从新鲜和冷冻实体瘤标本中优化细胞核分离，用于多组学测序

随着我们对肿瘤生物学知识的不断加深，以及人们对了解肿瘤内细胞如何相互作用并影响患者预后复杂性的兴趣，分析肿瘤微环境中异质细胞的重要性也有所增加。多组测序允许以配对细胞方式从同一细胞获取单细胞 RNA 和攻击测序，为此取得了重大进展。然而，从这些实验中获得的数据的质量在很大程度上取决于实验条件和输入的生物材料的质量。

该协议提供了一种可靠且优化的方法，可使用 10x Genomics 平台从实体瘤标本中分离细胞核以进行多组测序。该方案使用新鲜或冷冻的单细胞悬浮液是可靠的。我们为组织解离条件、单细胞悬液的冷冻保存和分离细胞核的评估提供建议。

在该方案中，我们使用了人胰腺导管腺癌标本，这是我们实验室的主要组织类型。胰腺癌是一种高度纤维增生的肿瘤类型，预示着相对粘性的组织和细胞。此外，由于可用于研究的胰腺肿瘤标本也往往相对较小，因此努力最大限度地提高捕获的细胞数量。