Beta hücre biyolojisi grubu UMass diyabet Center of Excellence yararlı tavsiye ve tartışmalar için minnetle anıyoruz. İnsan pankreas adacıkları tarafından NIDDK tarafından finanse edilen entegre adacık dağıtım programı (IIDP) umut şehir temin edilmiştir. Bu eser NIH/NIDDK tarafından finanse edildi: R01-DK114686 (LCA), R01-DK105837 (CY), 2UC4DK098085 (IIDP) ve Amerikan Diyabet Derneği tarafından Amaranth sırasını ile işbirliği içinde #1-15-BS-003 (LCA) verin.

Hayvanları içeren tüm yordamları UMass tıbbi okul kurumsal hayvan bakım ve kullanım Komitesi tarafından kabul edildi. İnsan adacık çalışmalar UMass kurumsal İnceleme Kurulu tarafından insan denekler kullanımını karıştırmayın çünkü IRB gözden geçirme veya muafiyet için değil hak kazanmak için belirlenmiştir.
1. adacık yalıtım ve kültür
<ol><li>Adacıkları yalıtmak ve kendi seçtiğiniz yöntemi kullanarak ekzokrin ve duktal doku bulaşıcı ayrı. Not: Bu yöntem collagenase duktal üfleme ve Ficoll ayrılık12 (kemirgen) veya sonrası sevk irsaliyesi adacıkları entegre adacık dağıtım programı (IIDP13; insan) tarafından izole adacıkları kullanarak optimize edildi. Adacıkları P200 micropipette ile seçilmiş.</li>
	<li>Adacık morfoloji en iyi duruma getirmek için adacıkları gecede 10 mL tam adacık Orta (RPMI %10 FBS, penisilin/streptomisin ve 5.5 mmol/L glikoz) içeren % 5 CO2 37 ° C'de bir oksijen odasında kurtarmak izin Bu adımı bölümler elde etmek için gerekli değildir, ancak adacıkları sonra bir iyileşme döneminde daha sağlam (bkz. Şekil 2).</li>
</ol>2. adacık fiksasyon
<ol><li>Düşük-bağlama P200 ipucu kullanarak, bir kalibre edilmiş bir 1,5 mL düşük bağlama microfuge tüp içine bir stereomicroscope altında kullanılması yaklaşık 250 adacık eşdeğerleri (IEQ)13 futbolla. Düşük-bağlama ipuçları ve tüpler adacık kaybını azaltmak.</li>
	<li>Adacıkları microfuge tüp altına yerleşmek izin verir. Çoğu süpernatant ile herhangi bir adacıkları değil çıkarmak için dikkat çekici bir P200 damlalıklı ipucu kaldırın.</li>
	<li>PBS 1 mL ekleyin. Hızı 200 x g ulaşıncaya kadar sallanan bir kova santrifüj tüpü santrifüj kapasitesi ve spin durdurmak. Süpernatant kaldırın. PBS yıkama, iki yıkar toplam için yineleyin.</li>
	<li>500 µL % 10 formalin çözüm veya taze yapılmış % 4 paraformaldehyde ekleyin. Oda sıcaklığında 30 dakika boyunca düzeltmek. Bu yöntemde test edilen sonuçlar için bu fiksasyon Yöntemler ayırt edilemez. Daha kısa fiksasyon da mümkün olabilir; Bu fiksasyon süresi için istenen sonucu en iyi duruma getirmek için tavsiye edilir.</li>
	<li>Sabitleştirici P200 bahşiş ile kaldırın.</li>
	<li>PBS 1 mL ekleyin. Hızı 200 x g ulaşıncaya kadar tüp santrifüj kapasitesi ve spin durdurmak. Süpernatant kaldırın. PBS yıkama, iki yıkar toplam için yineleyin.</li>
	<li>Hemen bir sonraki adıma geçin.</li>
</ol>3. adacık disk (Şekil 1) hazırlanması
<ol><li>İlk kullanımda, 70 ° c (Örneğin, Histogel) jel eritin ve aliquots 1.5 mL microfuge tüpler uzun süreli depolama için yapmak. Aliquots yeniden kullanılmış olabilir bu yana aliquot birim önemli değildir.</li>
	<li>70 ° c (örnek başına yaklaşık 100 µL) jel microfuge tüp jel aliquot 70 ° C'ye ayarla ısı taşını içeren yerleştirerek sıcak</li>
	<li>Özel mavi boncuk (her örnek için 10 µL) 1,5 mL temiz microfuge tüp içine aktarın. İyice boncuk pipetting önce resuspend. Not: Mavi boncuk özel düğme ve parafin blok katıştırılmış malzemenin görsel tanımlama yardımcı olan adacıkları ile karıştırılır. Mavi boncuk kullanılan sayısı sonucu için kritik değildir, ancak aşırı boncuk önlemek (> 5 x adacıkları sayısı) adacıkları bölümlerde en uygun dağıtımına olanak tanımak için.</li>
	<li>Mavi boncuk ile 1 mL PBS, iki kez yıkayın. Her yıkama için boncuk vasıl 800 x g 1 dk spin. Sonra ikinci yıkama, x 10 µL PBS, burada n örnek tüpler sayısıdır (n+ 2) boncuk resuspend; Örneğin, 2 örnek tüpler için 40 µL boncuk için eklemek için PBS birim olacaktır.</li>
	<li>Adacıkları (200 x g için kısa spin) içeren microfuge tüp santrifüj kapasitesi ve süpernatant çoğunu kaldırın. 10 µL micropipette İpucu İpucu off makas ya da bıçak ile kesme ve her örnek için temiz bir ipucu kullanarak her adacık tüp boncuk 10 µL ekleyin. (Adacıkları kaybetmemek için) birlikte kullanmayın.</li>
