Name: preparation of extracellular matrix protein fibers for brillouin spectroscopy
Uploaded: 2016-09-15T15:00:00.000+00:00
Duration: 7 min 19 s
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This work was supported by the Engineering and Physical Sciences Research Council [grant number EP/M028739/1]. RSE was supported by a Santander Postgraduate Research Award 2015.

Cuidado: Por favor, consulte os protocolos de segurança biológica e todas as folhas de dados de segurança pertinentes (MSDS) antes do uso. O laser utilizado nestas experiências é um laser de Classe 3B; conformidade com as regras locais para uma utilização segura do sistema é necessária. Por favor, use todas as práticas de segurança adequadas ao realizar uma medição de espectroscopia a laser, incluindo o uso de equipamento de proteção individual (óculos de segurança). tendões da cauda foram obtidas de 7-8 semanas de idade ratos Wistar sacrificados para outros fins, em conformidade com a regulamentação da UE 1099/2009 e o bem-estar dos Animais (abate ou morte) Regulations 1995. Bovinos ligamento da nuca foram obtidos a partir de um matadouro local. 1. Preparação da Amostra As fibras NOTA: fibras de proteína da matriz extracelular podem ser extraídos a partir de vários tecidos, utilizando procedimentos diferentes. Protocolos foram refinados com base em procedimentos amplamente aplicadas. <ol><li><strong&gt; Extração de fibras de colagénio de cauda de rato <ol><li> Sacrificar um rato por injecção intra-peritoneal de 100 mg / kg de pentobarbitona de sódio de peso corporal. Em seguida, cortar a cauda diretamente para o ponto de contato com o corpo, pressionando para baixo com uma lâmina de ponta única. Enrole a cauda em película aderente e armazená-lo congeladas a -20 ° C até ser necessário. </li><li> Recolhe-se o rabo do congelador, cortar um segmento de 20 mm de comprimento a partir da extremidade proximal, enquanto ainda congelado e, em seguida, deixar a descongelar em uma placa de Petri cheio com solução salina tamponada (PBS), solução de fosfato (pH 7,4) à temperatura ambiente. </li><li> Uma vez que a cauda é descongelada, fazer uma incisão ao longo do comprimento do segmento utilizando um bisturi para dividir a pele. Em seguida, descasque para trás para revelar quatro pacotes tendão bainha sobre a vértebra da cauda. </li><li> Usando uma pinça fina e tomando cuidado para não aplicar qualquer pré-tensão, gentilmente desenhar cada fibra de fora da bainha e colocá-lo em um frasco contendo água destilada com 0,01% w / v de azida de sódio (NaN 3) para prcrescimento bacteriano evento, e armazenar refrigerado. A cauda único produz cerca de trinta fibras do tendão. </li><li> Para obter o tipo fibroso puro colágeno I, aplicar um processo de digestão enzimática de três porções 10 das fibras do tendão para remover os proteoglicanos e todos os outros materiais noncollagenous. <ol><li> Em primeiro lugar, as fibras de mergulhar em 0,125 U / ml de condroitinase ABC em tampão Tris 0,05 M e acetato de sódio 0,06 M (CH3 COONa) a pH 8,0 durante 24 horas a 37 ° C numa incubadora com agitação a 200 rpm. </li><li> Em seguida, mergulhar as fibras em 1 U / ml de hialuronidase de Streptomyces em tampão Tris 0,05 M e 0,15 M de cloreto de sódio (NaCl) a pH 6,0 e retornar para o incubador com agitação durante 24 h a 37 ° C. </li><li> Finalmente, as fibras imergir em 1 mg / ml de tripsina em tampão fosfato de sódio 0,05 M (NaHPO4) e NaCl 0,15 M a pH 7,2 durante 16 horas na incubadora com agitação a 37 ° C. </li></ol></li><li> Armazenar as fibras purificadas refrigerados em frascos contendo água destilada, with 0,01% de NaN3 para prevenir o crescimento bacteriano, até ser necessário para a medição. </li></ol></li><li> Extração de fibras de elastina do ligamento da nuca bovina <ol><li> Obter ligamento da nuca bovina do matadouro, envolvê-la em filme plástico e guarde-congeladas a -20 ° C até o uso. </li><li> Para produzir elastina puro, recolher o ligamento do congelador, permitir a descongelar à temperatura ambiente, secar-lo utilizando um bisturi e digerir o ligamento num banho de água em ebulição de acordo com o procedimento Lansing, 11 como se segue. <ol><li> Prepara-se uma solução de hidróxido de sódio (NaOH), em água destilada a 0,1 M e adicioná-lo ao ligamento desengordurada num balão cónico, cobrindo o tecido. </li><li> Ferver o balão num banho de água a 95 ° C durante 45 min. </li><li> Remover o ligamento do frasco de digestão e lavar o bloco de tecido insolúvel na água destilada repetidamente até pH 7,0 (monitorizado utilizando um medidor de pH) é obtido. </li><li> Remover o tecido a partir da últimasolução de lavagem e pode ser mergulhado em água destilada (misturado com 0,01% de NaN3 para prevenir o crescimento bacteriano) num recipiente selado e armazená-lo refrigerado. </li></ol></li><li> Recolher o tecido do frigorífico e, tomando cuidado para não aplicar muita força e pré-tensão, use uma pinça para puxar delicadamente segmentos menores elastina (20 a 50 mm de comprimento, cerca de 2 mm de espessura) de distância do bloco maior e colocá-los numa placa de Petri com solução de PBS (pH 7,4). </li><li> Usando uma pinça fina, gentilmente provocar pequenos feixes de fibras em torno de 1 mm de espessura e cortá-los em comprimentos de alguns mm utilizando um bisturi. </li><li> Colocar as fibras para frascos contendo água destilada (com 0,01% de NaN3 para prevenir o crescimento bacteriano) e armazená-los refrigerado até ser necessário para a medição. </li></ol></li><li> Montagem das fibras no substrato reflexivo <ol><li> Usando um cortador de diamante, corte um pedaço de slides silicone reflexiva. </li><li> Para criar um compartme hidratadont, corte uma tira de Parafilm para caber sobre a lâmina de silicone com um corte oco no centro (grande o suficiente para caber uma fibra) e colocá-lo sobre o substrato de silicone. NOTA: Para medições de fibra seca, cortada a parafilme em forma de U de modo a que um dos quatro lados fica aberto para o ar, quando selada no passo 1.3.4. </li><li> Remover as fibras do frigorífico, usar um par de fórceps finos para recolher uma única fibra a partir da solução de armazenamento e colocá-la numa pequena placa de Petri cheia de água pura à temperatura ambiente durante 5 minutos para lavar a amostra. Em seguida, recolher a fibra e transferi-la para o centro da cavidade parafilme no substrato de silicone. Atenção: Evite danificar a fibra esticando-lo durante esta operação, e evitar a reorientação da amostra sobre o substrato, pois isso pode causar uma mudança nas propriedades mecânicas. </li><li> Coloque uma lamela de vidro fino sobre a fibra e selar a câmara pela passagem de um ferro de solda aquecido suavemente sobre a superfície do vidro para derreter