Bu çalışmalar MEXT, JSP'ler KAKENHI Grant numaraları JP25290009, JP25650120, JP17K07494 ve JP17H05984 alınan hibe tarafından finanse edilmiştir.

1. bir Subpopulation bir lazer iki fotonlu mikroskop kullanarak nöronların ablasyon
Not: Kullanıcılar Ca görüntüleme aşağıdaki ablasyon edâ planlıyorsanız, UAShspzGCaMP6s satır21kullanın. Kullanıcılar davranış kayıt ablasyon takip edâ planlıyorsanız, ablasyon EGFP pozitif hücrelerinin daha GCaMP6s ifade hücrelerinin gerçekleştirmek kolay olan UAS:EGFP çizgi kullanın.
<ol><li>Etiketler belirlenmesi için belirli sinir hücreleri ve UAS:EGFP ya UAShspzGCaMP6s Gal4 bir satýr çiftleşme kadar ayarlayarak başlar. Sedef homozygotes elde edilebilir için her iki ebeveyn sedefli arka plan kullanmayı unutmayın. Not: Sedef homozygotes yok melanophores vücut yüzeyi (Şekil 1B) içerir. Mevcut çalışma, (ki Pretetto etiketleri) bir Gal4 satır gSAIzGFFM119B ve başka bir Gal4 hattı (hangi ILH etiketleri) hspGFFDMC76A kullanılan21vardır.</li>
	<li>Ertesi gün çiftleşme kurulumu, zebra balığı yumurta toplamak ve onları bu noktada faiz nöronlar floresan gazetecilere ifade edecek larva aşaması için yükseltmek.</li>
	<li>Zebra balığı larva de %2 düşük erime noktası-özel (Şekil 1B) bağlayın.<ol>
<li>%2 özel stok çözelti hazırlama başlayın: 2 g dağıtılması düşük erime noktası özel toz 100 mL sistem su (yani, dolaşımdaki su sisteminde yetişkin zebra balığı korumak için kullanılan su)22 veya E3 su23, su getirerek Kaynama noktası bir mikrodalga ve şiddetle karıştırma için.</li>
		<li>Kaynar kadar % 2 düşük erime noktası özel hisse senedi mikrodalga. 6-cm Petri kabına kapağı üzerine özel 3.5-4.0 mL dökün. Böylece devam etmeden önce dokunmak sıcak özel soğur kadar bekleyin.</li>
		<li>Daha sonra (Bu adımda anestezi değil) tek bir larva özel yerleştirin. Böylece dik, diseksiyon iğne (Şekil 1C), konumu ve larva yönünü ayarlama tutmak larva uygun konumlandırma sağlamak için özel katılaşır kadar. Not: Larva iken özel katılaşır çevresinde yüzerek devam edecektir.</li>
		<li>Larva konumlandırılmış, 5 min için tamamen kuvvetlendirmek özel izin verme.</li>
		<li>5 mL tricaine çözeltisi (1 x çalışma konsantrasyonu % 0,4) özel dökün. Not: Hareketleri larva tarafından lazer Ablasyon sırasında önlemek için larvalar ablasyon işlemi imzalat tutulması gerekir.</li>
	</ol></li>
	<li>Bir iki fotonlu lazer mikroskobu sisteminde beyazlatma işlevini kullanarak larva ablate.<ol>
<li>Bir iki fotonlu lazer tarama mikroskop altında özel katıştırılmış larva yerleştirin ve mikroskopi sistemini başlatın.</li>
		<li>Görüntü alma yazılımı başlatmak ve lazer (Şekil 1D) açmak için "Lazer" sekmesinde "On" düğmesini tıklatın. "Modu-kilitli için." "Meşgul" değiştirmek için lazer "durum" bekleyin</li>
		<li>880 lazer dalga boyu "Kanallar" sekmesinde ayarlanan nm (maksimum güç: Yaklaşık 2300 mW) EGFP ablasyon ya da 800 nm (maksimum güç: yaklaşık 2.600 mW) GCaMP ablasyon için.</li>
		<li>20 X objektif lens lens tabanca taşıyarak el ile seçin. "Yerleştirme" sekmesini tıklatın, "GFP" optik yolları değiştirmek ve floresan göz tarafından doğrudan görüntülemek için.</li>
		<li>Zebra balığı larva beyin görüntüleme merkezinde bulun; sonra iki fotonlu mikroskobu geri dönmek "Satın alma" sekmesini tıklatın.</li>
		<li>'Önce ablasyon' koşulu bir kayıt olarak, bir z-yığın görüntü 20 X objektif lens ile hızlı tarama-(ısı-zarar görmemesi için) hızda al. Daha sonra önce ve sonra ablasyon deneyler (Şekil 2A) çekilen görüntüleri karşılaştırın. "Z-yığın" z-yığın seçeneği seçin ve sonra larva beyin ventral tarafta odaklanarak alt sınırı (tıklayın "ayarla ilk" düğmesi") ve üst sınırı ("Son Set"düğmesini tıklatın) sekmesini genişletmek odaklanan sonra z fiş almak için tıklatın dorsal çoğu yüzey beyin. O zaman, z-yığın resim alma çalıştırmak için "Başlat Experiment" düğmesini tıklatın.</li>
		<li>63 X objektif lens lens tabanca taşıyarak el ile seçin.</li>
		<li>Epi-floresan mikroskopi geçiş, görünümü merkezinde göz tarafından ablated için hücreleri bulun, sonra tarama mikroskobu lazer geri dönmek "Satın alma" sekmesini tıklatın için "Yerleştirme" sekmesini tıklatın.</li>
	</ol></li>
	<li>"Satın alma modu" sekmesinde, "Çerçeve boyutu" 256 x 256 ayarlayın. "Canlı"'yı tıklatın ve nöronlar ilgi gözlemlemek.</li>
	<li>En arka taraftan başlayarak, ablated için hücreleri odakta olan bir odak düzlemi bulmak.</li>
	<li>Küçük, dairesel bir alan "Bölgeler" işlevini kullanarak yaklaşık üçte hücrenin boyutu çapı üzerinde her neuron ilgi (ROI) bir bölge olarak işaretleyin.</li>
	<li>Bir lazer Işınma Zamanı yaklaşık 200 µs/piksel veya 200 µs/0,5 µm için karşılık gelen 13,93 s/256 x 256 piksel (134.42 µm x 134.42 µm), için tarama hızını ayarlar. Ayrıca, 4 tekrar ayarla (' yineleme döngüsü: 4'). Böylece yeterli ablasyon elde alternatif olarak, yineleme ve tarama hızı optimize edin.</li>
	<li>Örnek (öncesi ve sonrası ablasyon) ve '(ROIs ayarlamak için) bölgeleri' veya eşdeğer işlevleri kullanılan yazılım (Şekil 1D) görüntüye ablasyon, 'saat serisi (2 döngüleri)' ile birlikte 'Bleaching' işlevi gerçekleştirir.</li>
	<li>(Önce ablasyon) ilk görüntü ve zaman serisi ikinci resimde (sonra ablasyon) karşılaştırarak döngüsü, beyazlatma, floresan (Şekil 2B) arka plan düzeyinde gözlenen için hedeflenen hücreleri azalır, sonra emin.</li>