	<li>Adacıkları ve boncuk (200 x g için kısa spin) santrifüj kapasitesi. Bir kesilmemiş 10 µL micropipette ucu ile mümkün olduğu kadar PBS kaldırın.</li>
	<li>Mikroskop slayt örnek kimliği için etiket. İki ya da üç örnekleri her slaytta hazırlanabilir. Yer ısıtılan jel ile ısı blok yakındaki bankta slayt. 3-5 İpuçları 20 µL düşük bağlama micropipette ipuçları bir jilet veya makas ile örnek başına kesti. İki P20 Mikropipetler birinden diğerine geçiş hızlı izin vermek için kesme ipuçları ile yükleyin.</li>
	<li>İlk micropipette kullanarak, 15-20 µL sıcak jel adacıkları/boncuk microfuge tüp ekleyin; Hemen mix, bubbles kaçınmak; ve forma slayt sıvı agar/adacıkları/boncuk karışımı uygulamak bir < 1 cm çapında yuvarlak yüzey. Dış jel yüzük için alan bırakarak slaydın kenarına yakın belgili tanımlık yuvarlak yüzey yer (sonraki adım). Slayt adacıkları ve boncuk yerleşmek için bir kaç kez hafifçe dokunun.</li>
	<li>İkinci bir micropipette kullanarak, sıcak jel 20 µL örnek tüp ekleyin. İlk micropipette, mix yeni jel kuvvetlendirmek başlarsa ısı bloğunda yeniden ısınma herhangi bir kalan adacıkları/boncuk ile kullanarak bu karışımı orijinal disk çevreleyen Slayta Uygula. Gerektiğinde ek önceden kesilmiş ipuçları, disk istenen boyutu ve kalınlığı kadar kullanarak yineleyin. Not: dış halka biraz daha kalın ise genellikle disk kullanımı kolaydır. Genellikle, 3 x 20 µL jel yeterli olur. Bu adım tüp yıkama tarafından adacıkları kaybı en aza indirir ve adacık-yoksul özel disk işleme kolaylaştırmak için disk dışarı doğru ekler.</li>
	<li>Tek tek her diski hazırlamak ve dikkatli örnek sipariş çoklu diskler her slayta yerleştirerek Eğer takip.</li>
	<li>10 dakika veya jel katılaşır kadar düz bir yüzeye bir kapak ile ıslak buz slaytları yerleştirin. O kurur Eğer kapalı cam disk slayt daha zordur.</li>
	<li>Etiket biyopsi işleme/doku kaset kalem, örnek başına bir ile gömme. Mavi kağıt ıslatma önlemek için slaytın arkasına kuru.</li>
	<li>Künt kenarına bir jilet kullanarak, yavaşça diski camı ücretsiz için her yönde itin. Kolayca slayt, yavaş yavaş disk mavi doku kağıt üzerine mikroskop slayttan itin. Diski, düz tarafı, doğrudan kağıt üzerine yerleştirin.</li>
	<li>Belgili tanımlık yuvarlak yüzey düz tutmak, hareket önlemek, katlanmış kağıt kasedi diski yerleştirin ve kaseti kapatmak için diskin çevresinde kağıt katlama. Belgili tanımlık yuvarlak yüzey temiz bir şekilde cam slayt değil, daha fazla jel eklemek ve/veya bir kaç dakika daha buz slayt dönmek.</li>
	<li>PBS bir ölçek kasete daldırın. Aynı gün için en uygun morfoloji katıştırma parafin işlemde.</li>
</ol>4. parafin katıştırma
Not: İşlem adacık jel parafin blok aşağıda açıklandığı gibi bir kısaltılmış dehidratasyon serisi kullanarak diskleri. Bu teknik bir otomatik işlemci kullanarak optimize edildi, ancak el ile işleme benzer sonuçlar üretmesi gerekir.
<ol><li>Kaset % 85 etanol içinde 15 dakika bırakın.</li>
	<li>Kaset % 95 etanol içinde 15 dakika bırakın.</li>
	<li>Kaset % 100 etanol içinde 15 dakika bırakın. Toplamda üç yıkama için iki kez tekrarlayın.</li>
	<li>Kaset ksilen içinde 15 dakika bırakın. Toplamda üç yıkama için iki kez tekrarlayın.</li>
	<li>Kaset içinde erimiş parafin 10 dakika bırakın.</li>
	<li>Kaset için taze erimiş parafin 10-30 dakika aktarın.</li>
	<li>Dikkatle kaset açın ve mavi kağıt paketini açmak. Edildi karşı düz kağıdın yüzeye takip edilmesi jel diski çıkarın. Disk aşağı, paralel olarak kesme yüzeyi düz (adacık içeren) yüzeyi ile küçük bir kalıp içine embed. Fişi için dikkatle kaset kaldırmak ve doğru kesme yüzeyi işaret ucu küçük bir kalıp içine embed.</li>
</ol>5. parafin kesit ve boyama
<ol><li>Seri bölümler gerekiyorsa slaytlar ardışık olarak etiketleyin.</li>
	<li>Deneyimli bir histotechnologist tarafından kesilmiş 5 µm parafin bölümü vardır. Verimi en üst düzeye çıkarmak için malzeme içeren tüm bölümler kaydedin. Genel olarak, 20 bölüm toplama malzeme çoğunun yakalama sağlar.</li>
	<li>Bölümler, oda sıcaklığında saklayın. Bölümler rutin histolojik lekeleri (örn., H & E) ve (Örneğin, insülin, glukagon ve DAPI) ayirt mükellef bulunmaktadır. Fiksasyon diğer antijenleri için optimize.</li>
</ol>