o parafilme abaixoo copo. Atenção: Evite danificar a fibra por não trazer a ponta de solda muito perto ou aquecimento do substrato excessivamente. </li><li> Coloque a câmara selada sobre uma superfície plana sob um peso pequeno e deixá-lo durante cerca de 12 horas para atingir um bom contacto entre a amostra e substrato de silício, evitando danos à amostra. </li><li> Remover o peso e fixar a câmara no lugar sobre o substrato, por meio de parafusos. </li></ol></li></ol> 2. Configurando o Experimento de Brillouin e aquisição de fibra Spectra <ol><li> Preparação de amostra do compartimento <ol><li> Monte da amostra preparada como na parte 1.3 em um suporte vertical, equipado com um goniómetro para permitir a rotação no plano da amostra, mantendo um ângulo de espalhamento constantes (2 Φ = 90 °, ver a figura SI-1) e dispersando a posição de volume. </li><li> Execute um ajuste de foco preciso da luz do laser sobre a amostra através do lens. 9 Cuidado: A potência de saída do laser pode ser demasiado elevada e produzir uma queimadura na amostra. Certifique-se de que ele está definido suficientemente elevado para dar uma boa sensibilidade, mas não muito alto para evitar danos à amostra. Aqui usamos uma potência de cerca de 76 mW na amostra. Este foi suficiente para obter uma boa sensibilidade sem queima da amostra, considerando também que este é fina e em contacto com um substrato que ajuda a dissipar o calor gerado pela iluminação do laser. </li><li> Posicionar a amostra num ângulo de 45 ° (Φ) para o feixe de laser incidente, utilizando uma escala de Vernier. Atingir o posicionamento óptimo, executando uma medida e maximizar a intensidade dos picos no espectro (ver abaixo). </li></ol></li><li> Configurando o espectrômetro <ol><li> Abra o software de aquisição e manipulação dos dados e configurar a aquisição de um espectro de Brillouin da amostra 12. O procedimento aqui descrito é aplicável à MUltipass interferómetro em tandem (Figura SI-1A). </li><li> Alinhar as duas Fabry-Perot (FP) interferómetros de mudança de forma independente as tensões aplicadas ao piezo pela unidade de controlo. Para este procedimento de pré-alinhamento, observar a luz refletida por cada FP. Quando a intensidade reflectida pelos dois PQ tende para zero, o alinhamento correcto é atingido. </li><li> Calibra-se o espectro de: a gama de frequências acessível, ou livre gama espectral (FSR), está dependente da distância entre os dois espelhos da primeira cavidade de PF, G, através FSR = c / 2 L, onde C é a velocidade da luz e L é medido por um medidor-marcação. </li><li> Sincronizar os scans dos dois interferômetros FP e mudar o sistema óptico para a configuração tandem multipass. Um controlo de realimentação de intensidade de luz laser transmitida irá manter automaticamente o alinhamento dos dois PQ durante a medição. </li></ol></li><li> medição of Brillouin Spectra Cuidado: O espectro de Brillouin é altamente dependente da temperatura e hidratação da amostra e de controlo de forma cuidadosa destes parâmetros é a chave para a obtenção de espectros reprodutível. <ol><li> Iniciar a aquisição de um espectro de Brillouin da amostra e executá-lo até uma boa relação sinal-ruído é alcançado. Isso pode levar vários minutos, dependendo do espalhamento de seção transversal, a concentração ea espessura da amostra. NOTA: Não há uma regra de ouro para a relação sinal-ruído, mas a qualidade espectral é verificada pelo experimentalista com base na amostra específica analisada. Há um trade-off entre a qualidade ea duração da medição espectral, portanto, os parâmetros experimentais precisam ser selecionados de acordo com a aplicação específica. </li><li> Para a medição de uma amostra seca, tomar espectros sucessiva - para cada um deles, seguindo o passo 2.3.1 - até que não haja mudanças na posição dos picos is observados. Isto é conseguido quando a amostra está em equilíbrio com a atmosfera ambiente e sem secagem adicional irá afectar o espectro. </li><li> Seleccionar a polarização de luz (VV ou VH; V meios vertical e H para a direcção horizontal da polarização da luz em relação ao plano de espalhamento) e adquirir espectros em cada ângulo em relação ao eixo da fibra (θ; Figura SI-1), rodando a amostra em de avião com a mão. </li><li> Salve o espectro de Brillouin para o arquivo para posterior processamento. </li></ol></li></ol> 3. Análise de Brillouin Spectra NOTA: análise de ajuste de Brillouin picos pode ser realizada utilizando várias funções. Uma função de oscilador harmônico (DHO) 4,13 amortecida foi selecionado como este é um modelo válido para picos provenientes de modos acústicos amortecidos em meio visco-elástico. <ol><li> Análise de ajuste de picos de Brillouin <ol><li> Selecione a faixa espectral para o pico de interesse em the espectro de Brillouin. </li><li> Activar uma linha de base no ajuste se o fundo espectral é muito maior do que zero. NOTA: A linha de base pode variar entre espectros. Certifique-se de que a correção é aplicada de forma sistemática e reproduzível. </li><li> Aplicar um detalhado mínimos quadrados ajustadas usando uma função DHO 4,13 para o pico Brillouin de interesse de forma iterativa até atingir a convergência ea melhor ajuste de curva é obtida. Em seguida, salve os resultados de ajuste para o arquivo. </li><li> Obter valores médios dos parâmetros de ajuste dos dois picos de cada dupleto Brillouin. </li><li> Calcula-se a velocidade da onda acústica da frequência de pico (usando a expressão abaixo). </li><li> Plotar os resultados de ajuste através de gráficos, por exemplo, a velocidade da onda acústica vs. ângulo para eixo da fibra, θ E aplicar modelos relevantes (por exemplo, para sistemas acusticamente anisotrópicos 9) para extrair quantidades mecânicas, tais como coeficientes de elasticidade tensor. </li></ol>
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	<li>Brillouin, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Diffusion+de+la+lumi&#232;re+et+des+rayonnes+X+par+un+corps+transparent+homog&#232;ne;+influence+de+l'agitation+thermique.">Diffusion de la lumi&#232;re et des rayonnes X par un corps transparent homog&#232;ne; influence de l'agitation thermique.</a> Ann. Phys. 17, 88-122 (1922).</li><li>Caponi, S., Corezzi, S., Mattarelli, M., Fioretto, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stress+effects+on+the+elastic+properties+of+amorphous+polymeric+materials.">Stress effects on the elastic properties of amorphous polymeric materials.</a> J. Chem. 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H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+vivo+Brillouin+optical+microscopy+of+the+human+eye.">In vivo Brillouin optical microscopy of the human eye.</a> Opt. Express. 20 (8), 9197-9202 (2012).</li></ol>

