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Method Article
Los organoides hepáticos 3D derivados de iPSC humanos constituyen una herramienta potencial para comprender la acción de la hormona tiroidea en el desarrollo del hígado.
La obtención de células hepáticas estables en cultivo supone un reto importante para los estudios hepáticos. Teniendo esto en cuenta, se describe un método optimizado que utiliza células madre pluripotentes inducidas humanas (hiPSC) para generar cultivos 3D de organoides hepáticos humanos (HHO). La utilización de HHO ofrece un enfoque valioso para comprender el desarrollo del hígado, desentrañar las enfermedades hepáticas, realizar estudios de alto rendimiento para el desarrollo de fármacos y explorar el potencial del trasplante de hígado. En la investigación anterior, mediante técnicas de inmunofluorescencia y RT-PCR cuantitativa, se monitorizó la progresión, identificando la presencia de diversas poblaciones celulares, como los hepatoblastos y los dos tipos de células derivadas de hepatoblastos: colangiocitos o células similares a los hepatocitos, en diferentes etapas de desarrollo. Este informe presenta un protocolo 3D sencillo a partir de hiPSC para adquirir HHO que reflejan las etapas del desarrollo del embrión humano. El protocolo, que abarca entre 46 y 50 días, abarca varios pasos: (i) gestión meticulosa del cultivo de hiPSC para generar HHO, (ii) inicio de la diferenciación celular en 2D y la posterior transición a 3D, y (iii) una estrategia de disociación optimizada para descomponer los HHO en células individuales para la secuenciación de ARN de una sola célula. Como ilustración de las amplias aplicaciones de este enfoque, el presente protocolo se aplicó previamente para desentrañar el papel de la señalización de la hormona tiroidea en el desarrollo de las células hepáticas.
El hígado realiza diversas funciones metabólicas, como la regulación de la disponibilidad de sustratos energéticos fácilmente utilizables como la glucosa y los cuerpos cetónicos, así como la desintoxicación de compuestos xenobióticos. En los últimos años, se ha producido un aumento significativo en la prevalencia de enfermedades hepáticas, atribuidas en gran medida a la esteatohepatitis no alcohólica (EHNA), que, si no se tratan, pueden progresar a cirrosis o cáncer1. Por lo tanto, es imperativo comprender las funciones metabólicas del hígado y sus enfermedades relacionadas para facilitar el desarrollo de tratamientos efectivos 2,3.
La aparición de cultivos tridimensionales (3D) ha llevado a la creación del modelo de organoide, que representa un enfoque innovador y revolucionario para abordar la funcionalidad y la complejidad del desarrollo de losórganos. Los organoides se definen como agregados 3D autoorganizados de células diferenciadas que imitan las funciones y la citoarquitectura del órgano respectivo5.
En las últimas décadas, una miríada de protocolos de organoides hepáticos humanos (HHO) ha ganado un interés generalizado, que van desde la utilización de diversas células derivadas de iPSC humanas6 o únicamente células similares a los hepatocitos7 hasta la incorporación de una variedad de microambientes intrincados de factores de crecimiento o inhibidores y la diferenciación de células progenitoras en monocapa7 o 3D8. Estos enfoques se prestan a una multitud de objetivos potenciales, desde el cribado de fármacos de alto rendimiento9 hasta la obtención de más información sobre los mecanismos subyacentes a las enfermedades hepáticas10.
Aquí, se realiza un protocolo paso a paso de diferenciación de HHO basado en las señales químicas mencionadas11 , con variaciones metodológicas adaptadas. Este protocolo comienza con el manejo y cultivo adecuado de células madre pluripotentes inducidas humanas (hiPSC), detallando técnicas para la manipulación del gel de matriz extracelular, el paso de células y la diferenciación en HHO. El proceso comienza estimulando la diferenciación de las hiPSCs en endodermo definitivo (DE)12 y posteriormente imitando los efectos in vivo de FGF y BMP para promover el desarrollo de células monocapa del intestino anterior posterior (PFG)13. La arquitectura 3D se logra el día 10 cuando las células PFG se diferencian en una fase hepática inmadura que se convertirá en los hepatoblastos, la célula precursora fetal de los colangiocitos y hepatocitos2. Finalmente, las estructuras 3D se disocian en células individuales para estudios de secuenciación de ARN. Como ejemplo de la aplicabilidad de este protocolo, se demostró cómo este modelo de HHO se presta para el estudio de la acción de la hormona tiroidea y la desiodinasa tipo 2 (D2) en el desarrollo de hepatocitos y colangiocitos14.