	<li>Floresans ablasyon sonra hala varsa, yineleme sayısını artırmak.</li>
	<li>Daha sonra odak düzlemi biraz daha derin (yani, ventral yan doğru) hareket ve nerede un ablated hücreleri görünür sonraki odak düzlemi seçin.</li>
	<li>Ağartma işlevi (yukarıda adım 1.9) açıklandığı gibi yapar. İlgi sinirsel yapısındaki tüm hücreleri ablated kadar bu adımları yineleyin.</li>
	<li>Ablated için sinirsel yapıları kapsayan tüm odak uçaklar gittikten sonra kaldırıldı floresan için hücreleri denetleyin. Bazı hücreler hala nedeniyle yetersiz ablasyon floresan olmak bulunursa, lazer-onları tekrar açıklandığı gibi ışınlatayım.</li>
	<li>Larva özel lazer ile sonra kurtarılan gerekiyorsa, bu larva zarar verebilir çünkü dışında özel güç çalışmayın. Bunun yerine, dikkatle özel larva çevresinde küçük kesim dik onun vücut yüzeyine yapın. Daha sonra anestezik etkisi geçiyor zaman özel dışında kendi yüzmeyi larva için bekleyin.</li>
	<li>Ablasyon için sonraki larva geçin veya denetim başka bir nüfus davranış soruşturma altında ilişki kurmadan nöronların kullanarak deneyler yapmak. Not: Burada, kontrol, UAS:EGFP nöronlarda olfaktör ampul olarak; gSAIzGFFM119B larva lazer ablated-(Şekil 2A, sağ) açıklanan aynı iletişim kuralını kullanarak.</li>
	<li>Birkaç saat veya Ca görüntüleme (Bölüm 2) veya davranış kayıt (Bölüm 3) devam etmeden önce kurtarma için 1 gün izin. Bu kurtarma sırada, larva sağlık (yani, normal spontan yüzme, ablated alan, vbetrafında belirgin hiçbir ısı hasarı) denetleyin ve herhangi bir kötü sağlık belirtileri gösteren larva kaldırın.</li>
</ol>2. kalsiyum görüntüleme Pretetto ablated zebra balığı larva av uyarılmış nöronal etkinliklerini kaydetmek için
<ol><li>Kayıt odası hazırlamak için güvenli-mühür hibridizasyon odası conta yapıştırıcı yüzü cama bakacak şekilde bir cam slayt üzerinde koymak ve en iyi mühür kaldırın. Not: Bu 9 mm jant çapında ve derinlik (Şekil 3A) 0.8 mm bir küçük kayıt odası oluşturur.</li>
	<li>Daha sonra bir naylon mesh yerleştirin (açılış boyutu: 32 µm) kesip alt var bir 50 mL tüp üzerinde. Kap kafes Tube (Şekil 3B) bağlamak için kullanın.</li>
	<li>Paramecia (av larva için görsel uyarıcı kullanılacak olan) hazırlayın. Not: Terliksi Hayvan Kültür (adım 2.3.1 ve 2.3.2) hazırlamak önceden.<ol>
<li>Paramecia tohum kültür ticari kaynakları veya akademik biyo-kaynak merkezleri24 önceden alabilirsiniz.</li>
		<li>Kültür autoclaved pirinç saman ve Pelet kuru bira mayası22 (Şekil 3C) içeren suda birkaç gün Terliksi Hayvan .</li>
		<li>Terliksi Hayvan kültür 2 elekler gittikçe dökün (150 µm diyafram ile bir başka bir 75 µm diyafram ile tarafından takip) enkaz kültür kaldırmak için.</li>
		<li>Paramecia akışı aracılığıyla önceki adımda bir naylon mesh (13-µm diyafram) toplamak.</li>
		<li>Paramecia bir sıkmak şişe sistemi su (Şekil 3D) kullanarak bir cam kabı içine naylon mesh üzerinde yeniden askıya alma.</li>
	</ol></li>
	<li>Kafes (Şekil 3B) (Şekil 3E) x 2 sistem suda yıkayın. Not: Bu adımın amacı da çalışmanın amacı gözlemlemek için görsel olarak nöronal aktivite tahrik olduğu gibi herhangi bir olası odorants ve Terliksi Hayvan kültür ortamı, içerdiği tastants kaldırmaktır.</li>
	<li>Zebra balığı larva tricaine çözüm anestezi için yerleştirin.</li>
	<li>Tek bir larva iken % 2 düşük erime noktası özel olarak bağlayın.<ol>
<li>İlk olarak, % 2 düşük erime noktası özel mikrodalga ve 1/10 birim konsantre tricaine x 10 için özel ekleme.</li>
		<li>Tricaine içeren özel bir damla kayıt odası (Şekil 3A) yerleştirin.</li>
		<li>Onayladıktan sonra özel çok sıcak değil, (Kimden adım 2.5) imzalat larva özel yüzeyi hafif bombeli görünüyor ki hemen aşırı herhangi bir özel kaldırma özel yerleştirin.</li>
		<li>Hızlı bir şekilde larva dik bir diseksiyon iğnesi (Şekil 1C) gelecek şekilde yönlendirin. Not: Bu yordamları özel katılaşır önce birkaç saniye içinde tamamlanmalıdır.</li>
		<li>Larva şekilde alacak biçimde yerleştirildiğinden, 5 min için tamamen kuvvetlendirmek özel izin verme. Sonra bir damla 1 x tricaine çözüm özel dökün.</li>
	</ol></li>
	<li>Zebra balığı larva başının etrafında özel kaldırmak ve cerrahi bir bıçak kullanarak yüzmeyi Terliksi Hayvan için yer açın. Bunu yapmak için ilk olarak, özel (Şekil 3F) içinde bir kaç küçük kesim yapmak. Sonra yavaşça odası üzerinde sistem su dökerek aşırı özel dikkatli bir şekilde çıkarın. Not: Bu adımda, tricaine yıkanması.</li>
	<li>Daha sonra bir amip görsel bir uyarıcı hizmet için kayıt odasında koymak. Not: Terliksi Hayvan zebra balığı larva Başkanı yüzer zaman nöronal yanıt (Şekil 3G) uyandırmak.</li>
	<li>Kayıt odası bir epi-floresan mikroskop altında bir bilimsel CMOS Kamera (Şekil 3H) ile donatılmış ve bir 2.5 X objektif lens (Şekil 3ben) seçin.</li>
	<li>GCaMP floresan sinyallerini hızlandırılmış kayıtları toplamak.<ol>
<li>Donanımlı kamera görüntü satın alma uygulamasını başlatın.</li>
		<li>"Sıra bölmesi" ve "Sabit Disk kaydı" üstünde belgili tanımlık cam seçin. Tarama ayarları bölümünde, "çerçeve istenen sayısı" 900 ya da herhangi bir diğer toplam çerçeve numarasına ayarlayın. Not: Varsa, bir modül ile hızlandırılmış kayıt yazılımı kullanır (burada, "Sabit Disk kayıt") sağlayan bir sabit disk üzerine veri verimli kaydetme.</li>