<ol>
	<li>Kim, A., Miller, K., Jo, J., Kilimnik, G., Wojcik, P., Hara, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Islet+architecture:+A+comparative+study.">Islet architecture: A comparative study.</a> Islets. 1 (2), 129-136 (2009).</li><li>Steiner, D. J., Kim, A., Miller, K., Hara, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Pancreatic+islet+plasticity:+Interspecies+comparison+of+islet+architecture+and+composition.">Pancreatic islet plasticity: Interspecies comparison of islet architecture and composition.</a> Islets. 2 (3), 135-145 (2010).</li><li>Campbell-Thompson, M. L., Heiple, T., Montgomery, E., Zhang, L., Schneider, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Staining+protocols+for+human+pancreatic+islets.">Staining protocols for human pancreatic islets.</a> Journal of Visualized Experiments. (63), (2012).</li><li>Da Silva Xavier, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Cells+of+the+Islets+of+Langerhans.">The Cells of the Islets of Langerhans.</a> Journal of Clinical Medicine. 7 (3), (2018).</li><li>Sharma, R. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Insulin+demand+regulates+&#946;+cell+number+via+the+unfolded+protein+response.">Insulin demand regulates &#946; cell number via the unfolded protein response.</a> The Journal of Clinical Investigation. 125 (10), 3831-3846 (2015).</li><li>Stamateris, R. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glucose+Induces+Mouse+&#946;-Cell+Proliferation+via+IRS2,+MTOR,+and+Cyclin+D2+but+Not+the+Insulin+Receptor.">Glucose Induces Mouse &#946;-Cell Proliferation via IRS2, MTOR, and Cyclin D2 but Not the Insulin Receptor.</a> Diabetes. 65 (4), 981-995 (2016).</li><li>Blodgett, D. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Novel+observations+from+next-generation+rna+sequencing+of+highly+purified+human+adult+and+fetal+islet+cell+subsets.">Novel observations from next-generation rna sequencing of highly purified human adult and fetal islet cell subsets.</a> Diabetes. 64 (9), 3172-3181 (2015).</li><li>Brissova, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Assessment+of+human+pancreatic+islet+architecture+and+composition+by+laser+scanning+confocal+microscopy.">Assessment of human pancreatic islet architecture and composition by laser scanning confocal microscopy.</a> Journal of Histochemistry &amp; Cytochemistry. 53 (9), 1087-1097 (2005).</li><li>Joiner, K. S., Spangler, E. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evaluation+of+HistoGelTM-embedded+specimens+for+use+in+veterinary+diagnostic+pathology.">Evaluation of HistoGelTM-embedded specimens for use in veterinary diagnostic pathology.</a> Journal of Veterinary Diagnostic Investigation: Official Publication of the American Association of Veterinary Laboratory Diagnosticians, Inc. 24 (4), 710-715 (2012).</li><li>Cozar-Castellano, I., Takane, K. K., Bottino, R., Balamurugan, A. N., Stewart, A. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Induction+of+beta-cell+proliferation+and+retinoblastoma+protein+phosphorylation+in+rat+and+human+islets+using+adenovirus-mediated+transfer+of+cyclin-dependent+kinase-4+and+cyclin+D1.">Induction of beta-cell proliferation and retinoblastoma protein phosphorylation in rat and human islets using adenovirus-mediated transfer of cyclin-dependent kinase-4 and cyclin D1.</a> Diabetes. 53 (1), 149-159 (2004).</li><li>La Fortune, K. A., Randolph, M. L., Wu, H. H., Cramer, H. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Improvements+in+cell+block+processing:+The+Cell-Gel+method.">Improvements in cell block processing: The Cell-Gel method.</a> Cancer Cytopathology. 125 (4), 267-276 (2017).</li><li>Alonso, L. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glucose+infusion+in+mice:+A+new+model+to+induce+beta-cell+replication.">Glucose infusion in mice: A new model to induce beta-cell replication.</a> Diabetes. 56 (7), 1792-1801 (2007).</li></ol>

Yazarlar hiçbir bildirmek için çıkar çatışması var.

Değiştirilen Bu jel disk tabanlı Gömme yöntemi basit, ucuz ve yüksek bir verim adacıklar bölüm başına oluşturmak için verimli şekilde sağlar. Jel disk düz cam yüzey üzerinde inşa bile bir dağıtım Yayilim adacıkları iyi tanımlanmış bir alana kolaylaştırır. Düz a yuvarlak yüzey içinde adacıkları yayılan birçok adacıkları bölüm düzlemde yerleştirerek, verim en iyi duruma getirme ve daha az adacıkları kullanılmak üzere izin avantajı sunuyor. Disk kalınlığı müfettişler iht...

