Analisi elettroforetica della replicazione attraverso ripetizioni di DNA a struttura inclini all'episoma umano basato su SV40

Lo scopo della nostra ricerca è quello di caratterizzare la replicazione del DNA di ripetizioni patogene instabili in cellule umane. Speriamo di rispondere a domande come: quali ripetizioni specifiche causano lo stallo della forcella di replicazione? Quali strutture secondarie uniche stanno formando queste ripetizioni?

E come si espandono queste ripetizioni durante la replicazione del DNA? Mentre sappiamo che molte di queste ripetizioni che formano strutture possono compromettere la replicazione del DNA, non è ancora chiaro quali passaggi esatti avvengano dopo. Speriamo che questo protocollo aiuti a rispondere a questa domanda e a far luce sui meccanismi di espansione di queste ripetizioni patogene.

I gel 2D offrono l'opportunità unica di visualizzare effettivamente le strutture in popolazioni relative di molecole che possono sorgere durante la replicazione del DNA. All'interno di un singolo esperimento, si ha essenzialmente la mappa completa di come appare la progressione della replicazione attraverso una specifica sequenza di DNA.