1. Manejo de hiPSC
NOTA: las hiPSC (línea celular CS03iCTR-n3) se compraron comercialmente. El manejo adecuado del recubrimiento de gel de matriz extracelular y el medio hiPSC es clave para unir las hiPSC a las placas y alimentarlas. Aquí, se describieron los volúmenes necesarios para una placa de 6 pocillos. Las hiPSC restantes de la placa de 6 pocillos, que no se diferenciarán en organoides, pueden almacenarse en nitrógeno líquido para su almacenamiento a largo plazo.
2. Diferenciación paso a paso de hiPSC a organoides hepáticos
NOTA: La reconstitución de los reactivos se realizó y siguió de acuerdo con las pautas del fabricante.
3. Disociación unicelular
NOTA: Este paso es crítico para la técnica de secuenciación de ARN de una sola célula. El número de organoides puede variar según el tamaño, y cuanto más antiguo es el día de la disociación, mayor es la cantidad de células en los organoides. En los primeros días, el número de organoides disociados aumentó y los tiempos de disociación se redujeron en cantidades iguales. Se realizó disociación con 10 organoides en D-14 y D-17, 8 organoides en D-23 y D-26, y 6 organoides en D-30 y D-45. Se detallan los procedimientos para un grupo de organoides (Figura 1F).
Cada etapa de este protocolo de diferenciación escalonada de hiPSC a HHOs se definió mediante el uso de mediciones cuantitativas por qPCR e inmunofluorescencia de marcadores específicos de la etapa conocidos de la bibliografía (Figura 2). El paso a paso de ambas técnicas y los resultados obtenidos en relación con la correcta diferenciación en HO se mostraron en14. En la investigación previa, las hiPSCs se definieron a través ...
El protocolo actual ofrece varios detalles metodológicos sobre cómo manejar las hiPSC y los posteriores cultivos de organoides en 3D. Esto incluye los dos pasos críticos principales: (i) la separación de los cultivos 2D y luego su desarrollo en organoides hepáticos 3D después de 10 días, así como (ii) la delicada disociación de una estructura 3D en células individuales. Sobre la base de la información disponible, este es el primer informe de un modelo 3D de HHO para estudiar l...
Antonio C. Bianco es consultor de Abbvie, Acella, Aligos, Synthonics. Los otros autores no tienen divulgaciones relevantes.
Este trabajo contó con el apoyo del Instituto Nacional de Diabetes y Enfermedades Digestivas y Renales (NIDDK -DK58538, DK65066, DK77148; ACB).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
10 µL Universal Pipette Tips Filtered, Low rentention, Pre-sterile | VWR | 613-6462 | All procedures |
1000 µL Universal Pipette Tips Filtered, Low rentention, Pre-sterile | VWR | 613-6470 | All procedures |
15 mL Polypropilene Conical Tube | Falcon (Corning) | 352097 | Dissociation Hepatic Organoids |
200 µL Universal Pipette Tips Filtered, Low rentention, Pre-sterile | VWR | 613-6465 | All procedures |
3,3',5-Triiodo-L-thyronine | Sigma | T2877-100 | Hepatic Organoid differentiation |
40 μm Cell Strainer | Corning | 431750 | Dissociation Hepatic Organoids |
50 mL tube | Falcon (Corning) | 352070 | All procedures |
6 well-plate Nunc Cell-Culture Treated Multidishes | Thermo fisher scientific | 140675 | hiPSC maintenance |
A83-01 | R&D Systems | 2939/10 | Hepatic Organoid differentiation |
Advanced DMEM/F12 | Gibco | 12634010 | Hepatic Organoid differentiation |
ART Wide Bore Filtered Pipette Tips | ART | 2069GPK | All procedures |
B27 supplement | Gibco | 17504044 | Hepatic Organoid differentiation |
BMP7 | R&D Systems | 354-BP-010/CF | Hepatic Organoid differentiation |
Bovine Albumin Fraction V (7.5% solution) | Gibco | 15260037 | Dissociation Hepatic Organoids |