Pankreas adacıkları of Langerhans, insülin, dolaşan tek kaynağı diyabet eğitim araştırmacılar için kritik bir doku bulunur. Verilen herhangi bir organizma adacıkları değişken boyutu, hücre türü frekans ve mimari1,2,3var. Vivo yapısı ve endokrin hücre kompozisyon pankreas adacıkları çalışmaya geleneksel pankreas dokusu4,5kesit tarafından stratejisidir. Bu yana adacıkları toplam pankreas hücresel içeriği yalnızca küçük bir kısmını oluşturan, Moleküler çalışmalar izole adacıkları üzerinde gerçekleştirilir. Ex vivo adacık kültür deneyler, besin tepki testi gen modülasyon (transfection, iletim) veya deneysel tedaviler endokrin hücre hayatta kalma, yayılması ve işlev oransal mekanizmaları içine önemli fikir sağlamak 5 , 6.
Ex vivo adacık deneyler kez bütün adacıklar Moleküler çalışmalar veya histolojik veya moleküler çalışmalar monolayer5,6' yetiştirilen dağınık adacık hücre kullanarak analiz edilir. Moleküler analiz bütün adacıklar ciddi uyarı ne zaman herhangi bir tek hücre türüne yaygınlaştırılması yanlış pozitif veya yanlış negatif sonuçlar doğurabilir intermixing hücre tiplerinin tanıtır. Hücre dağılımı sonrası kültür mikroskobu için coverslips üzerine hücre türüne özgü sonucu ölçüm verir, ancak yanıt-e doğru müdahale değiştirebilir ve mimari ile ilgili sonuçları tanımlaması engellemektedir adacık mimari bozan. Ayrıca, genellikle sadece tek bir sonuç ölçülebilir; Örneğin, beta hücre çoğalması ve beta hücre ölümü aynı koşullar altında ölçmek için iki ayrı deney gerçekleştirilmesi gerekir. Bu yaklaşımlar da arası adacık değişkenliği, bir alandaki artan ilgi alanı için kör vardır. Sıralama adacık hücreleri tarafından akış sitometresi hücre türüne özgü Moleküler çalışmalar veya tek hücre RNA çalışmaları için pahalı, zaman alıcı, limited tarafından doku bolluk, mimari ortadan kaldırılması ve rutin hücre kültür analizleri için uygun değil ama zarif 5 , 7. bütün-mount immunostained adacıklar confocal görüntüleme yüksek kalite mimari sağlam veri sağlar, ancak emek yoğun ve veri her örnekten elde edilen sonuçlara tek immunostaining8' olarak tanımlanabilir sınırlıdır.
Yüksek kalitede parafin kesitler sonrası kültür bütün adacıklar oluşturma yeteneği bu endişeleri çoğuna hitap. Yüksek maliyetli, düşük-bereket adacık doku benzersiz genetik modellerini veya insan organ bağış ya da adacıkları durum sonrası içinde VIVO veya vitro deneysel manipülasyon, değerli bulunur. Birden fazla parafin kesitler aynı adacıkları alma aynı deneyi üzerinden birden çok hücre türüne özgü, bozulmamış mimari analizleri sağlayacak.
Adacık granül kesit için oluşturmak için varolan kusurlu tekniklerdir. Histoloji optimize edilmiş özel işlem9' a zor olan küçük ya da parçalanmış doku örnekleri de dahil olmak üzere histolojik ve saytolojik örnekleri işlenirken kullanılan bir sulu düşük erime noktası jel olan. Bir adacık yaklaşım katıştırma adacıkları özel bir microcentrifuge tüp içinde askıya alma, malzeme cips, agar fiş almak sonra işlemek ve10,11kesit için embed için santrifüj kapasitesi etmektir. Katılaşmış örnek tüp alttan zaman alıcı ve zor, önde gelen örnek zaman zaman parçalanma ve kişisel yaralanma riski işlemdir. Adacıkları yetersiz adacık dağıtım bölümlerde bu yöntem elde edilen önde gelen fiş ipucunda yoğunlaşmıştır. Öyle ki bir adacık-yoksul bölgesi kesit için sunulabilir katıştırma fiş yuvarlak alt zorlaştırmaktadır. Genel olarak, bu yöntem düşük verim ve elde edilen bölümlerinde olmalı adacık dağıtım yol açar.
Bu yeni yöntem adacık bölümleri hazırlanması için Basitleştirilmiş ve geliştirilmiş bir yaklaşımdır. Adacıklar içinde küçük bir birim konsantre ve daha sonra tek bir düzlemde adacıkları ile küçük bir disk oluşturmak için mikroskop slayt pürüzsüz yüzeyi yerleştirilir. Histogel-adacık disk daha sonra kısaltılmış dehidratasyon ve Ksilen infiltrasyon Protokolü katıştırma parafin için işlenir. Microfuge tüp dibinde adacıkları konsantreleri, önceki yaklaşım, aynı zamanda bir karşılaştırma olarak yapılır. Bu yeni teknik adacıkları bölüm, her bölümde adacıkları dağıtımını başına verimi artırır ve adacık blok kaset aktarmak için daha az zaman alır. Bu teknik adacık biyologlar için yararlıdır veya yerel doku yapısı tek bir örneğinde birden çok sonuçlar ölçerek düşük-bereket dokusunun üretken en üst düzeye çıkarmak isteyen doku parçaları okuyan diğer bilim adamları kullanın.

