محاذاة بيانات السلاسل الزمنية المتزامنة باستخدام توصيف فقدان نموذج تزامن دورة الخلية للمقارنات عبر التجارب

يتمثل التحدي الرئيسي لتحليل تجارب السلاسل الزمنية في أنها غالبا ما تختلف في طول فترة التعافي من التزامن وفترة دورة الخلية. لذلك لا يمكن بسهولة مقارنة القياسات من تجارب مختلفة أو تحليلها بشكل إجمالي دون محاذاة. محاذاة شريان الحياة للساعات هي طريقة لإجراء مقارنات خاصة بالطور وذات صلة بيولوجية بين التجارب ولتجميع تجارب متعددة مكررة كان كلاهما صعبا أو مستحيلا في السابق.

تم إجراء مقارنات سابقة خاصة بالمرحلة وذات صلة بيولوجية من خلال تتبع الأحداث البارزة. ومع ذلك ، باستخدام هذه الأساليب المخصصة ، لا تزال الاختلافات الدقيقة ولكن المهمة غير مكتشفة. المقارنة بين تجارب السلاسل الزمنية صعبة بشكل خاص بين التجارب ذات الاختلافات الكبيرة في التوقيت كما هو الحال في المجموعات الطافرة أو ظروف النمو التي تؤثر على وقت استعادة التزامن أو فترة دورة الخلية.

تسمح محاذاة شريان الحياة للساعات بإجراء مقارنة خاصة بالمرحلة في هذه الحالات. لقد استخدمنا الساعات لمحاذاة بيانات نسخ السلاسل الزمنية والبروتينات ، مما سمح بإجراء مقارنة مباشرة بين ديناميكيات mRNA والبروتين المقابل. علاوة على ذلك ، نقوم بمواءمة تجارب السلاسل الزمنية عبر الأنواع المختلفة ، مما يوفر رؤى مهمة حول التغيرات التطورية لدورة الخلية.