The authors have nothing to disclose.

espectroscopia de difusão de Brillouin é uma ferramenta única, através da qual os componentes individuais do tensor de elasticidade de uma fibra de proteína pode ser caracterizada em detalhe sem precedentes. Além disso, as medições podem ser feitas em uma escala microscópica e, assim, vai nos fornecer novas perspectivas sobre os mecanismos de micro-escala de estruturas biológicas, permitindo, pela primeira vez, para compreender a mecânica, e provavelmente funcional, a significância das complexidades na arquitectura de matriz e bioquímica que foi revelado nos últimos anos. A técnica mede propriedades mecânicas em uma faixa de freqüência GHz. Este domínio nunca foi explorado antes de biopolímeros estruturais e ambos levanta e fornece os meios para responder a perguntas fundamentais sobre mecanismos moleculares de elasticidade. Nós descrevemos as etapas para extrair as fibras de colágeno e elastina em tecidos animais e para medir Brillouin scatteriOs espectros ng utilizando um substrato reflectora para conseguir a descrição completa da biomecânica da fibra. As etapas críticas no âmbito do protocolo são aqueles que asseguram que as fibras purificadas são obtidos e as condições experimentais apropriados estão no local para medições reprodutíveis das proteínas fibrosas. No entanto, deve ter-se em conta que os processos de extracção pode modificar as propriedades mecânicas das fibras. Modificações da técnica envolve o acoplamento com microscopia óptica de espalhamento de Brillouin microfototerapia e mapeamento se aproxima de 13 e a possível combinação com técnicas complementares (por exemplo, espalhamento Raman). As aplicações atuais da técnica estão principalmente concentradas em materiais biológicos excisadas, mas os desenvolvimentos importantes, como por exemplo, aquelas baseadas em múltiplas etalons Vipa 14, estão tornando possível a tradução desta técnica a partir da bancada à cabeceira com uma gama de aplicações já demonstrated 15,16 incluindo potencial em aplicações in vivo. A abordagem VIPA é uma alternativa ao que descrevemos; que tem o tempo de aquisição mais rápida, mas não é necessariamente adequado, no caso de amostras opacos, tais como aqueles aqui analisados. Além disso, a utilização de um substrato reflectora não é prático em set-ups que utilizam os etalons Vipa porque o seu contraste não seria suficiente para rejeitar a luz quasi-elástica. Limitações relacionadas com a velocidade de aquisição de um conjunto de dados espectrais e da secção transversal da dispersï¿½ inerentemente fraco do material pode limitar aplicações para sistemas biológicos dinâmicos e para a aquisição de dados de dentro de tecidos, mas aperfeiçoamentos técnicos podem melhorar o desempenho atual. BLS promete ser uma ferramenta importante na investigação biofísica fundamental sobre a matriz extracelular e, assim, produzir novos insights sobre a evolução das propriedades mecânicas durante o crescimento da matriz e sua perda no patológicadegeneração. No entanto, é importante lembrar que as medições são não-invasiva e, portanto, pode ser realizada in vivo. Com efeito, este já tiver sido atingido na córnea 16 e esse trabalho pode fornecer uma plataforma para o desenvolvimento de novos instrumentos de diagnóstico para uma larga gama de doenças do tecido conjuntivo. O ultra-som a elastografia e microscopia de força atómica (AFM) são métodos alternativos de medição micromecânica, mas a técnica BLS oferece melhor resolução espacial (numa escala subcelular) do que o anterior e, ao contrário da AFM, não impõe forças mecânicas sobre o espécime e não se restringe a a análise única de características da superfície. módulos de Brillouin de colagénio e elastina são na gama GPa, enquanto módulos de Young a partir de estirpes macroscópicas são da ordem de Mpa (mais detalhes serão relatadas em outra). Este resultado indica um módulo de elasticidade diferencial com uma forte dependência da frequência de excitação, em virtudeo comportamento visco-elástico das fibras. BLS pode ser aplicado a uma ampla gama de problemas e materiais em ciências biomédicas. Pode ajudar a responder a perguntas sobre a fisiologia e patologia dos tecidos biológicos, assim como proporcionar um instrumento físico para a compreensão fundamental dos materiais e das interacções ao nível molecular.

