 동안 용해물을 원심분리합니다.
    5. 1mL 피펫 팁을 사용하여 수돗물로 컬럼을 철저히 세척하여 이전에 사용한 잔여 레진을 제거합니다.
    6. 컬럼을 70% 에탄올로 헹구어 소독합니다. 컬럼 2x-3x를 차가운 ddH2O로 세척하여 잔류 에탄올을 제거합니다. 홀더에 기둥을 놓습니다.
    7. 6-10mL의 차가운 ddH2O를 첨가하여 정제를 위해 컬럼을 추가로 세척하고 평형을 이룹니다. 컬럼에 약 3mL의 수지 비드를 추가합니다. 컬럼을 30의 속도로 설정된 연동 펌프에 연결합니다.
    8. 10mL의 차가운 ddH2O를 첨가하여 수지를 완전히 현탁시키고 단백질 결합을 준비합니다. 15mL의 1x 충전 버퍼로 수지 비드를 세척하여 단백질 결합을 위해 수지를 준비합니다.
    9. 새 튜브에서 원심분리 후 박테리아 용해물 상등액을 수집하여 펠릿이 폐기되도록 합니다. 주사기가 있는 0.45μm 필터를 사용하여 상층액을 여과하여 남아 있는 세포 파편을 제거합니다.
    10. 여과된 박테리아 용해물 20-25mL를 3회에 걸쳐 컬럼에 통과시킵니다. 각 통과 후 20μL의 플로우 스루를 수집하고 나중에 광학 밀도(OD) 측정을 위해 P.E.로 표시합니다.
    11. 20-30mL의 결합 완충액으로 컬럼을 세척하여 결합되지 않은 단백질을 제거합니다. 20-30mL의 세척 버퍼로 컬럼을 세척합니다. OD 측정을 위해 세척 분획 20μL를 수집합니다.
    12. 10-20mL의 용리 완충액을 추가하여 결합된 단백질을 용리합니다. 3-4분 후에 마이크로 원심분리기 튜브를 사용하여 용리액 수집을 시작합니다. 튜브당 약 1mL를 수집하여 15-17개의 튜브를 채웁니다.
    13. 분광 광도계를 사용하여 A280에서 각 용출 분획의 흡광도를 측정합니다. A280 판독 중에 용리 버퍼를 블랭크로 사용합니다. A280에서 흡수도가 크게 증가한 튜브를 수집하는데, 이는 일반적으로 튜브 13 주위의 분획에서 발견되는 His-tagged ILY 단백질을 포함하고 있기 때문입니다.
    14. ILY 단백질을 함유한 용출 분획(또는 튜브)을 4°C에서 보관하십시오. 최적의 단백질 안정성을 보장하기 위해 다음 날 이내에 추가 단계를 진행하십시오.
      참고: 단백질 무결성을 유지하기 위해 가능한 경우 얼음 위 또는 4°C에서 모든 단계를 수행하십시오.
  5. 4일차: 용출액에서 내독소 제거
    1. 내독소 제거 수지 컬럼을 6-10mL의 초순수로 헹굽니다. 흐름을 조절하기 위해 컬럼을 부드럽게 누릅니다.
    2. 1% 소듐 데옥시콜레이트 용액 10mL(갓 만들었거나 1개월 이내)로 컬럼을 헹구어 결합된 내독소를 제거합니다. 6-10mL의 초순수로 컬럼을 다시 헹구어 잔여 세제를 제거합니다.
    3. 준비된 단백질 샘플을 수지 컬럼에 적용합니다. 최적의 내독소 결합을 위해 실온(RT)에서 1시간 동안 컬럼의 샘플을 배양합니다.
    4. 초기 플로우 스루 비율을 수집합니다. 추가 용리를 위해 컬럼에 ddH2O를 추가하고 약 10개의 튜브(튜브당 1mL)에서 용출된 분획을 수집합니다.
    5. 나중에 사용할 수 있도록 수지 컬럼을 4°C의 25% 에탄올에 보관하십시오. 용리된 단백질 샘플의 광학 밀도(O.D.)를 측정하여 수율을 정량화합니다. 첫 번째 용리 배치에서 총 단백질의 약 50%-70%를 회수할 것으로 예상됩니다.
  6. 5-6일차: 투석
    1. 1600mL의 증류된 탈이온수(ddH2O)를 고압증기멸균하여 2L의 투석 완충액을 준비합니다. 오토클레이브 물에 10x PBS 200mL, 글리세롤 200mL, MES(2-(N-모르폴리노) 에탄설폰산) 3.5115g을 추가합니다.
    2. 모든 시약이 완전히 용해될 때까지 마그네틱 교반 막대로 혼합물을 저어줍니다. 생성된 버퍼를 4°C에서 보관합니다.
    3. 보관된 용출 분획을 투석 키트에 추가한 다음 바늘로 투석 키트에서 공기를 제거합니다. 투석 키트를 사용하여 교반 속도를 약 2로 설정하고 4°C에서 24시간 동안 단백질 용액을 투석합니다.
    4. 투석 키트가 버퍼에 완전히 잠기도록 구성합니다. 다음날 투석 키트의 투석 버퍼를 2L 용기의 새 투석 버퍼로 교체하십시오. 추가로 24시간 동안 투석을 계속합니다.
    5. 흰색 침전물을 포함한 전체 용액을 멸균 튜브로 조심스럽게 옮겨 응집될 수 있는 ILY 단백질을 보존합니다. 원심 분리 제조업체에 대한 제조업체의 지침에 따라 원심 필터 장치를 사용하여 ILY 단백질을 농축합니다.
    6. 농축된 ILY 단백질을 멸균 튜브에서 200μL 부분으로 분취합니다. 각 튜브에 날짜와 이름을 표시하십시오. 나중에 겔 전기영동 및 용혈 분석에 사용할 수 있도록 -80 °C에서 부분 표본을 보관하십시오.