<table>
	<tbody>
		<tr>
			<td>1.5 mL Eppendorf tube</td>
			<td>Norgen Bioteck Corp</td>
			<td>P/N 10113&#160;</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ranin Classic Starter Kit</td>
			<td>ShopRanin</td>
			<td>17008708</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ranin ClassicPipette PR-2</td>
			<td>ShopRanin</td>
			<td>17008648</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Low Binding Tip (1000 &#956;L)</td>
			<td>Genesee Scientific</td>
			<td>24-430</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Low Binding Tip (200 &#956;L)</td>
			<td>Genesee Scientific</td>
			<td>24-412</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Low Binding Tip (20 &#956;L)</td>
			<td>Genesee Scientific</td>
			<td>24-404</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Low Binding Tip (10 &#956;L)</td>
			<td>Genesee Scientific</td>
			<td>24-401</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>10% Formalin solution</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>HT501128</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Paraformaldehyde</td>
			<td>Electron Microscopy Sciences</td>
			<td>15710-S</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Heatblock</td>
			<td>VWR</td>
			<td>949312</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>HistoGel</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>HG-4000-012</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Agarose blue beads- Affi-gel</td>
			<td>Bio-Rad</td>
			<td>153-7301</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dulbecco&#39;s PBS</td>
			<td>Life technologies</td>
			<td>14190-144</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tissue processing cassette</td>
			<td>Simport</td>
			<td>M492-10</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bio-Wraps</td>
			<td>Leica-Surgipath</td>
			<td>3801090</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Citadel 2000 tissue processor</td>
			<td>Thermo-Shandon LLC</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ethanol 200 proof</td>
			<td>Decon Laboratories, INC</td>
			<td>2701</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Xylene</td>
			<td>Fisher Chemical</td>
			<td>X5SK-4</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Paraffin</td>
			<td>McCormick Scientific</td>
			<td>39503002</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microtome</td>
			<td>Thermo-Shandon LLC</td>
			<td>Finesse ME+</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Insulin antibody</td>
			<td>DAKO</td>
			<td>A0564</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glucagon antibody</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>G2654</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fluoroshield with DAPI</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>F6057</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Alex fluor 594 secondary antibodies</td>
			<td>Life technologies</td>
			<td>A11076</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Alex fluor 488 secondary antibodies</td>
			<td>Life technologies</td>
			<td>A11001</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

pancreatic islet embedding for paraffin sections

İzole pankreas adacıkları kullanarak deneyler diyabet araştırma için önemlidir, ama adacıkları pahalı ve sınırlı bolluğu. Adacıkları karma hücre nüfus işlevi etkiler bir yapısal mimarisi içerir, ve insan adacıkları yaygın değişken hücre türü kompozisyon. Kültürlü adacıkları eğitim için geçerli sık kullanılan yöntemleri Moleküler çalışmalar bütün adacıkları, topaklanmasını farklı adacık hücre tipleri birlikte, veya mikroskopi veya adacık mimari engellemeden Moleküler çalışmalar dağınık adacık hücreleri üzerinde gerçekleştirilen içerir. Vivo adacık çalışmaları için parafin gömülü pankreas kesit yerel pankreas ortamında hücre özel sonuçları değerlendirmek için bir güçlü tekniktir. Eğitim sonrası kültür adacıkları parafin kesit tarafından çeşitli avantajları sunmak: birden çok sonuçlar aynı adacıkları (seri bölümleri kullanarak potansiyel olarak bile tam olarak aynı adacıkları,), hücre türüne özgü ölçümleri ve bakımı yerli tespiti adacık hücre-hücre ve hücre-terkedilemeyen etkileşimleri deneysel pozlama sırasında ve analiz için. Ancak, katıştırma için varolan teknikleri sonrası kültür verimsiz, zaman alıcı, malzeme kaybı eğilimli ve genellikle sonuçları miktarının için yararlı olması için yetersiz adacık numaraları bölümlerle üreten adacıkları izole. Klinik patoloji laboratuvar hücre block hazırlama olanakları ulaşılmaz ve temel araştırma laboratuarlar için pratik. Bölümleri sağlam verim ve dağıtım adacıklar oluşturur bir geliştirilmiş, Basitleştirilmiş tezgah üstü yöntem geliştirdik. Sabit adacıkları sıcak histolojik özel jel resuspended ve bir standart cam slayt üzerinde düz bir disk içine adacıkları bir düzlemde dağıtılır öyle ki pipetted. Standart su kaybı ve katıştırma sonra birden çok (10 +) 4-5 µm bölüm aynı adacık bloğundan kesilebilir. Bu yöntemi kullanarak, histolojik ve immünfloresan analizleri fare, sıçan ve insan adacıkları üzerinde gerçekleştirilebilir. Bu kültürlü adacıkları gelen hücre türüne özgü, bozulmamış mimari sonuçlar değerlendirmek için etkili, ucuz, zaman kazandıran yaklaşımıdır.

Jel disk hazırlamak için adımlar resimli bir şematik resim 1' de gösterilen. Bu jel disk yöntemi sonuçları sonuçlar anlamlı miktar izin vermek için tek bir düzlemde dağıtılmış adacıkları yeterli sayıda içeren parafin bölümlerde yer. Şekil 2 bölüm başına yakalanan adacıkları sayısını göstermek için elde edilen bölümlerin düşük-büyütme görüntüleri gösterir. Genel olarak, > 35 adacıklar...

Watch this Scientific Journal Video about Pancreatic Islet Embedding for Paraffin Sections at JoVE.com

Pancreatic Islet Embedding for Paraffin Sections

Ex vivo pankreas adacık çalışmalar diyabet araştırma için önemlidir. Onların yerli 3 boyutlu mimari kültürlü adacıkları çalışmaya varolan zaman alıcı, verimsiz ve az kullanılan tekniklerdir. Bu eser bütün kültürlü adacıkları yüksek kalitede parafin bölümleri oluşturmak için yeni, basit ve etkili bir yöntem açıklanır.

Pankreas adacık parafin kesitler için katıştırma

Experiments using isolated pancreatic islets are important for diabetes research, but islets are expensive and of limited abundance. Islets contain a ...

pancreatic-islet-embedding-for-paraffin-sections

Universidad de Cartagena UDEC

Research

JoVE Journal

Biology

12.7K Görüntüleme.  UMass Medical School. Ex vivo pankreas adacık çalışmalar diyabet araştırma için önemlidir. Onların yerli 3 boyutlu mimari kültürlü adacıkları çalışmaya varolan zaman alıcı, verimsiz ve az kullanılan tekniklerdir. Bu eser bütün kültürlü adacıkları yüksek kalitede parafin bölümleri oluşturmak için yeni, basit ve etkili bir yöntem açıklanır.