O efeito de luz espalhamento de Brillouin (BLS) foi descoberto por Léon Brillouin em 1922. 1 Consiste na espalhamento inelástico da luz visível por fônons acústicos termicamente ativados em um material. Em física do estado sólido, fônons acústicos são vibrações coerentes de todos os átomos em uma grade. Uma cadeia unidimensional de dois tipos alternados de átomos numa estrutura é um modelo simples que ilustra a diferença entre fonões acústicos, reveladas por BLS, e fonões ópticos, sondados por absorção de IV e Raman (Figura 1). fonões acústicos estão em fase movimentos de átomos na cadeia com um deslocamento ao longo da direcção de propagação (fonões acústicos longitudinais) ou perpendicular à direcção de propagação (transversais fonões acústicas), enquanto fonões ópticos são movimentos fora-de-fase dos átomos a produção de um momento de dipolo eléctrico oscilante (longitudinal ou modos transversais). BLS spectroscopy tem sido utilizado em ciência analítica desde 1920; No entanto, apenas desde a década de 1980 medições de alto contraste foi possível através da utilização do conjunto de passagem múltipla espectrómetro de Fabry-Perot. Desde então, um número crescente de avanços em SBV para aplicações analíticas em matéria condensada (onde a interação fóton-phonon é explorada) 2-4 e magnéticas de materiais (através da interação fóton-magnon) 5 foi trazido. Obras seminais sobre aplicações biomédicas 6-8 abriram o caminho para o desenvolvimento de várias abordagens, incluindo o aplicado aqui e o descrito anteriormente 9 utilizando um substrato reflexivo em uma configuração semelhante a plaquetas para conseguir a descrição completa do tensor elasticidade da uma amostra. No presente trabalho, nós aplicamos a espectroscopia BLS para os constituintes fundamentais da matriz extracelular em tecidos conjuntivos, as proteínas fibrosas elastina e tipo I-colágeno. Tipo I colagénio é uma molécula helicoidal rígida, triplo que monta lateralmente e longitudinalmente, com extensa de ligações cruzadas para formar fibras essencialmente rígidos em tecidos tais como tendões. Redes de colágeno, muitas vezes co-existir com as redes de elastina, uma proteína que, excepcionalmente, gera de longo alcance elasticidade através de uma combinação de entropia e interações hidrofóbicas com o seu ambiente e é essencial para as funções de tecidos tais como pulmões e pele. Ambas as fibras são modeladas utilizando um modelo de cristal hexagonal na pesquisa atual. 9 Na parte 1, nós descrevemos o protocolo para extrair as fibras de tecidos animais e para preparar a amostra para as medições espectroscópicas. Na parte 2, o procedimento para configurar o aparelho de Brillouin e aquisição de espectros a partir das fibras é apresentado. Parte 3 apresenta detalhes da análise de dados aplicados aos espectros de Brillouin para extrair a informação relevante mecânica nele contidas. Em seguida, os resultados representativos são apresentados e Discussed.