		<li>"Yakalama" Bölmesi'nde, pozlama süresi 2 x 30-ms (yani, 33,3 fps) ve Binning 2 olarak ayarlamak.</li>
		<li>GCaMP benzer uyarma/emisyon spectra GFP için olduğu gibi dokunmatik panel kontrol mikroskobunun GFP için ayarla bir filtre seçin.</li>
		<li>"Live" içinde belgili tanımlık fotoğraf makinesi görünümünü ve odak (Şekil 4A), larva bulun ve sonra "Live durdurmak"'ı tıklatın ve "Başlat" düğmesine tıklayın için yakalama Bölmesi'ni tıklatın. Film .cxd veya satın alma durumu ile ilgili bilgiler başka bir biçimde kaydedin.</li>
	</ol></li>
	<li>Sonra kayıtları, hızlandırılmış film Fiji25özgür yazılım kullanarak beyin yapısında ayarlayın yatırım getirisi için Ortalama piksel değerlerini elde ederek GCaMP6s floresan sinyallerini (Ca sinyalleri) analiz. Not: Fiji olduğunu birçok yararlı tapa-içinde ile a yorum-in ImageJ'ın önceden yüklenmiş ve .cxd biçimi görüntü dosyaları ile Bio-oluşum-ebilmek okumak eklentisi.</li>
	<li>Larva biraz kayıt sırasında taşırsanız, Fiji'de TurboReg eklenti26 çalıştırarak görüntü kaydı gerçekleştirmek. Menüden, 'Eklentiler', 'Kayıt' ve 'TurboReg' seçin.</li>
	<li>Nasıl çalışma amacı göre verileri çözümlemek için göz önünde bulundurun. Bir örnek aşağıdadır.<ol>
<li>F/F0 (floresan yoğunluğu tarafından floresan yoğunluğu istirahat veya herhangi bir Ca geçici gerçekleştirilmeden önce bölünmüş her zaman) aşağıdaki gibi hesaplar:</li>
		<li>Ayarla ROIs Pretetto veya ROI Yöneticisi'ni kullanarak ILH: menüde, "Analiz"Araçlar,""ROI Yöneticisi"," seçin ve "Ekle" (Şekil 4A) ROIs listesinde.</li>
		<li>ROIs için Ortalama piksel değerlerini hesaplamak (i.e., floresans yoğunluklarını GCaMP6s in) ROI Yöneticisi panelde seçerek: "Daha fazla," "Çok ölçü" ve "Tamam." Sonuçları bir elektronik tablo dosyası olarak kaydedin.</li>
		<li>Sinyalleri gürültülü olarak, sinyalleri 11 saat-elektronik tablo verilerini işleyen bir Web uygulaması kullanarak puan (hareketli ortalama) için Ortalama.</li>
		<li>F (zamanla yoğunluklarda floresan) F0 tarafından bölmek (floresan yoğunluğu bazal düzeyinde) normalleştirilmiş floresan yoğunluğu hesaplamak için. Veri görselleştirme, örneği değiştikçe normalleştirilmiş GCaMP6s floresan yoğunluğu Pretetto ve ILH renk kodlu ve Terliksi Hayvan yörüngeler (Şekil 4B - D) eşleştirilmiş.</li>
	</ol></li>
</ol>3. lazer ablasyon aşağıdaki davranış sonuçları değerlendirilmesi
<ol><li>Bir video kamera ile donatılmış bir stereoscope oluşan bir davranış kayıt sistemi ayarlayın. Bir fotoğraf makinesi bir uygun görüntü alma yazılımı ile ticari veya özel yapım (Şekil 5A) kullanın.</li>
	<li>Aydınlatma koşulu Terliksi Hayvan görüntü işleme tarafından tespit edilebilir en iyi duruma. Örneğin, bir yüzük beyaz LED ışık bir ile (Şekil 5B) kullanılmalıdır. Not: Mesafe ve açısını, LED örnek (yani, karanlık arka planda parlak veya parlak arka planda karanlık) ve vardır, bu nedenle, başarılı görüntü işleme için kritik görünümünü etkiler. Rondela (Şekil 5C) en iyi yüksekliğini belirler.</li>
	<li>(Bölüm 1'de açıklanan lazer ablasyon deneme kurtarılan) bir zebra balığı larva (hangi bir cam slayt için bağlı olduğu) bir davranış kayıt odası kaldırıldı orijinal en iyi mühür ile (Şekil 5D) yerleştirin.</li>
	<li>50 paramecia Kültür (adım 2.3.5) toplamak bir micropipette kullanarak ve kayıt odasına koyun.</li>
	<li>Bir kapak notu kayıt odası üstüne yerleştirin. Küçük bir damla su ile ilgili kapak formu hava odasında tanıtımı önlemek için kayıt odası su yüzeyinde yerleştirmeden önce koymak. Not: Bu adımda, biraz su paramecia ile kayıt odasından taşma. Paramecia kayıt odasında kalan sayısı yaklaşık 30-40 olacak.</li>
	<li>(Bir larva ve parameciaiçeren) kayıt odası aydınlatma sistemi (Şekil 5D) yerleştirin.</li>
	<li>11 dk (6600 çerçeveler) için 10 kare/sn, hızlandırılmış kaydını Başlat seçimini yapın.</li>
	<li>(İsteğe bağlı) Davranış için test edildi her larva için lazer ablasyon (yani, devamsızlık veya önemli ölçüde azaltılmış sayısı, floresan hücreleri etkinliğini doğrulamak için floresan mikroskopi tarafından lazer ablated alanlarda floresans gözlemlemek Lazer ışınlanmış alan). Not: Işınlama sonra bile, floresan bazı hücreler hala daha sonra Gal4 gen ekspresyonu ablasyon27sonra Ayrıştırılan hücrelerdeki başlangıçlı nedeniyle görülebilmektedir.</li>
	<li>Larva'nın davranışı, tekdüzelik arka planda eksikliği telafi etmek için kaydettikten sonra her kare piksel piksel bölünmesi Fiji ortalama bir görüntü yerine getirilir: 'Süreç 'Görüntü hesap makinesi',' tıklayın ' işlemi: bölmek ', ' 32-bit (float) sonuç ', ve ' Tamam '. Ortalama bir resim yapmak, 'Resim', 'Yığar', 'Z-projesi', 'Ortalama yoğunluğu' ve 'OK' (Şekil 5E, F)'ı tıklatın.</li>
	<li>Paramecia sayısı 'Analiz 'Parçacıklar analiz',' ı tıklatarak odasında yaptı sayısı tüm paramecia, kapsayan bir alan aralığı ayarını 'Gösteri: maskeler' onay kutusunu kontrol ve 'Tamam' tıklatın. 'Show: maskeler' seçeneği ayıklanan paramecia görüntüyle (Şekil 5G), parçacıklar (paramecia) her kare sayısı listesini sağlar.</li>
	<li>Paramecia sol kayıt odasında sayısı zaman içinde arsa. Paramecia sayısı tahminleri gürültülü olduğu için hareketli ortalama 600 kare (1 dk) elektronik tablo bir aralıktaki her noktasında yapmak tavsiye.</li>
</ol>