3. SDS-PAGE 전기영동에 의한 ILY 특성화

  1. 러닝 버퍼(20x)를 ddH2O로 희석하여 MOPS SDS 러닝 버퍼(1x)를 준비합니다.
  2. 90μL의 6x 로딩 버퍼와 10μL의 β-메르캅토에탄올(β-ME)을 혼합하여 흄 후드에서 샘플 버퍼를 준비합니다. 완전한 균질화를 보장하기 위해 용액을 철저히 혼합하십시오.
  3. 준비된 샘플을 로딩 버퍼와 결합하여 30μL의 최종 부피를 달성합니다. 샘플을 해동하고 격렬하게 와류로 둘러싸서 완전한 혼합을 보장합니다.
  4. 단백질을 변성시키기 위해 샘플을 95°C에서 5분 동안 가열합니다. 샘플을 4%-20% SDS-PAGE 젤에 로드합니다. 80V의 일정한 볼륨에서 전기영동을 90분 동안 실행합니다.
  5. 젤 카세트를 조심스럽게 열고 젤을 ddH2O에 5분 동안 담그십시오. 셰이커를 사용하여 세척 단계를 2회 반복합니다.
  6. 실온(RT)에서 Coomassie Brilliant Blue로 젤을 1시간 동안 염색합니다. ddH2O에서 30분 동안 젤을 세척합니다. 물을 새 ddH2O로 교체하고 완전한 탈색을 위해 하룻밤에서 3일까지 셰이커에서 젤을 배양합니다.
  7. 카메라를 사용하여 염색된 젤의 이미지를 캡처합니다(그림 1A). 정량적 및 정성적 평가를 위해 ImageJ 소프트웨어를 사용하여 겔을 분석합니다.