<table><tbody><tr><td>&lt;strong&gt;Chondroitinase ABC&lt;/strong&gt;</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C2905</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Tris Buffer&lt;/strong&gt;</td><td>Fluka</td><td>93358</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Sodium Acetate&lt;/strong&gt;</td><td>Fisher Scientific</td><td>S608-500</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;PBS&lt;/strong&gt;</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P4417</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Sodium Azide&lt;/strong&gt;</td><td>Fisher Scientific</td><td>S2002</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Streptomyces Hyaluronidase&amp;nbsp;&lt;/strong&gt;</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>H1136-1AMP</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Sodium Chloride&lt;/strong&gt;</td><td>Fisher Scientific</td><td>S7653</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Trypsin&lt;/strong&gt;</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>T4665</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Sodium Phosphate&lt;/strong&gt;</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S9638</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Sodium Hydroxide&lt;/strong&gt;</td><td>Fisher Scientific</td><td>S320-500</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Pure Water&lt;/strong&gt;</td><td>Millipore</td><td>ZRQS0P3WW</td><td>Produced in-house</td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Distilled Water&lt;/strong&gt;</td><td>Bibby Scientific Limited</td><td>D4000</td><td>Produced in-house from water still</td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Euthatal&lt;/strong&gt;</td><td>Merial&amp;nbsp;</td><td>J01601A&amp;nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Tandem Interferometer TFP-1&lt;/strong&gt;</td><td>JRS Scientific Instruments</td><td></td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Freezer&lt;/strong&gt;</td><td>Lec</td><td>TU55144</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Refrigerator&lt;/strong&gt;</td><td>Zanussi</td><td>ZBA15021SA</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Hot Plate&lt;/strong&gt;</td><td>Fisher Scientific</td><td>SP88857206</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Clamps&lt;/strong&gt;</td><td>VWR</td><td>241-7311 &amp;amp; 241-7201</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Clamp Stand&lt;/strong&gt;</td><td>VWR</td><td>&amp;nbsp;241-0093</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Thermometer&lt;/strong&gt;</td><td>Fisher Scientific</td><td>13-201-401</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Cling Film&lt;/strong&gt;</td><td>Sainsbury&#039;s</td><td>7650540</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Parafilm&lt;/strong&gt;</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P7793-1EA</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Silicone&lt;/strong&gt;</td><td>IDB Technologies</td><td>N/A</td><td>No catalogue number. Order upon request.</td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Cover Glass&lt;/strong&gt;</td><td>VWR</td><td>631-1571</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Conical Flask&lt;/strong&gt;</td><td>VWR</td><td>214-1175</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Beaker&lt;/strong&gt;</td><td>VWR</td><td>213-0469</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Measuring Cylinder&lt;/strong&gt;</td><td>VWR</td><td>612-3838</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Vial&lt;/strong&gt;</td><td>VWR</td><td>548-0051 &amp;amp; 548-0863</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Petri Dish&lt;/strong&gt;</td><td>VWR</td><td>391-0441</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Scalpel&lt;/strong&gt;</td><td>Swann Morton Ltd</td><td>&amp;nbsp;0914 &amp;amp; 0308</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Diamond Scribe&lt;/strong&gt;</td><td>RS Instruments</td><td>394-217</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Soldering Iron&lt;/strong&gt;</td><td>RS Instruments</td><td>231-5332</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Fine Forceps&lt;/strong&gt;</td><td>VWR</td><td>232-0188</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Double Micro-Spatula&lt;/strong&gt;</td><td>VWR</td><td>Various Sizes</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;pH Meter&lt;/strong&gt;</td><td>Hanna Instruments</td><td>HI-2210-02</td><td></td></tr><tr><td>&lt;strong&gt;Orbital Shaker&lt;/strong&gt;</td><td>IKA</td><td>&amp;nbsp;0002819000</td><td></td></tr></tbody></table>

preparation of extracellular matrix protein fibers for brillouin spectroscopy

Brillouin spectroscopy is an emerging technique in the biomedical field. It probes the mechanical properties of a sample through the interaction of visible light with thermally induced acoustic waves or phonons propagating at a speed of a few km/sec. Information on the elasticity and structure of the material is obtained in a nondestructive contactless manner, hence opening the way to in vivo applications and potential diagnosis of pathology. This work describes the application of Brillouin spectroscopy to the study of biomechanics in elastin and trypsin-digested type I collagen fibers of the extracellular matrix. Fibrous proteins of the extracellular matrix are the building blocks of biological tissues and investigating their mechanical and physical behavior is key to establishing structure-function relationships in normal tissues and the changes which occur in disease. The procedures of sample preparation followed by measurement of Brillouin spectra using a reflective substrate are presented together with details of the optical system and methods of spectral data analysis.

