基于琼脂糖的模型生态系统，用于在甲烷-氧反梯度中培养嗜甲烷菌

我们想设计一种简单、廉价的方法，在实验室中培养更接近自然环境的甲烷氧化细菌。我们想这样做是为了发现标准实验室培养条件中缺失的细菌表型，并最终将这些表型与其遗传决定因素联系起来。梯度注射器是先前描述的在甲烷-氧反梯度中培养甲烷菌的方法的简化版本。

这种方法不需要气体底物的持续流动，因此可以并行运行多个重复。我们还可以直接对琼脂糖中培养的细菌进行生化分析。研究人员几乎可以无限制地访问细菌基因组序列，但仍然很难将所有这些信息放在上下文中。

我们的研究结果表明，考虑细菌进化的环境对于更好地了解单个基因的作用至关重要。我们计划使用比较代谢组学和蛋白质组学等技术来更多地了解嗜甲烷菌如何响应它们在甲烷-氧反梯度中的位置。我们还计划在同一个梯度注射器中培养多种菌株，以查看它们在空间分辨环境中如何相互作用。