4. ILY 활성에 대한 용혈 분석

  1. 보관된 ILILY(Intermedilysin) 샘플을 실온에서 완전히 해동합니다. 균질성을 보장하기 위해 해동된 샘플을 철저히 소용돌이치며, ILY는 해동 시 응집될 수 있습니다.
  2. 연속 희석을 위해 96웰 플레이트를 설정합니다. 첫 번째 웰에 160μL의 ILY 원액(26.7ng/μL)을 추가합니다. 80μL의 1x PBS를 동일한 행 또는 열의 각 후속 웰에 추가합니다.
  3. 80μL의 ILY 용액을 첫 번째 웰에서 두 번째 웰로 옮깁니다. 용액이 균질한지 확인하기 위해 위아래로 피펫팅하여 철저히 혼합합니다. 두 번째 웰에서 세 번째 웰로 80μL를 옮기고 철저히 혼합합니다.
  4. 원하는 수의 희석액이 준비될 때까지 이전 웰에서 다음 웰로 80μL를 이동시켜 각 웰에 대해 이 프로세스를 반복합니다. 80 μL를 마지막 well로 옮긴 후 해당 well에서 80 μL를 폐기하여 플레이트 전체에 걸쳐 일정한 부피를 보장합니다.

5. 인간 적혈구(RBC)의 준비

  1. EDTA와 같은 항응고제가 들어 있는 튜브에 1-2mL의 신선한 인간 혈액을 뽑습니다. 혈액을 실온에서 3,000 x g 으로 5분 동안 원심분리합니다.
  2. 상층액을 버리고 상층액이 투명해질 때까지 PBS 2x-3x로 인간 적혈구 펠릿을 세척합니다. 세척된 인간 적혈구를 900μL의 1x PBS에 10μL의 적혈구를 첨가하여 1:100 희석을 달성합니다.
  3. 희석된 인간 적혈구 10μL를 각 웰에 추가합니다. 희석 플레이트에서 연속으로 희석된 ILY 용액 30μL를 각 웰에 추가합니다. 160μL의 1x PBS를 추가하여 최종 부피를 웰당 200μL로 만듭니다(시작 농도: 4ng/μL).
  4. 희석된 인간 적혈구 10μL를 대조군 웰에 추가합니다. 네거티브 컨트롤을 위해 190μL의 물 또는 1x PBS를 대조군 웰에 추가합니다. 접시를 부드럽게 두드려 섞습니다.
  5. 용혈이 일어날 수 있도록 37°C에서 30분 동안 플레이트를 배양합니다. 플레이트를 3,000 x g 에서 5분 동안 원심분리하여 손상되지 않은 인간 적혈구를 펠릿화합니다.
  6. 각 웰에서 100μL의 상층액을 바닥이 평평한 새 96웰 플레이트로 조심스럽게 옮깁니다. 마이크로플레이트 리더를 사용하여 405nm에서 상층액의 흡광도를 측정합니다.
  7. 샘플의 흡광도 값을 대조군16과 비교하여 ILY의 용혈 활성을 계산합니다.

6. 타목시펜 처리, RM 고갈 및 재생

  1. 옥수수 기름을 42 °C로 예열합니다. 예열된 옥수수 기름 5mL에 타목시펜 100mg을 용해시켜 20mg/mL 농도의 원액을 준비합니다.
  2. 10-12주 된 수컷 CX3CR1CreER+/-/ihCD59+/- 마우스에게 체중 100μg/g의 용량으로 타목시펜을 복강내(i.p.)로 투여합니다. 타목시펜 주사를 3일 연속으로 반복합니다.
  3. Crea 매개 hCD59 발현이 가능하도록 최종 타목시펜 주사 후 15일 동안 기다립니다.
  4. CX3CR1CreER+/-/ihCD59+/- 마우스 및 CX3CR1CreER+/-/ihCD59-/- 리터메이트 대조군에 120ng/g 체중의 용량으로 인터메디신(ILY)을 1회 정맥 주사합니다.
  5. ILY 투여 후 1일, 3일, 7일에 유세포분석을 수행하여 RM 절제 및 후속 재생을 모니터링하고 확인합니다17.