O aparelho de espectroscopia de Brillouin utilizado nesta experiência (Figura 1A-SI) foi anteriormente descrito. 9 Ela emprega um único modo de 532 nm do laser de estado sólido com potência de saída de 76 mW a amostra. Uma lente acromática 20 centímetros foca a luz de laser sobre a amostra e recolhe a luz dispersa a partir da amostra de uma geometria de retroespalhamento. Um conjunto de passagem múltipla de Fabry-Perot é usado para filtrar a luz dispersa, que é então detectado por um detector de fotodiodo de baixo ruído. Esta abordagem dá um contraste extremamente elevado (cerca de 120 dB) e estabilidade através de auto-alinhamento piezo-digitalização dos etalons. Um polarizador e o analisador são introduzidos para seleccionar a polarização da luz incidente e espalhada. Os espectros são obtidos geralmente com o polarizador mantido fixo seleccionando o sentido vertical (V) da polarização da luz incidente e o analisador seleccionar alternativamente à vertical (V) OR (H) horizontal da direcção da polarização da luz difundida. Nesta configuração, os modos acústicos longitudinais e transversais são detectados, respectivamente. Um espectro de Brillouin típico tem um pico central intensa devido à dispersão elástica e um ou mais conjuntos de picos igualmente deslocado, ou dupletos de Brillouin, que são o assinatura da mecânica da amostra. Nestas medições, a luz dispersa pode ter origem, tanto a partir de fonões granel que viajam quasi-ortogonal para a amostra e, depois da reflexão da luz incidente na interface substrato-amostra, de fonões granel viajar paralela à superfície (modos PS). 9 A Figura 2 mostra os espectros de SBV de fibras de colagénio digerido com tripsina e secos hidratados obtidos com polarização VV em 0.2 resolução GHz, com uma gama espectral livre de 30 GHz e cerca de 10 min de tempo de recolhapor espectro. Cada espectro corresponde a um ângulo específico de rotação, θ (Figura SI-1C). Em fibra de colagénio seco a θ = 0 °, modos longitudinais dar origem a um pico de massa a (18,92 ± 0,02) GHz, enquanto o modo de PS é de (9,85 ± 0,03) GHz (Figura 2A). As mudanças PS pico para frequências mais baixas como θ vai de 0 ° (phonon sondando a orientação axial da fibra) e 90 ° (phonon sondando a orientação radial), enquanto que o pico de massa apenas ligeiramente vermelha-Deslocamentos ao mudar θ no mesmo intervalo (phonon sondando uma direção quasi-radial ao longo da rotação). Em fibras de colágeno molhado, os dois picos devido a fônons longitudinais são essencialmente inalterada durante todo o experimento, com o pico de massa a cerca de 10,5 GHz eo pico PS em 4.9 GHz (Figura 2B). Isto indica uma redução de 80 a 100% na frequência de pico (em relação aos dados de 18,92e 9.85 GHz), respectivamente, e, portanto, da rigidez do material, devido à hidratação. Note-se que os modos granel e PS de colágeno hidratado se encontram perto da frequência aos modos de água pura, sugerindo que suas constantes elásticas são uma combinação das contribuições de água e fibra, com um papel dominante desempenhado pela água. A Figura 3 mostra um espectro de fibra de colagénio digerido por tripsina seco medido no θ = 30 ° com VH de polarização; um vazamento de polarização VV permite que o PS e os picos de massa para ainda ser observados. Modos transversais representam um pico a (4,1 ± 0,2) GHz (θ = 0 °) que leve azul-turnos como mudanças q de 0 ° a 90 °. resultados de ajuste tanto para a transversal e picos PS são também mostrados. Parâmetros de pico foram extraídos e velocidades de ondas acústicas foram derivados como V L = λ v / √2, onde <em&gt; v é a frequência de modo a obtida por análise de ajuste de curva dos picos e λ é o comprimento de onda de excitação, 532 nm. Note que nesta geometria, o conhecimento do índice de refracção do material não é necessária para obter a velocidade de modo acústico (devido à geometria do espalhamento, q s = 2 k i sin (Φ); Figura SI-1b, c), daí tornando esta abordagem especialmente vantajosa. A Figura 4 é um gráfico das velocidades de ondas acústicas obtidos a partir de modos longitudinais e transversais (picos PS e T) como uma função do ângulo θ . Análise de ajuste para um modelo de hexagonal simétrica elástica sólida 7 - Equações A1 e A2 abaixo - oferece os cinco componentes do tensor elasticidade do tipo digerido por tripsina seco I fibras de colágeno (Tabela 1). 9 <img alt="equação 1" src="/files/ftp_upload/54648/54648eq1.jpg" /> , (A1) <img alt="equação 2" src="/files/ftp_upload/54648/54648eq2.jpg" /> , (A2) onde ρ é a densidade do material, e C 11, C 33, C 44 e C 13 são quatro dos cinco constantes elásticas que caracterizam os sistemas com uma simetria hexagonal. O quinto constante, C 12, pode ser derivada a partir da relação aproximada C ~ 12 C 11 -. 2 C 44 7 Os coeficientes são semelhantes aos anteriormente obtido a partir de colagénio não purificada fibers. 9 A diferença notável ocorre para o coeficiente c 13 que se reflete em valores similares do módulo elástico E ǁ e E <img alt="Perpendicular" src="/files/ftp_upload/54648/54648fig_flippedT.jpg" /> (Aproximadamente 7,2 e 7,7 GPa) para o colagénio purificado. A Figura 5 é um gráfico da velocidade de onda acústica longitudinal do colagénio molhado contra θ . Neste caso, nenhuma mudança periódica da frequência é observada, dando uma velocidade constante dentro do erro. A Figura 6 mostra os espectros de fibras de elastina e secos hidratados medidos em q = 0 °. modos transversais não foram detectados por estas amostras. Em elastina seca, o pico de massa ocorre a 16,8 GHz, enquanto o modo PS em 8,2 GHz 9 (13 e 20% menor do que os picos correspondentes de colágeno seca). fibras de elastina molhadas apresentar um volume pEAK em (12,30 ± 0,01) GHz (37% mais baixa em frequência do que o pico de grandes quantidades de elastina seco). O modo de PS de elastina molhada não é evidente no espectro devido à intensa cauda do pico elástica nessas frequências. Por outro lado, o pico a cerca de 7,5 GHz é atribuída à água a granel. A Figura 7 mostra a dependência da velocidade de onda acústica em fibras de elastina seca sobre θ. A partir destes dados, as componentes do tensor (elasticidade e módulos mecânica) foram obtidos (Tabela 1). 9 Tal como no colagénio molhados, há evidências de isotropia do módulo de mecânica de fibras de elastina hidratadas. Estes resultados indicam como espectroscopia de Brillouin pode dar informação relevante sobre a rigidez, a composição e os aspectos estruturais do material. <img alt="figura 1" src="/files/ftp_upload/54648/54648fig1.jpg" /> Figura 1. acústica e fonões ópticos em cadeia unidimensional de átomos. Diagrama esquemático de vibrações acústicas e ópticos numa cadeia diatómico unidimensional. Átomos têm massa m 1 e m 2 e são alternadas. As setas indicam os deslocamentos dos átomos. <a href="https://jove.unicartagenaproxy.elogim.com/files/ftp_upload/54648/54648fig1large.jpg" target="_blank">Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.</a> <img alt="Figura 2" src="/files/ftp_upload/54648/54648fig2.jpg" /> Figura 2. Espectros de Brillouin do tipo-tripsina purificada eu fibras de colagénio de tendão de cauda de rato. Os espectros de (A) fibra seca e (B) a partir de medições de fibra hidratado VV em ângulo diferente em relação ao eixo θ fibra, em graus. Um espectro de água destilada pura também é mostrada. Os espectros foram normalizados para a intensidade (altura) do pico de massa.