<ol>
	<li>Feierstein, C. E., Portugues, R., Orger, M. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Seeing+the+whole+picture:+A+comprehensive+imaging+approach+to+functional+mapping+of+circuits+in+behaving+zebrafish.">Seeing the whole picture: A comprehensive imaging approach to functional mapping of circuits in behaving zebrafish.</a> Neuroscience. 296, 26-38 (2015).</li><li>Nakai, J., Ohkura, M., Imoto, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+high+signal-to-noise+Ca(2+)+probe+composed+of+a+single+green+fluorescent+protein.">A high signal-to-noise Ca(2+) probe composed of a single green fluorescent protein.</a> Nat Biotechnol. 19 (2), 137-141 (2001).</li><li>Muto, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genetic+visualization+with+an+improved+GCaMP+calcium+indicator+reveals+spatiotemporal+activation+of+the+spinal+motor+neurons+in+zebrafish.">Genetic visualization with an improved GCaMP calcium indicator reveals spatiotemporal activation of the spinal motor neurons in zebrafish.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 108 (13), 5425-5430 (2011).</li><li>Lorent, K., Liu, K. S., Fetcho, J. R., Granato, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+zebrafish+space+cadet+gene+controls+axonal+pathfinding+of+neurons+that+modulate+fast+turning+movements.">The zebrafish space cadet gene controls axonal pathfinding of neurons that modulate fast turning movements.</a> Development. 128 (11), 2131-2142 (2001).</li><li>Asakawa, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genetic+dissection+of+neural+circuits+by+Tol2+transposon-mediated+Gal4+gene+and+enhancer+trapping+in+zebrafish.">Genetic dissection of neural circuits by Tol2 transposon-mediated Gal4 gene and enhancer trapping in zebrafish.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 105 (4), 1255-1260 (2008).</li><li>Sternberg, J. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optimization+of+a+Neurotoxin+to+Investigate+the+Contribution+of+Excitatory+Interneurons+to+Speed+Modulation+In+Vivo.">Optimization of a Neurotoxin to Investigate the Contribution of Excitatory Interneurons to Speed Modulation In Vivo.</a> Curr Biol. , (2016).</li><li>Arrenberg, A. B., Del Bene, F., Baier, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optical+control+of+zebrafish+behavior+with+halorhodopsin.">Optical control of zebrafish behavior with halorhodopsin.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 106 (42), 17968-17973 (2009).</li><li>Orger, M. B., Kampff, A. R., Severi, K. E., Bollmann, J. H., Engert, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Control+of+visually+guided+behavior+by+distinct+populations+of+spinal+projection+neurons.">Control of visually guided behavior by distinct populations of spinal projection neurons.</a> Nat Neurosci. 11 (3), 327-333 (2008).</li><li>Huang, K. H., Ahrens, M. B., Dunn, T. W., Engert, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spinal+projection+neurons+control+turning+behaviors+in+zebrafish.">Spinal projection neurons control turning behaviors in zebrafish.</a> Curr Biol. 23 (16), 1566-1573 (2013).</li><li>Smear, M. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Vesicular+glutamate+transport+at+a+central+synapse+limits+the+acuity+of+visual+perception+in+zebrafish.">Vesicular glutamate transport at a central synapse limits the acuity of visual perception in zebrafish.</a> Neuron. 53 (1), 65-77 (2007).</li><li>Bianco, I. H., Engert, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Visuomotor+transformations+underlying+hunting+behavior+in+zebrafish.">Visuomotor transformations underlying hunting behavior in zebrafish.</a> Curr Biol. 25 (7), 831-846 (2015).</li><li>Trivedi, C. A., Bollmann, J. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Visually+driven+chaining+of+elementary+swim+patterns+into+a+goal-directed+motor+sequence:+a+virtual+reality+study+of+zebrafish+prey+capture.">Visually driven chaining of elementary swim patterns into a goal-directed motor sequence: a virtual reality study of zebrafish prey capture.</a> Front Neural Circuits. 7, 86 (2013).</li><li>Jouary, A., Haudrechy, M., Candelier, R., Sumbre, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+2D+virtual+reality+system+for+visual+goal-driven+navigation+in+zebrafish+larvae.">A 2D virtual reality system for visual goal-driven navigation in zebrafish larvae.</a> Sci Rep. 6, 34015 (2016).</li><li>Muto, A., Ohkura, M., Abe, G., Nakai, J., Kawakami, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Real-time+visualization+of+neuronal+activity+during+perception.">Real-time visualization of neuronal activity during perception.</a> Curr Biol. 23 (4), 307-311 (2013).</li><li>Del Bene, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Filtering+of+visual+information+in+the+tectum+by+an+identified+neural+circuit.">Filtering of visual information in the tectum by an identified neural circuit.</a> Science. 330 (6004), 669-673 (2010).</li><li>Semmelhack, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+dedicated+visual+pathway+for+prey+detection+in+larval+zebrafish.">A dedicated visual pathway for prey detection in larval zebrafish.</a> Elife. 3, 04878 (2014).</li><li>Preuss, S. J., Trivedi, C. A., vom Berg-Maurer, C. M., Ryu, S., Bollmann, J. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Classification+of+object+size+in+retinotectal+microcircuits.">Classification of object size in retinotectal microcircuits.</a> Curr Biol. 24 (20), 2376-2385 (2014).</li><li>Romano, S. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spontaneous+Neuronal+Network+Dynamics+Reveal+Circuit's+Functional+Adaptations+for+Behavior.">Spontaneous Neuronal Network Dynamics Reveal Circuit's Functional Adaptations for Behavior.</a> Neuron. 85 (5), 1070-1085 (2015).</li><li>Barker, A. J., Baier, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sensorimotor+decision+making+in+the+zebrafish+tectum.">Sensorimotor decision making in the zebrafish tectum.</a> Curr Biol. 25 (21), 2804-2814 (2015).</li><li>Ewert, J. -. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Neuroethology: an Introduction to the Neurophysiological Fundamentals of Behavior. , (1980).</li><li>Muto, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Activation+of+the+hypothalamic+feeding+centre+upon+visual+prey+detection.">Activation of the hypothalamic feeding centre upon visual prey detection.</a> Nat Commun. 8, 15029 (2017).</li><li>Muto, A., Kawakami, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Calcium+Imaging+of+Neuronal+Activity+in+Free-Swimming+Larval+Zebrafish.">Calcium Imaging of Neuronal Activity in Free-Swimming Larval Zebrafish.</a> Methods Mol Biol. 1451, 333-341 (2016).</li><li>Westerfield, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> THE ZEBRAFISH BOOK, 5th Edition. , (2007).</li><li>. Fiji Available from: <a target="_blank" href="https://fiji.sc">https://fiji.sc</a> (2017)</li><li>Thevenaz, P., Ruttimann, U. E., Unser, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+pyramid+approach+to+subpixel+registration+based+on+intensity.">A pyramid approach to subpixel registration based on intensity.</a> IEEE Trans Image Process. 7 (1), 27-41 (1998).</li><li>Mueller, T., Wullimann, M. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=BrdU-,+neuroD+(nrd)-+and+Hu-studies+reveal+unusual+non-ventricular+neurogenesis+in+the+postembryonic+zebrafish+forebrain.">BrdU-, neuroD (nrd)- and Hu-studies reveal unusual non-ventricular neurogenesis in the postembryonic zebrafish forebrain.</a> Mech Dev. 117 (1-2), 123-135 (2002).</li><li>Muto, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Forward+genetic+analysis+of+visual+behavior+in+zebrafish.">Forward genetic analysis of visual behavior in zebrafish.</a> PLoS Genet. 1 (5), 66 (2005).</li><li>Chen, T. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ultrasensitive+fluorescent+proteins+for+imaging+neuronal+activity.">Ultrasensitive fluorescent proteins for imaging neuronal activity.</a> Nature. 499 (7458), 295-300 (2013).</li></ol>