7. 쥐 안락사

  1. 동물을 적절한 챔버에 넣고 IACUC 프로토콜에 따라 이소플루란에 노출시킵니다. 페달 철수 반사와 같은 반사 신경이 없는지 확인하여 마취를 확인하십시오.
  2. 마우스가 완전히 마취되고 반응이 없으면 안락사를 보장하기 위해 경추 탈구를 수행합니다. 페달 철수 반사와 같은 반사 신경이 없는지 확인하여 안락사를 확인하십시오.
  3. 멸균 메스를 사용하여 복부를 약 2cm 정도 절개하고 피부를 부드럽게 수축시켜 흉강을 노출시킵니다. 끝이 뭉툭한 수술용 가위를 사용하여 흉골을 따라 흉곽을 열어 심장을 노출시킵니다.
  4. 21G-23G 바늘을 좌심실에 삽입합니다. 10-20mL의 차가운 PBS로 관류를 시작하여 혈액을 씻어냅니다.
  5. 혈액이 순환에서 배출될 수 있도록 오른쪽 심방을 엽니다. 신장이 창백해 보일 때까지 계속 관류하여 효과적인 혈액 정화를 나타냅니다.
  6. 신장을 등쪽 몸벽에 대고 위치시킵니다. 집게와 가위를 사용하여 신장을 주변 조직과 부드럽게 분리합니다. 신장 캡슐을 절제하고 즉시 신장을 차가운 PBS에 넣어 분해를 방지하십시오.

8. 신장 소화

  1. HBSS(Ca/Mg free) 9mL, 콜라겐분해효소 IV(5mg/mL) 1mL, DNase I(10mg/mL) 20μL를 혼합하여 소화 효소 칵테일을 준비합니다. 효소 용액을 신선하게 준비하고 사용할 때까지 얼음에 보관하십시오.
  2. HBSS 5mL가 들어 있는 페트리 접시에 멸균 가위를 넣어 신장을 작은 조각(이상적으로는 1mm ≤)으로 다집니다. 신장 조직 조각을 10mL의 준비된 효소 용액이 들어 있는 15mL 튜브로 옮깁니다.
  3. 37°C에서 30분 동안 부드러운 교반으로 튜브를 배양하여 조직을 해리합니다. 피펫 또는 주사기 플런저를 사용하여 조직을 부드럽게 분쇄하여 세포 덩어리를 추가로 해리합니다.
  4. 40μm 세포 여과기를 통해 세포 현탁액을 통과시켜 조직 파편을 제거합니다. 18°C에서 10분 동안 650 x g 에서 세포 현탁액을 원심분리합니다.
  5. 원심분리 후 완충액을 조심스럽게 디캔팅합니다. 펠릿을 5mL의 용해 완충액에 재현탁시키고 실온에서 5분 동안 배양하여 적혈구를 용해시킵니다.
  6. PBS로 세포를 세척하여 용해 완충액을 제거합니다. 생성된 단일 세포 현탁액을 더 사용할 때까지 얼음 위에서 유지하십시오.

9. 밀도 구배 원심 분리

  1. 조혈 세포를 풍부하게 하려면 이전 세척의 세포 펠릿을 10mL의 30% 밀도 구배 용액에 재현탁합니다. 원심분리기 튜브에 3mL의 70% 밀도 구배 용액 위에 용액을 조심스럽게 층을 이룹니다.
  2. 브레이크를 밟지 않고 500 x g 에서 30분 동안 그래디언트를 원심분리합니다. 원심 분리 다음, 30%와 70% 용액 사이의 계면층을 조심스럽게 수집합니다. 이 층에는 농축된 단일 세포가 포함되어 있습니다.
  3. 매번 10분 동안 500 x g 에서 원심분리하여 수집된 세포를 10mL의 PBS로 2x 세척합니다. 1.5mL 튜브에서 1mL의 FACS 완충액(2% FBS가 포함된 1x PBS)에 최종 세포 펠릿을 재현탁합니다.
  4. 명시야 현미경에서 혈구계를 사용하여 세포를 계수합니다. 세포 농도를 2 x 106 cells/mL로 조정합니다.