Video: Pancreatic Islet Embedding for Paraffin Sections

Murine Pancreatic Islet Isolation

Murin Pankreas Adacık İzolasyonu

Biyoloji

Immunohistochemistry: Paraffin Sections Using the Vectastain ABC Kit from Vector Labs

Immunohistochemistry (IHC) is a valuable technique utilized to localize/visualize protein expression in a mounted tissue section using specific antibodies. There are two methods: the direct and indirect method. In this experiment, we will only describe the use of indirect IHC staining. Indirect IHC staining utilizes highly specific primary and biotin-conjugated secondary antibodies. Primary antibodies are utilized to discretely identify proteins of interest by binding to a specific epitope, while secondary antibodies subtract for non-specific background staining and amplify signal by forming complexes to the primary antibody. Slides can either be generated from frozen sections, or paraffin embedded sections mounted on glass slides. In this protocol, we discuss the preparation of paraffin-embedded sections by dewaxing, hydration using an alcohol gradient, heat induced antigen retrieval, and blocking of endogenous peroxidase activity and non-specific binding sites. Some sections are then stained with antibodies specific for T cell marker CD8 and while others are stained for tyrosine hydroxylase. The slides are subsequently treated with appropriate secondary antibodies conjugated to biotin, then developed utilizing avidin-conjugated horseradish peroxidase (HRP) with Diaminiobenzidine (DAB) as substrate. Following development, the slides are counterstained for contrast, and mounted under coverslips with permount. After adequate drying, these slides are then ready for imaging.

İmmünohistokimya: Parafin Bölüm Vektör Labs Vectastain ABC Seti

Immunohistochemistry (IHC) is a valuable technique utilized to localize/visualize protein expression in a mounted tissue section using specific ...

Immunohistochemistry on Paraffin Sections of Mouse Epidermis Using Fluorescent Antibodies

In the epidermis, immunohistochemistry is an efficient means of localizing specific proteins to their relative expression compartment; namely the basal, suprabasal, and stratum corneum layers. The precise localization within the epidermis of a particular protein lends clues toward its functional role within the epidermis. In this chapter, we describe a reliable method for immunolocalization within the epidermis modified for both frozen and paraffin sections that we use very routinely in our laboratory. Paraffin sections generally provide much better morphology, hence, superior results and photographs; however, not all antibodies will work with the harsh fixation and treatment involved in their processing. Therefore, the protocol for frozen sectioning is also included. Within paraffin sectioning, two fixation protocols are described (Bouin's and paraformaldehyde); the choice of fixative will be directly related to the antibody specifications and may require another fixing method.

We describe a reliable method for immunolocalization within the epidermis modified for both frozen and paraffin sections that we use very routinely in our laboratory.

Floresan Antikorlar Fare Epidermis Parafin Bölüm İmmünohistokimya

In the epidermis, immunohistochemistry is an efficient means of localizing specific proteins to their relative expression compartment; namely the basal, ...

Human Pancreatic Islet Isolation: Part I: Digestion and Collection of Pancreatic Tissue

Management of Type 1 diabetes is burdensome, both to the individual and society, costing over 100 billion dollars annually. Despite the widespread use of glucose monitoring and new insulin formulations, many individuals still develop devastating secondary complications. Pancreatic islet transplantation can restore near normal glucose control in diabetic patients 1, without the risk of serious hypoglycemic episodes that are associated with intensive insulin therapy. Providing sufficient islet mass is important for successful islet transplantation. However, donor characteristic, organ procurement and preservation affect the isolation outcome 2. At University of Illinois at Chicago (UIC) we have developed a successful isolation protocol with an improved purification gradient 3. The program started in January 2004, and more than 300 isolations were performed up to November 2008. The pancreata were sent in cold preservation solutions (UW, University of Wisconsin or HTK, Histidine-Tryptophan Ketoglutarate) 4-7 to the Cell Isolation Laboratory at UIC for islet isolation. Pancreatic islets were isolated using the UIC method, which is a modified version of the method originally described by Ricordi et al 8. Briefly, after cleaning the pancreas from the surrounding tissue, it was perfused with enzyme solution (Serva Collagenase + Neutral Protease or Sigma V enzyme). The distended pancreas was then transferred to the Ricordi digestion chamber, connected to a modified, closed circulation tubing system, and warmed up to 37&deg;C. During the digestion, the chamber was shaken gently. Samples were taken continuously to monitor the digestion progress. Once free islets were detected under the microscope, the digestion was stopped by flushing cold (4&deg;C) RPMI dilution solution (Mediatech, Herndon, VA) into the circulation system to dilute the enzyme. After being collected and washed in M199 media supplemented with human albumin, the tissue was sampled for pre-purification count and incubated with UW solution before purification. Purification process will be described in Part II: Purification and Culture of Human Islets.

Achieving high quality and appropriate quantity of human islets is one of the prominent prerequisites for successful islet transplantation. In this video, we describe step by step the procedures for human pancreatic islet isolation (part I: digestion and collection of pancreatic tissue) using a modified automated method.

İnsan Pankreas Adacık İzolasyonu: Bölüm I: Sindirim ve Pankreas Doku Koleksiyon

Management of Type 1 diabetes is burdensome, both to the individual and society, costing over 100 billion dollars annually. Despite the widespread use of ...