Yazarlar raporlanacak hiçbir çıkar çatışması var.

İki fotonlu lazer özellikle bireysel nöronlar ablate için mükemmel bir uzaysal çözünürlük olmasına rağmen ısı nedeniyle beyin dokusu üzerinde istenmeyen herhangi bir zarar vermemek için çok dikkatli alınmalıdır. Ablasyon deney konusunda en önemli adım lazer ile en uygun miktarda tespit etmektir. Yetersiz ışınlama nöronlar öldürmek başarısız olur. Çok fazla ışınlama istenmeyen etkileri neden olur çevreleyen doku ısı-hasar olacak. Lazer ile (ROIs, yinelemeler ve tarama hızı alanları...

Nasıl davranış beyinde nöronal aktivite doğar anlamak için bu davranışı üretimi söz konusu sinir devreleri tanımlamak gereklidir. Küçük, şeffaf beyinleri geniş bir alanda hücresel çözünürlükte nöronal aktivite araştırmak olanak sağlar çünkü beyin fonksiyonu eğitim davranışı ile ilişkili larva aşamasında, zebra balığı ideal bir hayvan modeli sağlar. davranış1gözlem sırasında beyin. Görüntüleme belirli nöronlar nöronal faaliyete GCaMP2gibi genetik olarak kodlanmış kalsiyum (Ca) göstergeleri (turk) icadı sayesinde mümkün olmuştur. GCaMP transgenik zebra balığı işlevsel sinir devre davranışı ile hayvanlar3davranışlar içinde Ca görüntüleme yaparak ilişkilendirmek için yararlı olması için kanıtlanmış.
CA görüntüleme nöronal aktivite ve davranışı arasındaki bağıntıları kanıtlamanın, nedensellik, göstermek için nöronal aktivite ve onun consequence(s) davranışı üzerinde test bastırılması iken önemli adımlar. Bunu sağlamanın çeşitli yolları vardır: belirli sinir devreleri4, nörotoksinler belirli nöronlar5,6, halorhodopsin7gibi optogenetic araçların kullanımını ifade değiştirir genetik mutasyonun kullanın ve Lazer ablasyon hedeflenen nöronlar8,9. Lazer ablasyon belirli nöronlar nispeten az sayıda etkinliğinde ortadan kaldırılması için özellikle uygundur. Geri dönüşü olmayan sinir hücreleri öldürmek tarafından nöronal aktivite kaldırılması davranış sonuçları değerlendirilmesi kolaylaştırır.
Zebra balığı larva safhasında gözlenen bir ilginç av yakalama (Şekil 1A) davranıştır. Bu görsel olarak destekli, hedefe yönelik davranış olumlu bir deneysel sistem görme keskinliği10, visuomotor dönüştürme11,12,13, görsel algı ve tanınması için çalışma sağlar. nesneleri14,15,16,17,18ve karar verme19. Nasıl yırtıcı yırtıcı ve AVI algılama av nasıl yol açar tarafından davranış yakalamak neuroethology20merkezi bir soru olmuştur kabul edilmektedir. Bu yazıda, Pretetto çekirdeğinde projeksiyonları tarafından kurulan pretecto-hipotalamik devre rolü ele (çekirdek pretectalis superficialis pars magnocellularis, bundan sonra sadece Pretetto kaydetti) için ILH. Lazer-ablasyon Pretetto, av yakalama etkinliğini azaltmak ve nöronal visual av algı21ile ilişkili ILH etkinliğinde kaldırılması gösterilmiştir. Burada, yerine getirmek için kullanılan iletişim kuralları lazer ablasyon ve onun etkisi Ca2 + görüntüleme ve davranış kayıt içinde zebra balığı larva açıklanmıştır kullanarak test.