10. 유세포 분석 염색, 획득

  1. 유세포 분석을 위해 마우스 신장 조직에서 준비된 단일 세포 현탁액의 세포 농도를 2-3 x 106 cells/mL로 조정합니다.
  2. 650 x g 에서 5분 동안 원심분리하여 1.5mL 튜브의 세포를 펠렛화합니다. 세포 펠렛을 1mL의 FACS 완충액에 재현탁합니다.
  3. 1:200 희석으로 항-CD16/32 항체를 첨가하여 비특이적 Fc 수용체 결합을 차단합니다. 실온에서 15분 동안 세포를 배양합니다.
  4. Aqua Live/Dead 염료를 사용하여 제조업체의 지침에 따라 살아있는 세포와 죽은 세포를 구별하십시오.
  5. CD45-e450, CD11b-PE-Cy7, hCD59-PE 및 F4/80-BV605를 포함한 사전 접합 항체로 세포를 1:100 희석으로 염색합니다. 세포 현탁액에 항체 칵테일을 추가합니다.
  6. 광표백으로부터 형광단을 보호하기 위해 어두운 곳에서 4°C에서 30분 동안 샘플을 배양합니다. 650 x g 에서 5분 동안 원심분리하여 FACS 완충액(2% 소 태아 혈청이 함유된 PBS)으로 염색된 세포를 2x 세척합니다.
  7. 얼음 위에서 1% 파라포름알데히드(PFA)로 세포를 30분 동안 고정합니다. 고정 셀을 FACS 버퍼로 2회 세척하여 잔류 PFA를 제거합니다.
  8. 유세포 분석기를 사용하여 염색 및 고정 세포를 획득합니다. 소프트웨어를 사용하여 데이터를 분석합니다.
  9. 9에 설명된 바와 같이 마커 CD45, CD11b 및 F4/80을 사용하여 신장 및 기타 조직 상주 대식세포 및 미세아교세포를 식별합니다.
  10. 초기 게이팅을 수행하여 전방 산란(FSC) 및 측면 산란(SSC) 프로파일을 기반으로 살아 있는 세포를 선택합니다. 전방 산란 영역(FSC-A) 대 전방 산란 높이(FSC-H)에 대한 게이팅을 통해 이중선을 제거합니다. LIVE/DEAD 생존도 염료를 사용하여 죽은 세포를 제외합니다.
  11. CD45+ 집단에 게이팅을 통해 면역 세포를 강화합니다. 게이팅 전략에서 볼 수 있듯이 CD45+ 집단 내에서 CD11b+F4/80++ 세포로 신장 상주 대식세포를 정의합니다(그림 2A).
  12. 미세아교세포 집단을 CD11b+CD45iⁿt 세포로 정의합니다(그림 2B). 유세포분석기에서 데이터 수집을 수행합니다. 소프트웨어를 사용하여 최종 분석을 수행하여 유세포 분석 연구를 완료합니다.

결과

His-Tag 재조합 ILY의 정제는앞서 14에서 설명한 것과 동일한 프로토콜을 따랐습니다. ILY는 E. coli BL21(DE3) 세포에서 성공적으로 발현되었으며, Streptococcus intermedius의 ILY 유전자를 암호화하는 플라스미드로 형질전환되었습니다. IPTG를 유도한 결과, 표적 단백질의 과발현이 명백했습니다. 발현 후, ILY는 니켈-NTA 친화성 크로마토그래피를 사용하여...

토론

본 연구에서 His-tagged 재조합 ILY의 성공적인 발현, 정제 및 기능적 검증은 잘 확립된 프로토콜15을 따랐다. 그러나 이 과정에는 높은 단백질 수율, 순도 및 생물학적 활성을 보장하는 몇 가지 중요한 단계가 포함되었습니다. E. coli BL21(DE3) 세포의 IPTG 유도는 봉입체 형성을 최소화하면서 단백질 발현 수준의 균형을 맞추기 위?...