Human Pancreatic Islet Isolation: Part II: Purification and Culture of Human Islets

Management of Type 1 diabetes is burdensome, both to the individual and society, costing over 100 billion dollars annually. Despite the widespread use of glucose monitoring and new insulin formulations, many individuals still develop devastating secondary complications. Pancreatic islet transplantation can restore near normal glucose control in diabetic patients 1, without the risk of serious hypoglycemic episodes that are associated with intensive insulin therapy. Providing sufficient islet mass is important for successful islet transplantation. However, donor characteristics, organ procurement and preservation affect the isolation outcome 2. At University of Illinois at Chicago (UIC) we developed a successful isolation protocol with an improved purification gradient 3. The program started in January 2004 and more than 300 isolations were performed up to November 2008. The pancreata were sent in cold preservation solutions (UW, University of Wisconsin or HTK, Histidine-Tryptophan Ketoglutarate) 4-7 to the Cell Isolation Laboratory at UIC for islet isolation. Pancreatic islets were isolated using the UIC method, which is a modified version of the method originally described by Ricordi et al 8. As described in Part I: Digestion and Collection of Pancreatic Tissue, human pancreas was trimmed, cannulated, perfused, and digested. After collection and at least 30 minutes of incubation in UW solution, the tissue was loaded in the cell separator (COBE 2991, Cobe, Lakewood, CO) for purification 3. Following purification, islet yield (expressed as islet equivalents, IEQ), tissue volume, and purity was determined according to standard methods 9. Isolated islets were cultured in CMRL-1066 media (Mediatech, Herndon, VA), supplemented with 1.5% human albumin, 0.1% insulin-transferrin-selenium (ITS), 1 ml of Ciprofloxacin, 5 ml o f 1M HEPES, and 14.5 ml of 7.5% Sodium Bicarbonate in T175 flasks at 37&deg;C overnight culture before islets were transplanted or used for research.

Achieving high quality and appropriate quantity of human islets is one of the prominent prerequisites for successful islet transplantation. In this video, we describe step by step the procedures for human pancreatic islet isolation (part II: purification and culture of human islets) using a modified automated method.

İnsan Pankreas Adacık İzolasyonu: Bölüm II: İnsan Islets saflaştırılması ve Kültür

Paraffin-Embedded and Frozen Sections of Drosophila Adult Muscles

The molecular characterization of muscular dystrophies and myopathies in humans has revealed the complexity of muscle disease and genetic analysis of muscle specification, formation and function in model systems has provided valuable insight into muscle physiology. Therefore, identifying and characterizing molecular mechanisms that underlie muscle damage is critical. The structure of adult Drosophila multi-fiber muscles resemble vertebrate striated muscles 1 and the genetic tractability of Drosophila has made it a great system to analyze dystrophic muscle morphology and characterize the processes affecting muscular function in ageing adult flies 2. Here we present the histological technique for preparing paraffin-embedded and frozen sections of Drosophila thoracic muscles. These preparations allow for the tissue to be stained with classical histological stains and labeled with protein detecting dyes, and specifically cryosections are ideal for immunohistochemical detection of proteins in intact muscles. This allows for analysis of muscle tissue structure, identification of morphological defects, and detection of the expression pattern for muscle/neuron-specific proteins in Drosophila adult muscles. These techniques can also be slightly modified for sectioning of other body parts.

Paraffin-Embedded and Frozen Sections of Drosophila Adult Muscles

Identification of mechanisms underlying muscle damage is crucial. Here we present the histological technique for preparing paraffin-embedded and frozen sections of Drosophila thoracic muscles. This allows analysis of muscle morphology and localization of protein and other muscle cell components.

Parafin ve Dondurulmuş Bölüm Drosophila Yetişkin Kaslar

The molecular characterization of muscular dystrophies and myopathies in humans has revealed the complexity of muscle disease and genetic analysis of ...

Computer-assisted Large-scale Visualization and Quantification of Pancreatic Islet Mass, Size Distribution and Architecture

The pancreatic islet is a unique micro-organ composed of several hormone secreting endocrine cells such as beta-cells (insulin), alpha-cells (glucagon), and delta-cells (somatostatin) that are embedded in the exocrine tissues and comprise 1-2% of the entire pancreas. There is a close correlation between body and pancreas weight. Total beta-cell mass also increases proportionately to compensate for the demand for insulin in the body. What escapes this proportionate expansion is the size distribution of islets. Large animals such as humans share similar islet size distributions with mice, suggesting that this micro-organ has a certain size limit to be functional. The inability of large animal pancreata to generate proportionately larger islets is compensated for by an increase in the number of islets and by an increase in the proportion of larger islets in their overall islet size distribution. Furthermore, islets exhibit a striking plasticity in cellular composition and architecture among different species and also within the same species under various pathophysiological conditions. In the present study, we describe novel approaches for the analysis of biological image data in order to facilitate the automation of analytic processes, which allow for the analysis of large and heterogeneous data collections in the study of such dynamic biological processes and complex structures. Such studies have been hampered due to technical difficulties of unbiased sampling and generating large-scale data sets to precisely capture the complexity of biological processes of islet biology. Here we show methods to collect unbiased "representative" data within the limited availability of samples (or to minimize the sample collection) and the standard experimental settings, and to precisely analyze the complex three-dimensional structure of the islet. Computer-assisted automation allows for the collection and analysis of large-scale data sets and also assures unbiased interpretation of the data. Furthermore, the precise quantification of islet size distribution and spatial coordinates (i.e. X, Y, Z-positions) not only leads to an accurate visualization of pancreatic islet structure and composition, but also allows us to identify patterns during development and adaptation to altering conditions through mathematical modeling. The methods developed in this study are applicable to studies of many other systems and organisms as well.

Novel computer-assisted methods of large-scale procurement and analysis of immunohistochemically stained pancreatic specimens are described: (1) Virtual Slice capture of the entire section; (2) Mass analysis of large-scale data; (3) Reconstruction of 2D Virtual Slices; (4) 3D islet mapping; and (5) Mathematical analysis.