BSA, Fraction V, Fatty Acid Free for Tissue Culture | GoldBio | A-421-100 | Dissociation Hepatic Organoids |
CHIR99021 | R&D Systems | 4423/10 | Hepatic Organoid differentiation |
Corning 96-well Clear Flat Bottom Ultra-Low Attachment | Corning | 3474 | Hepatic Organoid differentiation |
Costar 6-well Clear Flat Bottom Ultra-Low Attachment | Corning | 3471 | Hepatic Organoid differentiation |
CS03iCTR-n3 human induced Pluripotent Stem Cell line | Cedar-sinai | hiPSC maintenance | |
DAPT | R&D Systems | 2634/10 | Hepatic Organoid differentiation |
dbCAMP | Millipore Sigma | D0627-100MG | Hepatic Organoid differentiation |
Dexamethasone | R&D Systems | 1126/100 | Hepatic Organoid differentiation |
DMEM/F12 | Gibco | 11320033 | hiPSC maintenance |
DNAse I, RNase-free, HC | Thermo Fisher scientific | EN0523 | Dissociation Hepatic Organoids |
Falcon 10 mL Serological Pipet, Polystyrene, 0.1 Increments, Individually Packed, Sterile | Corning | 357551 | All procedures |
Falcon 5 mL Serological Pipet, Polystyrene, 0.1 Increments, Individually Packed, Sterile | Corning | 357543 | All procedures |
Falcon 50 mL Serological pipet, Polystyrene, 1.0 Increments, Individually Packed, Sterile | Corning | 357550 | All procedures |
Gentle Cell Dissociation Reagent (GCDR) | Stemcell Technologies | 100-0485 | Hepatic Organoid differentiation |
Glutamax supplement | Gibco | 35050061 | Hepatic Organoid differentiation |
L-Thyroxine | Sigma | T1775-1G | Hepatic Organoid differentiation |
Matrigel hESC-Qualified Matrix, LDEV-free, 5 mL | Corning | 354277 | Extracellular matrix gel |
mFreSR | Stemcell Technologies | 5855 | hiPSC cryopreservation medium |
mTeSR 5x Supplement | Stemcell Technologies | 100-0276 | hiPSC medium |
mTeSR Plus | Stemcell Technologies | 100-0276 | hiPSC medium |
Multi Platform Shaker | Fisherbrand (Thermo Fisher technologies) | 88861021 | Hepatic Organoid differentiation |
N2 supplement | Gibco | 17502048 | Hepatic Organoid differentiation |
Nicotinamide | R&D Systems | 4106/50 | Hepatic Organoid differentiation |
PBS, pH 7.4 | Gibco | 10010023 | hiPSC maintenance |
Recombinant human BMP4 | R&D Systems | 314-BP-010/CF | Hepatic Organoid differentiation |
Recombinant human EGF | R&D Systems | 236-EG-200 | Hepatic Organoid differentiation |
Recombinant human FGF basic/FGF2/bFGF | R&D Systems | 233-FB-010/CF | Hepatic Organoid differentiation |
Recombinant human FGF19 | R&D Systems | 959-FG-025/CF | Hepatic Organoid differentiation |
Recombinant human HGF | R&D Systems | 294-HG-005/CF | Hepatic Organoid differentiation |
Recombinant Human Jagged-1 Fc Chimera | R&D Systems | 1277-JG-050 | Hepatic Organoid differentiation |
Recombinant human KGF/FGF7 | R&D Systems | 251-KG-010/CF | Hepatic Organoid differentiation |
ReLeSR | Stemcell Technologies | 100-0483 | hiPSC detaching medium |
RNAse Inhibitor Ambion, cloned, 40 U/μL | Invitrogen | AM2682 | Dissociation Hepatic Organoids |
RNase Zap | Invitrogen | AM9780 | Dissociation Hepatic Organoids |
Sorvall Legend XT/XF Centrifuge Series | Thermo Fisher Scientific | 75004539 | All procedures |
STEMdiff Definitive Endoderm Kit | Stemcell Technologies | 5110 | Hepatic Organoid differentiation |
Trypan Blue solution (0.4%) | Gibco | 15250061 | Dye solution |
TrypLE Express Enzyme | Gibco | 12604013 | Cell Dissociation enzyme |
Trypsin 0.5% - EDTA (10X) | Gibco | 15400054 | Dissociation Hepatic Organoids |
Valproic acid, sodium salt | R&D Systems | 2815/100 | Hepatic Organoid differentiation |
Vari-Mix Platform Rocker | Thermo Fisher scientific | M79735Q | Dissociation Hepatic Organoids |
Y-27632 dihydrochloride | R&D Systems | 1254 | Hepatic Organoid differentiation |
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