<table><tbody><tr><td>NuSieve GTG Agarose</td><td>Lonza</td><td>Cat.#50080</td><td>low-melting temperature agarose</td></tr><tr><td>6 cm petri dish</td><td>FALCON</td><td>Product#:351007</td><td></td></tr><tr><td>dissecting needle</td><td>AS ONE Corporation</td><td>Cat. No. 2-013-01</td><td>https://keystone-lab.com/en/item/detail/404142</td></tr><tr><td>LSM7MP</td><td>Carl Zeiss</td><td></td><td>two-photon laser scanning microscope</td></tr><tr><td>W Plan-Apochromat 63x/1.0</td><td>Carl Zeiss</td><td></td><td>63X objective lens</td></tr><tr><td>Imager.Z1</td><td>Carl Zeiss</td><td></td><td>an epi-fluorescence microscope</td></tr><tr><td>ZEN</td><td>Carl Zeiss</td><td></td><td>Image acquisition software for confocal microscopes</td></tr><tr><td>Secure-Seal Hybridization Chamber Gasket, 8 chambers, 9 mm diameter x 0.8 mm depth</td><td>Molecular Probes</td><td>Catalogue # S-24732</td><td>Used as a recording chamber in Ca imaging</td></tr><tr><td>Imageing Chambers</td><td>Grace Bio-Labs</td><td>CoverWell Imaging Chambers PCI-A-2.5</td><td>Used as a behavioral recording chamber</td></tr><tr><td>surgical knife</td><td>MANI</td><td>Ophthalmic knife MST15</td><td></td></tr><tr><td>ORCA-Flash4.0</td><td>Hamamatsu Photonics</td><td>model:C11440-22CU</td><td>a scientific CMOS camera</td></tr><tr><td>HCImage</td><td>Hamamatsu Photonics</td><td></td><td>image acuisition software</td></tr><tr><td>Hard Disk Recording module</td><td>Hamamatsu Photonics</td><td></td><td>An software module that enables saving the movie files onto a hard disc drive in a short time</td></tr><tr><td>SZX7</td><td>Olympus</td><td></td><td>stereoscope</td></tr><tr><td>DF PL 0.5X</td><td>Olympus</td><td></td><td>objective lens for SZX7</td></tr><tr><td>Point Grey Grasshopper3 4.1 MP Mono USB3 Visio</td><td>FLIR Systems, Inc.</td><td>Product No. GS3-U3-41C6NIR-C</td><td>CMOS camera</td></tr><tr><td>XIMEA xiQ camera</td><td>XIMEA</td><td>Product No. MQ042RG-CM</td><td>CMOS camera</td></tr><tr><td>a ring LED light</td><td>CCS</td><td>Model: LDR2-100SW2-LA</td><td>White LED</td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Nylon mesh 32&amp;micro;m</td><td>Tokyo Screen</td><td>N-No.380T</td><td>http://www.tokyo-screen.com/cms/sta20347/</td></tr><tr><td>Nylon mesh 13&amp;micro;m</td><td>Tokyo Screen</td><td>N-No. 508T-K</td><td>http://www.tokyo-screen.com/cms/sta20347/</td></tr><tr><td>Metal seive 150 micron aperture</td><td>Tokyo Screen</td><td></td><td>http://www.tokyo-screen.com/cms/sta20341/#ami</td></tr><tr><td>Metal seive 75 micron aperture</td><td>Tokyo Screen</td><td></td><td>http://www.tokyo-screen.com/cms/sta20341/#ami</td></tr><tr><td>EBIOS</td><td>Asahi Food &amp;amp; Healthcare, Co. Ltd.</td><td></td><td>dry beer yeast</td></tr><tr><td>LabVIEW</td><td>National Instruments</td><td></td><td>an integrated development environment for programming</td></tr><tr><td>Mai-Tai HP</td><td>Spectra Physics&amp;nbsp;</td><td></td><td>two-photon laser&amp;nbsp;</td></tr></tbody></table>

ablation of a neuronal population using a two-photon laser and its assessment using calcium imaging and behavioral recording in zebrafish larvae

Bir subpopulation davranış nöronların rolü tanımlamak için faaliyete yaşayan hayvanlarda engelleme sonuçlarını test etmek esastır. Ne zaman sinir hücreleri seçerek floresan problar ile etiketlenir lazer ablasyon nöronların bu amaç için etkili bir yöntemdir. Bu da çalışmanın, bir subpopulation iki fotonlu mikroskop kullanarak ve onun işlevsel ve davranışsal sonuçları test nöronların ablating lazer protokollerde açıklanmıştır. Bu çalışmada, zebra balığı larva'av yakalama davranışı bir çalışma modeli kullanılır. Pretecto-hipotalamik devre davranış bulaşıcı görsel olarak tahrik av altında yatan olduğu bilinmektedir. Zebra balığı Pretetto lazer ablated ve hipotalamus (ILH; pretectal projeksiyon hedef) alt lob nöronal aktivite incelenmiştir. Av yakalama davranışı pretectal ablasyon sonra da test edildi.

Belirli nöronlar genetik olarak EGFP ya da GCaMP6s Ifade Gal4 satırlarında tahrik, etiketlenmiş. Gal4 hattı gSAIzGFFM119B bir çekirdek pretectal alanında (magnocellular yüzeysel pretectal çekirdeği), hem de bir subpopulation olfaktör ampul nöronların etiketlemek için kullanıldı. Başka bir Gal4 satır, hspGFFDMC76A, ILH etiketlemek için kullanıldı. Biz lazer-pretectal nöronlar bilateral ablated (resim 2A sol paneli) ve ayn...

Watch this Scientific Journal Video about Ablation of a Neuronal Population Using a Two-photon Laser and Its Assessment Using Calcium Imaging and Behavioral Recording in Zebrafish Larvae at JoVE.com

Ablation of a Neuronal Population Using a Two-photon Laser and Its Assessment Using Calcium Imaging and Behavioral Recording in Zebrafish Larvae

Burada, zebra balığı larvaları üzerinden bir iki fotonlu lazer nöronların genetik olarak etiketlenmiş bir subpopulation ablate için bir protokol mevcut.

Ablasyon nöronal nüfusunun iki fotonlu lazer ve kalsiyum görüntüleme ve davranış kayıt zebra balığı larva kullanarak kendi değerlendirme kullanma

To identify the role of a subpopulation of neurons in behavior, it is essential to test the consequences of blocking its activity in living animals. Laser ...

ablation-neuronal-population-using-two-photon-laser-its-assessment

Universidad de Cartagena UDEC

Research

JoVE Journal

Neuroscience

8.7K Görüntüleme.  SOKENDAI (The Graduate University for Advanced Studies). Burada, zebra balığı larvaları üzerinden bir iki fotonlu lazer nöronların genetik olarak etiketlenmiş bir subpopulation ablate için bir protokol mevcut.

Video: Ablation of a Neuronal Population Using a Two-photon Laser and Its Assessment Using Calcium Imaging and Behavioral Recording in Zebrafish Larvae

Two-photon axotomy and time-lapse confocal imaging in live zebrafish embryos

Zebrafish have long been utilized to study the cellular and molecular mechanisms of development by time-lapse imaging of the living transparent embryo. Here we describe a method to mount zebrafish embryos for long-term imaging and demonstrate how to automate the capture of time-lapse images using a confocal microscope. We also describe a method to create controlled, precise damage to individual branches of peripheral sensory axons in zebrafish using the focused power of a femtosecond laser mounted on a two-photon microscope. The parameters for successful two-photon axotomy must be optimized for each microscope. We will demonstrate two-photon axotomy on both a custom built two-photon microscope and a Zeiss 510 confocal/two-photon to provide two examples.