Bilgisayar destekli Büyük ölçekli Görselleştirme ve Pankreas Adacık Kütle, Boyut Dağılımı ve Mimarlık Niceleme

The pancreatic islet is a unique micro-organ composed of several hormone secreting endocrine cells such as beta-cells (insulin), alpha-cells (glucagon), ...

Yeast Colony Embedding Method

Patterning of different cell types in embryos is a key mechanism in metazoan development. Communities of microorganisms, such as colonies and biofilms also display patterns of cell types. For example, in the yeast S. cerevisiae, sporulated cells and pseudohyphal cells are not uniformly distributed in colonies. The functional importance of patterning and the molecular mechanisms that underlie these patterns are still poorly understood.
One challenge with respect to investigating patterns of cell types in fungal colonies is that unlike metazoan tissue, cells in colonies are relatively weakly attached to one another. In particular, fungal colonies do not contain the same extensive level of extracellular matrix found in most tissues . Here we report on a method for embedding and sectioning yeast colonies that reveals the interior patterns of cell types in these colonies. The method can be used to prepare thick sections (0.5 &mu;) useful for light microscopy and thin sections (0.1 &mu;) suitable for transmission electron microscopy. Asci and pseudohyphal cells can easily be distinguished from ovoid yeast cells by light microscopy , while the interior structure of these cells can be visualized by EM.
The method is based on surrounding colonies with agar, infiltrating them with Spurr's medium, and then sectioning. Colonies with a diameter in the range of 1-2 mm are suitable for this protocol. In addition to visualizing the interior of colonies, the method allows visualization of the region of the colony that invades the underlying agar.

A method for embedding yeast colonies allowing sectioning for light and electron microscopy. This protocol allows determination of the distribution of sporulated cells and pseudohyphal cells within colonies providing a new tool toward understanding the organization of cell types within a fungal community.

Maya Colony Gömme Yöntemi

Patterning of  different cell types in embryos is a key mechanism in metazoan development. Communities of microorganisms, such as colonies and biofilms ...

A Method for Mouse Pancreatic Islet Isolation and Intracellular cAMP Determination

Uncontrolled glycemia is a hallmark of diabetes mellitus and promotes morbidities like neuropathy, nephropathy, and retinopathy. With the increasing prevalence of diabetes, both immune-mediated type 1 and obesity-linked type 2, studies aimed at delineating diabetes pathophysiology and therapeutic mechanisms are of critical importance. The &#946;-cells of the pancreatic islets of Langerhans are responsible for appropriately secreting insulin in response to elevated blood glucose concentrations. In addition to glucose and other nutrients, the &#946;-cells are also stimulated by specific hormones, termed incretins, which are secreted from the gut in response to a meal and act on &#946;-cell receptors that increase the production of intracellular cyclic adenosine monophosphate (cAMP). Decreased &#946;-cell function, mass, and incretin responsiveness are well-understood to contribute to the pathophysiology of type 2 diabetes, and are also being increasingly linked with type 1 diabetes. The present mouse islet isolation and cAMP determination protocol can be a tool to help delineate mechanisms promoting disease progression and therapeutic interventions, particularly those that are mediated by the incretin receptors or related receptors that act through modulation of intracellular cAMP production. While only cAMP measurements will be described, the described islet isolation protocol creates a clean preparation that also allows for many other downstream applications, including glucose stimulated insulin secretion, [3H]-thymidine incorporation, protein abundance, and mRNA expression.

Assaying in vitro &#946;-cell function using isolated mouse islets of Langerhans is an important component in the study of diabetes pathophysiology and therapeutics. While many&#160;downstream applications are available, this protocol specifically describes the measurement of intracellular cyclic adenosine monophosphate (cAMP) as an essential parameter determining &#946;-cell function.

Fare Pankreas Adacık İzolasyonu ve hücre içi cAMP Belirlenmesi için Bir Yöntem

Uncontrolled glycemia is a hallmark of diabetes mellitus and promotes morbidities like neuropathy, nephropathy, and retinopathy. With the increasing ...

Probe-based Real-time PCR Approaches for Quantitative Measurement of microRNAs

Probe-based quantitative PCR (qPCR) is a favoured method for measuring transcript abundance, since it is one of the most sensitive detection methods that provides an accurate and reproducible analysis. Probe-based chemistry offers the least background fluorescence as compared to other (dye-based) chemistries. Presently, there are several platforms available that use probe-based chemistry to quantitate transcript abundance. qPCR in a 96 well plate is the most routinely used method, however only a maximum of 96 samples or miRNAs can be tested in a single run. This is time-consuming and tedious if a large number of samples/miRNAs are to be analyzed. High-throughput probe-based platforms such as microfluidics (e.g. TaqMan Array Card) and nanofluidics arrays (e.g. OpenArray) offer ease to reproducibly and efficiently detect the abundance of multiple microRNAs in a large number of samples in a short time. Here, we demonstrate the experimental setup and protocol for miRNA quantitation from serum or plasma-EDTA samples, using probe-based chemistry and three different platforms (96 well plate, microfluidics and nanofluidics arrays) offering increasing levels of throughput.

Circulating microRNAs have recently emerged as promising and novel biomarkers for various cancers and other diseases. The goal of this article is to discuss three different probe-based real-time PCR platforms and methods that are available to quantify and determine the abundance of circulating microRNAs.

Probe-tabanlı Real-time PCR microRNA Kantitatif Ölçüm Yaklaşımları

Probe-based quantitative PCR (qPCR) is a favoured method for measuring transcript abundance, since it is one of the most sensitive detection methods that ...