<html> Etiquetas B e PS denota picos relacionados com grandes quantidades e modos paralelos-a-superfície, respectivamente. As barras de erro indicam o erro padrão (raiz quadrada do número de contagens). <a href="https://jove.unicartagenaproxy.elogim.com/files/ftp_upload/54648/54648fig2large.jpg" target="_blank">Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.</a> <img alt="Figura 3" src="/files/ftp_upload/54648/54648fig3.jpg" /> Figura 3. espectro de Brillouin do tipo purificado-tripsina seco I fibras de colágeno de tendão de cauda de rato. Espectro de uma medição de VH em θ = 30 °. Etiquetas T, PS e B denotam picos relacionados com transversais, modos paralelas-a-superfície e em massa, respectivamente. Os resultados de análise de ajuste utilizando um modelo amortecida oscilador harmónico (DHO) para ambos os modos de T e de PS também são mostrados. As barras de erro indicam o erro padrão (raiz quadrada do número de contagens)./54648fig3large.jpg &quot;Target =&quot; _ blank &quot;&gt; Clique aqui para ver uma versão maior desta figura. <img alt="Figura 4" src="/files/ftp_upload/54648/54648fig4.jpg" /> Figura 4. Lote da velocidade de onda acústica em colagénio purificado por tripsina seco vs ângulo em relação ao eixo da fibra. Velocidades de onda acústica longitudinais e transversais de fibra de colagénio seco derivados de análise de ajuste dos picos de Brillouin. Os dados são ajustados a um modelo de um sólido elástico hexagonal simétrico. A linha vermelha: Equação A1 (R 2 = 0,99); linha azul: Equação A2 (R 2 = 0,36). As barras de erro indicam os erros-padrão obtidos a partir da raiz quadrada dos elementos da diagonal da matriz de covariância depois de um não-lineares Levenberg-Marquardt mínimos quadrados ajuste dos espectros de Brillouin. <a href="https://jove.unicartagenaproxy.elogim.com/files/ftp_upload/54648/54648fig4large.jpg" target="_blank">Por favor clique aqui para ver uma versi maiores</a><html> em dessa figura. <img alt="Figura 5" src="/files/ftp_upload/54648/54648fig5.jpg" /> Figura 5. Lote de velocidade da onda acústica longitudinal no colágeno purificado-tripsina molhada vs ângulo para eixo da fibra. Velocidade da onda acústica longitudinal da fibra de colágeno hidratado derivada de análise de ajuste dos picos de Brillouin. A linha mostrada é um guia para o olho e o valor médio da velocidade de onda acústica nesta gama. As barras de erro indicam os erros-padrão obtidos a partir da raiz quadrada dos elementos da diagonal da matriz de covariância depois de um não-lineares Levenberg-Marquardt mínimos quadrados ajuste dos espectros de Brillouin. <a href="https://jove.unicartagenaproxy.elogim.com/files/ftp_upload/54648/54648fig5large.jpg" target="_blank">Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.</a> jpg &quot;/&gt; Figura 6. Espectros de Brillouin das fibras de elastina de ligamento de bovino da nuca. Espectros de fibra seca e hidratada em θ = 0 °. Os espectros foram normalizados para a intensidade (altura) do pico de massa. Etiquetas B e PS denota picos relacionados com grandes quantidades e modos paralelos-a-superfície, respectivamente. B F B e W referem-se aos picos de massa da fibra e água, respectivamente. As barras de erro indicam o erro padrão (raiz quadrada do número de contagens). <a href="https://jove.unicartagenaproxy.elogim.com/files/ftp_upload/54648/54648fig6large.jpg" target="_blank">Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.</a> <img alt="Figura 7" src="/files/ftp_upload/54648/54648fig7.jpg" /> Figura 7. Parcela da velocidade da onda acústica longitudinal na elastina seco vs ângulo para eixo da fibra. Velocidade da onda acústica Longitudinal de lorota elastina secoer derivada de análise de ajuste dos picos de Brillouin. Os dados são ajustados a um modelo de um sólido elástico hexagonal simétrico. Linha vermelha: Equação A1 9 (R 2 = 0,74). As barras de erro indicam os erros-padrão obtidos a partir da raiz quadrada dos elementos da diagonal da matriz de covariância depois de um não-lineares Levenberg-Marquardt mínimos quadrados ajuste dos espectros de Brillouin. <a href="https://jove.unicartagenaproxy.elogim.com/files/ftp_upload/54648/54648fig7large.jpg" target="_blank">Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.</a> <img alt="Suplementar Figura 1" src="/files/ftp_upload/54648/54648supfig1.jpg" /> Figura SI-1. Esquemático do Brillouin definir-se e BLS geometria espalhamento. (A) A luz incidente emitida por um laser de estado sólido é enviado para a amostra através de uma lente acromática. A luz dispersa por fônons acústicos granel e por aqueles resultantes de reflec ç ã o da luz na superfície do substrato, que está em contacto com a amostra, é recolhido pela lente, filtrada por um interferómetro de Fabry-Perot em tandem-multipasse e detectada por um fotomultiplicador. FP1 e FP2 indicar os dois interferômetros que constituem o conjunto set-up. Um polarizador selecciona a polarização da luz incidente, e um analisador é utilizado para seleccionar a polarização da luz dispersa. (B) geometria BLS com uma amostra em contacto com a superfície de um substrato de silício reflexivo. Uma lâmina de vidro (não mostrado) está colocado por cima do espécime para selar o compartimento, e uma leve pressão é aplicada através das almofadas nos cantos do substrato. A luz incidente (K i) passa através da lente, é refractada na interface ar-amostra (K &#39;i) e focada na interface substrato-amostra. A luz dispersa recolhida pela mesma lente (k &#39;s) resulta da interação com ambos os fônons granel (qb) aqueles que viajam e PS da amostra (q s). . Ângulos entre as direcções de luz e a normal à superfície são indicados como Φ e Φ &#39;(C) Diagrama esquemático da amostra e do sistema de coordenadas adotadas; Z define o eixo extraordinária paralela à direcção das fibras. Ângulos θ e α são aquelas entre a direcção de fonões q e q s b o a z -axis, respectivamente k i, k &#39;i, k s, K&#39; s:. Números de onda da luz incidente e espalhados; b Q, Q s, vetores de onda da massa e modos PS, respectivamente. (Reproduzido de ref 9.) <a href="https://jove.unicartagenaproxy.elogim.com/files/ftp_upload/54648/54648supfig1large.jpg" target="_blank">Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.</a> <pclass = &quot;jove_content&quot; fo: manter-com-next.within-page = &quot;always&quot;&gt; Tabela 1. Coeficientes de tensores elásticos derivados da análise de ajuste das velocidades de ondas acústicas coeficientes tensores elásticos do tipo purificado-tripsina seco I fibras de colágeno (. este trabalho) e fibras de elastina (ref 9). <table border="1" fo:keep-together.within-page="1"><tbody><tr><td> amostra </td><td colspan="2"> coeficientes elásticos (ACP) </td></tr><tr><td> colagénio digerido por tripsina </td><td> C 33 </td><td> 18,7 ± 0,1 </td></tr><tr><td></td><td> C 11 </td><td> 14,4 ± 0,2 </td></tr><tr><td></td><td> c 44 </td><td> 3,4 ± 0,1 </td></tr><tr><td></td><td> C 12 </td><td> 7,2 ± 0,2 </td></tr><tr><td></td><td> c 13 </td><td> 11,2 ± 0,3 </td></tr><tr><td> elastina </td><td> C 33 </td><td> 11,5 ± 0,2 </td></tr><tr><td></td><td> C 11 </td><td> 10,4 ± 0,1 </td></tr><tr><td></td><td> c 44 </td><td> 1,9 ± 0,2 </td></tr><tr><td></td><td> C 12 </td><td> 6,6 ± 0,2 </td></tr><tr><td></td><td> c 13 </td><td> 6,8 ± 0,3 </td></tr></tbody></table>