Zebrafish trigeminal sensory neurons can be visualized in a transgenic line expressing GFP driven by a sensory neuron specific promoter 1. We have adapted this zebrafish trigeminal model to directly observe sensory axon regeneration in living zebrafish embryos. Embryos are anesthetized with tricaine and positioned within a drop of agarose as it solidifies. Immobilized embryos are sealed within an imaging chamber filled with phenylthiourea (PTU) Ringers. We have found that embryos can be continuously imaged in these chambers for 12-48 hours. A single confocal image is then captured to determine the desired site of axotomy. The region of interest is located on the two-photon microscope by imaging the sensory axons under low, non-damaging power. After zooming in on the desired site of axotomy, the power is increased and a single scan of that defined region is sufficient to sever the axon. Multiple location time-lapse imaging is then set up on a confocal microscope to directly observe axonal recovery from injury.

Here we describe a method for mounting zebrafish embryos for long-term imaging, two-photon imaging and tissue-damage techniques, and time-lapse confocal imaging.

İki foton axotomy ve zaman atlamalı konfokal görüntüleme canlı zebrafish embriyolar

Zebrafish have long been utilized to study the cellular and molecular mechanisms of development by time-lapse imaging of the living transparent embryo.  ...

Biyoloji

Motor Nerve Transection and Time-lapse Imaging of Glial Cell Behaviors in Live Zebrafish

The nervous system is often described as a hard-wired component of the body even though it is a considerably fluid organ system that reacts to external stimuli in a consistent, stereotyped manner, while maintaining incredible flexibility and plasticity. Unlike the central nervous system (CNS), the peripheral nervous system (PNS) is capable of significant repair, but we have only just begun to understand the cellular and molecular mechanisms that govern this phenomenon. Using zebrafish as a model system, we have the unprecedented opportunity to couple regenerative studies with in vivo imaging and genetic manipulation. Peripheral nerves are composed of axons surrounded by layers of glia and connective tissue. Axons are ensheathed by myelinating or non-myelinating Schwann cells, which are in turn wrapped into a fascicle by a cellular sheath called the perineurium. Following an injury, adult peripheral nerves have the remarkable capacity to remove damaged axonal debris and re-innervate targets. To investigate the roles of all peripheral glia in PNS regeneration, we describe here an axon transection assay that uses a commercially available nitrogen-pumped dye laser to axotomize motor nerves in live transgenic zebrafish. We further describe the methods to couple these experiments to time-lapse imaging of injured and control nerves. This experimental paradigm can be used to not only assess the role that glia play in nerve regeneration, but can also be the platform for elucidating the molecular mechanisms that govern nervous system repair.

Although the peripheral nervous system (PNS) is capable of significant repair after injury, little is known about the cellular and molecular mechanisms that govern this phenomenon. Using live, transgenic zebrafish and a reproducible nerve transection assay, we can study dynamic glial cell behaviors during nerve degeneration and regeneration.

Motor Sinir transeksiyonu ve Canlı Zebra balığı Glial Hücre Davranışlarının Time-lapse Görüntüleme

The  nervous system is often described as a hard-wired component of the body even  though it is a considerably fluid organ system that reacts to external ...

Nörobilim

Confocal Microscope-Based Laser Ablation and Regeneration Assay in Zebrafish Interneuromast Cells

Hair cells are mechanosensory cells that mediate the sense of hearing. These cells do not regenerate after damage in humans, but they are naturally replenished in non-mammalian vertebrates such as zebrafish. The zebrafish lateral line system is a useful model for characterizing sensory hair cell regeneration. The lateral line is comprised of hair cell-containing organs called neuromasts, which are linked together by a string of interneuromast cells (INMCs). INMCs act as progenitor cells that give rise to new neuromasts during development. INMCs can repair gaps in the lateral line system created by&#160;cell death. A method is described here for selective INMC ablation using a conventional laser-scanning confocal microscope and transgenic fish that express green fluorescent protein in INMCs. Time-lapse microscopy is then used to monitor INMC regeneration and determine the rate of gap closure. This represents an accessible protocol for cell ablation that does not require specialized equipment, such as a high-powered pulsed ultraviolet laser. The ablation protocol may serve broader interests, as it could be useful for the ablation of additional cell types, employing a tool set that is already available to many users. This technique will further enable the characterization of INMC regeneration under different conditions and from different genetic backgrounds, which will advance the understanding of sensory progenitor cell regeneration.

Laser ablation is a widely applicable technology for studying regeneration in biological systems. The presented protocol describes use of a standard laser-scanning confocal microscope for laser ablation and subsequent time-lapse imaging of regenerating interneuromast cells in the zebrafish lateral line.

Zebrabalığı İnternöromast Hücrelerinde Konfokal Mikroskop Tabanlı Lazer Ablasyon ve Rejenerasyon Tonu

Hair cells are mechanosensory cells that mediate the sense of hearing. These cells do not regenerate after damage in humans, but they are naturally ...

Gelişim Biyolojisi

Deep and Spatially Controlled Volume Ablations using a Two-Photon Microscope in the Zebrafish Gastrula

Morphogenesis involves many cell movements to organize cells into tissues and organs. For proper development, all these movements need to be tightly coordinated, and accumulating evidence suggests this is achieved, at least in part, through mechanical interactions. Testing this in the embryo requires direct physical perturbations. Laser ablations are an increasingly used option that allows relieving mechanical constraints or physically isolating two cell populations from each other. However, many ablations are performed with an ultraviolet (UV) laser, which offers limited axial resolution and tissue penetration. A method is described here to ablate deep, significant, and spatially well-defined volumes using a two-photon microscope. Ablations are demonstrated in a transgenic zebrafish line expressing the green fluorescent protein in the axial mesendoderm and used to sever the axial mesendoderm without affecting the overlying ectoderm or the underlying yolk cell. Cell behavior is monitored by live imaging before and after the ablation. The ablation protocol can be used at different developmental stages, on any cell type or tissue, at scales ranging from a few microns to more than a hundred microns.

Embryonic development requires large-scale coordination of cell motion. Two-photon excitation mediated laser ablation allows the spatially controlled 3-dimensional ablation of large groups of deep cells. In addition, this technique can probe the reaction of collectively migrating cells in vivo to perturbations in their mechanical environment.

