אוטומציית סינון מיקרוסקופיה Cryo-Electron על פני רשתות מרובות באמצעות Smart Leginon

במרכז סימונס למיקרוסקופיית אלקטרונים, אנו שואפים לספק שירותי מיקרוסקופיית אלקטרונים מעולים, מומחיות והכשרה לחוקרים מקומיים וארציים, ולפתח שיטות חדשניות לייעול זרימות העבודה. ההיקף שלנו מכסה שירות, פיתוח, למידת מכונה ומחקר ביו-רפואי. אנחנו מנסים לענות, איך אנחנו יכולים לייעל טוב יותר את השירותים שלנו?

למידת מכונה משנה את תחום מיקרוסקופ האלקטרונים. איסוף הנתונים הופך לאוטומטי. כלי ניתוח נתונים הופכים במהירות ליעילים יותר.

זה כולל זיהוי תמונות, בחירת חלקיקים, ניתוח גמישות 3G ובניית מודלים. אנו מעדכנים תוכנה באופן קבוע כדי להתחשב במצבים שונים, כגון חורי רשת שונים, אוסף מוטה או באגים שזוהו באמצעות תוכנת בדיקת ביתא בסביבת הייצור שלנו. אנו גם משלבים משוב מהמשתמשים שלנו, כך שאנו מספקים ללא הרף תכונות שימושיות עבורם.

Smart Leginon מטפל במשימות עתירות עבודה וגוזלות זמן של סינון רשת אחת או יותר ב- cryoTEM. הוא מאפשר למפעילים ולחוקרים לסנן ולנתח רשתות במהירות רבה יותר, תוך פינוי זמן לייעול תנאי הרשת והדגימה במקביל. זה גם מפחית את זמן המיקרוסקופ ואת העלות.

המסך האוטומטי Smart Leginon מציע סינון מרובה רשתות ללא השגחה מלאה, שלוקח בערך 10 דקות להגדיר סינון עבור 12 רשתות. בהשוואה לסינון ידני, הפרוטוקול שלנו חוסך מספר שעות ביום. מאז כניסתה של Smart Leginon, פותחו תוכנות חופשיות ומסחריות אחרות עבור אוטומציה דומה.