Adaptation aux extrêmes de la vie : évolution expérimentale avec l’archéon extrêmophile Sulfolobus acidocaldarius

La recherche dans notre groupe se concentre sur la compréhension des règles de l’évolution. Dans le cadre de ce projet, nous avons mis au point un nouveau protocole pour étudier l’évolution des microbes thermophiles, à l’aide d’expériences contrôlées en laboratoire. Cela nous permettra de répondre à des questions telles que la façon dont ils réagissent aux changements environnementaux par le biais de l’évolution adaptative.

Le contrôle des conditions de culture constitue un défi majeur. Les thermophiles ont besoin d’environnements à haute température pour leur croissance, ce qui entraîne des taux d’évaporation élevés et le risque de cultures séchées et de plaques de croissance pendant la période d’incubation. Un autre défi est la lenteur des taux de croissance de certains thermophiles, ce qui peut rendre difficile la réalisation de tests d’itération rapide.

Notre protocole aborde les principaux défis associés à la culture de microbes thermophiles à plusieurs températures. Nous avons maintenant une meilleure capacité à contrôler les conditions environnementales, en veillant à ce que les résultats que nous observons soient cohérents et reflètent les conditions expérimentales que nous imposons. Cela nous permettra d’étudier l’adaptation thermophile en temps réel.

Notre protocole offre une méthode à haut débit, non seulement pour la recherche sur les sulfolobus, mais adaptable à une variété de micro-organismes. À l’aide de thermomélangeurs, nous pouvons effectuer des études simultanées à différentes températures, sans avoir besoin de plusieurs grands incubateurs à agitation. Cela réduit également les coûts énergétiques, offrant une voie plus verte pour ce type de recherche.

Nos résultats ouvrent la voie à des expériences d’évolution chez les sulfolobus et d’autres thermophiles. Une grande partie de ce que nous pensons savoir sur l’évolution provient de l’étude des organismes mésophiles, et il y a un risque que nous manquions les règles clés des thermophiles qui nous aideront à expliquer comment la diversité de la vie sur terre a évolué.