Zebrafish Gastrula'da İki Foton Mikroskobu Kullanılarak Derin ve Mekansal Kontrollü Hacim Ablasyonları

Morphogenesis involves many cell movements to organize cells into tissues and organs. For proper development, all these movements need to be tightly ...

Triggering Cell Stress and Death Using Conventional UV Laser Confocal Microscopy

Using a standard confocal setup, a UV ablation method can be utilized to selectively induce cellular injury and to visualize single-cell responses and cell-cell interactions in the CNS in real-time. Previously, studying these cell-specific responses after injury often required complicated setups or the transfer of cells or animals into different, non-physiological environments, confounding immediate and short-term analysis. For example, drug-mediated ablation approaches often lack the specificity that is required to study single-cell responses and immediate cell-cell interactions. Similarly, while high-power pulsed laser ablation approaches provide very good control and tissue penetration, they require specialized equipment that can complicate real-time visualization of cellular responses. The refined UV laser ablation approach described here allows researchers to stress or kill an individual cell in a dose- and time-dependent manner using a conventional confocal microscope equipped with a 405-nm laser. The method was applied to selectively ablate a single neuron within a dense network of surrounding cells in the zebrafish spinal cord. This approach revealed a dose-dependent response of the ablated neurons, causing the fragmentation of cellular bodies and anterograde degeneration along the axon within minutes to hours. This method allows researchers to study the fate of an individual dying cell and, importantly, the instant response of cells-such as microglia and astrocytes-surrounding the ablation site.

Targeted manipulations to cause directed stress or death in individual cells have been relatively difficult to accomplish. Here, a single-cell-resolution ablation approach to selectively stress and kill individual cells in cell culture and living animals is described based on a standard confocal UV laser.

Konvansiyonel UV Lazer konfokal mikroskopi kullanılarak Tetikleme Hücre Stres ve Ölüm

Using a standard confocal setup, a UV ablation method can be utilized to selectively induce cellular injury and to visualize single-cell responses and ...

<meta charset="utf8"></head><body>Zebra Balığı Larvalarında Kemik Rejenerasyonunu İncelemek için Lazer Ablasyon Yöntemi

Two-Photon Laser-Mediated Ablation of Osteoblasts in Developing Zebrafish Larvae

Zebrafish (Danio rerio) have an outstanding capacity to regenerate different organs and appendages. Bone regeneration in zebrafish has been studied using different methods such as fin amputation, scale plucking, skull trepanation, and microscopic approaches. Using a confocal laser scanning setup equipped with a two-photon laser, a laser ablation method was developed as a lesion paradigm to ablate bone-forming cells (osteoblasts) in the developing opercle of zebrafish larvae. The method described here allows the ablation of cells in a precise manner, as the area, shape, and depth can be finely adjusted. In addition, this method allows imaging of the area before and just after the ablation, so that short-term effects of the injury can be analyzed. In this experimental setup, the immune response after ablation of osteoblasts in the injured area was studied. An increase in the recruitment of macrophages was observed after ablation, indicating the relevance of their presence during bone regeneration.

<meta charset="utf8"></head><body>Yazar Spotlight: İmmün Aracılı Kemik Rejenerasyonu — Restoratif Süreçlerde Makrofajların ve Kontrollü İmmünomodülasyonun Kritik Rolü

This protocol describes a two-photon laser ablation approach carried out in zebrafish larvae, which serves as a model to study bone regeneration and the effects of the immune response to ablation.

Gelişmekte Olan Zebra Balığı Larvalarında Osteoblastların İki Foton Lazer Aracılı Ablasyonu

Zebrafish (Danio rerio) have an outstanding capacity to regenerate different organs and appendages. Bone regeneration in zebrafish has been studied using ...

Zebra Balığı Ön Beyininde Davranış İzleme ve Nöral Aktivite Örüntüsü

Two-Photon Calcium Imaging of Forebrain Activity in Behaving Adult Zebrafish

Adult zebrafish (Danio rerio) exhibit a rich repertoire of behaviors for studying cognitive functions. They also have a miniature brain that can be used for measuring activities across brain regions through optical imaging methods. However, reports on the recording of brain activity in behaving adult zebrafish have been scarce. The present study describes procedures to perform two-photon calcium imaging in the dorsal forebrain of adult zebrafish. We focus on steps to restrain adult zebrafish from moving their heads, which provides stability that enables laser scanning imaging of the brain activity. The head-restrained animals can freely move their body parts and breathe without aids. The procedure aims to shorten the time of head restraint surgery, minimize brain motion, and maximize the number of neurons recorded. A setup for presenting an immersive visual environment during calcium imaging is also described here, which can be used to study neural correlates underlying visually triggered behaviors.

Yazar Spotlight: Yetişkin Zebra Balığı Beyin Araştırmalarındaki Gelişmeler 

Here, we present a protocol to perform two-photon calcium imaging in the dorsal forebrain of adult zebrafish.

Davranan Yetişkin Zebra Balıklarında Ön Beyin Aktivitesinin İki Fotonlu Kalsiyum Görüntülemesi

Adult zebrafish (Danio rerio) exhibit a rich repertoire of behaviors for studying cognitive functions. They also have a miniature brain that can be used ...

Ablasyon nöronal nüfusunun iki fotonlu lazer ve kalsiyum görüntüleme ve davranış kayıt zebra balığı larva kullanarak kendi değerlendirme kullanma

Özet

Daha Fazla Video Keşfet

Bu videodaki bölümler

İki foton axotomy ve zaman atlamalı konfokal görüntüleme canlı zebrafish embriyolar

Motor Sinir transeksiyonu ve Canlı Zebra balığı Glial Hücre Davranışlarının Time-lapse Görüntüleme

Zebrabalığı İnternöromast Hücrelerinde Konfokal Mikroskop Tabanlı Lazer Ablasyon ve Rejenerasyon Tonu

Zebrafish Gastrula'da İki Foton Mikroskobu Kullanılarak Derin ve Mekansal Kontrollü Hacim Ablasyonları

Konvansiyonel UV Lazer konfokal mikroskopi kullanılarak Tetikleme Hücre Stres ve Ölüm

Gelişmekte Olan Zebra Balığı Larvalarında Osteoblastların İki Foton Lazer Aracılı Ablasyonu

Gelişmekte Olan Zebra Balığı Larvalarında Osteoblastların İki Foton Lazer Aracılı Ablasyonu

Gelişmekte Olan Zebra Balığı Larvalarında Osteoblastların İki Foton Lazer Aracılı Ablasyonu

Davranan Yetişkin Zebra Balıklarında Ön Beyin Aktivitesinin İki Fotonlu Kalsiyum Görüntülemesi

Davranan Yetişkin Zebra Balıklarında Ön Beyin Aktivitesinin İki Fotonlu Kalsiyum Görüntülemesi