공개

저자들은 이 원고에 보고된 연구에 영향을 미칠 수 있는 경쟁적인 재정적 이해관계나 개인적 관계가 없음을 선언합니다. 재정적, 비재무적, 전문적 또는 개인적 제휴를 포함한 어떠한 이해 상충도 연구의 설계, 수행, 해석 또는 발표에 영향을 미치지 않았습니다.

감사의 말

우리는 이 연구에 사용된 프로토콜의 개발 및 개선에 기여한 Qin Lab의 전현직 구성원 모두에게 감사를 표합니다. 또한 이 연구에 중요한 역할을 한 재조합 ILY 플라스미드를 아낌없이 제공한 오클라호마 대학 보건 과학 센터의 R. K. Tweten 박사 그룹에도 감사드립니다. 이 연구는 NIH 5 P51OD011104-58, R01DK129881(X.Q.) 및 R21OD024931(X.Q.) 보조금을 통해 미국 국립보건원(NIH)의 지원을 받았습니다.

자료

NameCompanyCatalog NumberComments
0.45 µm syringe filterMilliporeSLHVR33RS
4-15% TGX Stain-Free Protein GelsBio-Rad4568084
6X Loading bufferFisher50-103-6570
70% EthanolWWR Life Science64-17-5
ACK (Ammonium-Chloride-Potassium) Lysing BufferGibcoA1049201
Affinity resin beadsMillipore69670
Ampicillin sodium solutionZymo ResearchA1001-5
Anti-CD11b-PE-Cy7 (Clone M1/70)Invitrogen25-0112-82
Anti-CD16/32 (FcγRIII/II, Clone 93)eBioscience48-0161-80
Anti-CD45-e450 (Clone 30-F11)eBioscience48-0451-82
Anti-F4/80-BV605(Clone BM8)BioLegend 123133
Anti-hCD59-PE (Clone OV9A2)Invitrogen12-0596-42
Aqua Live/Dead dyeInvitrogen    L34957A
Beads (resin)Millipore69670
Benzonase NucleaseMillipore70664-10KUN
BugBuster protein extraction reagentMillipore70584-4
Centrifuge for microtubesEppendorf5424
Centrifuge for tubesThermo Scientific75-001-241
Collagenase type IVWorthington Biochemical CorporationLS004188
Corn oilSigma AldrichC8267
Deoxyribonuclease (DNAse) IWorthington Biochemical CorporationLS002007
Detoxi-Gel resin columnMillipore69670
DPBS (Dulbecco’s phosphate-buffered saline) solutionCorning21-031-CV
EDTA tubesBD365974
FBS (Fetal bovine serum)Gibco10082-139
GlycerolFisherBP229-1
HBSS (Hank’s Ballanced Salt Solution)Gibco24020117
IPTG (Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside) Millipore-Sigma206-703-0
IsofluraneVET one502017
LB media
LSRFortessa flow cytometerBD Biosciences
MES [2-(N-morpholino) ethanesulfonic acid]Fisher50-488-796
MOPS [3-(N-morpholino) propanesulfonic acid]Fisher50-213-522
Percoll density gradient mediaCytiva17089101
Peristaltic pumpFisher ScientificDiscontinued now, use alternative
PFA (Paraformaldehyde)Thermo ScientificI28800
Purification columnMilliporeUFC900308
rLysozyme solutionNovagen20C71110
Shaking water bath Thermo ScientificTSSB15
Slide-A-Lyzer dialysis kitThermo66107
Sodium deoxycholateFisherBP349-100Fresh made or less than a month
Sterile cell strainer (40 μm)Fisher Scientific22-363-547
TamoxifenSigma Aldrich6734
Ultra centrifugal filterMilliporeUFC900308
Ultrapure waterThermo10977-015
Vortex mixerFisher Scientific2215365
β-ME (β-mercaptoethanol)FisherBP176-100

참고문헌

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