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Preparation of Extracellular Matrix Protein Fibers for Brillouin Spectroscopy

We present a protocol for the application of Brillouin light scattering spectroscopy to elastin and trypsin-purified type I collagen fibers of the extracellular matrix to extract their full elastic properties.

Preparação de Matriz Extracelular fibras de proteína de Brillouin Spectroscopy

Brillouin spectroscopy is an emerging technique in the biomedical field. It probes the mechanical properties of a sample through the interaction of ...

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Universidad de Cartagena UDEC

Research

JoVE Journal

Bioengineering

10.3K visualizações.  University of Exeter. We present a protocol for the application of Brillouin light scattering spectroscopy to elastin and trypsin-purified type I collagen fibers of the extracellular matrix to extract their full elastic properties.

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Preparation of Complaint Matrices for Quantifying Cellular Contraction

The regulation of cellular adhesion to the extracellular matrix (ECM) is essential for cell migration and ECM remodeling. Focal adhesions are macromolecular assemblies that couple the contractile F-actin cytoskeleton to the ECM. This connection allows for the transmission of intracellular mechanical forces across the cell membrane to the underlying substrate. Recent work has shown the mechanical properties of the ECM regulate focal adhesion and F-actin morphology as well as numerous physiological processes, including cell differentiation, division, proliferation and migration. Thus, the use of cell culture substrates has become an increasingly prevalent method to precisely control and modulate ECM mechanical properties.
To quantify traction forces at focal adhesions in an adherent cell, compliant substrates are used in conjunction with high-resolution imaging and computational techniques in a method termed traction force microscopy (TFM). This technique relies on measurements of the local magnitude and direction of substrate deformations induced by cellular contraction. In combination with high-resolution fluorescence microscopy of fluorescently tagged proteins, it is possible to correlate cytoskeletal organization and remodeling with traction forces.
Here we present a detailed experimental protocol for the preparation of two-dimensional, compliant matrices for the purpose of creating a cell culture substrate with a well-characterized, tunable mechanical stiffness, which is suitable for measuring cellular contraction. These protocols include the fabrication of polyacrylamide hydrogels, coating of ECM proteins on such gels, plating cells on gels, and high-resolution confocal microscopy using a perfusion chamber. Additionally, we provide a representative sample of data demonstrating location and magnitude of cellular forces using cited TFM protocols.

In this video, we demonstrate the experimental techniques used to fabricate compliant, extracellular matrix (ECM) coated substrates suitable for cell culture, and which are amenable to traction force microscopy and observing effects of ECM stiffness on cell behavior.

Preparação de Matrizes Reclamação para Quantificar contração celular

The regulation of cellular adhesion to the extracellular matrix (ECM) is essential for cell migration and ECM remodeling.  Focal adhesions are ...

Bioengenharia

Demonstrating the Uses of the Novel Gravitational Force Spectrometer to Stretch and Measure Fibrous Proteins

The study of macromolecular structure has become critical to the elucidation of molecular mechanisms and function. There are several limited, but important bioinstruments capable of testing the force dependence of structural features in proteins. Scale has been a limiting parameter on how accurately researchers can peer into the nanomechanical world of molecules, such as nucleic acids, enzymes, and motor proteins that perform life-sustaining work. Atomic force microscopy (AFM) is well tuned to determine native structures of fibrous proteins with a distance resolution on par with electron microscopy. However, in AFM force studies, the forces are typically much higher than a single molecule might experience 1, 2. Optical traps (OT) are very good at determining the relative distance between the trapped beads and they can impart very small forces 3. However, they do not yield accurate absolute lengths of the molecules under study. Molecular simulations provide supportive information to such experiments, but are limited in the ability to handle the same large molecular sizes, long time frames, and convince some researchers in the absence of other supporting evidence2, 4.
The gravitational force spectrometer (GFS) fills a critical niche in the arsenal of an investigator by providing a unique combination of abilities. This instrument is capable of generating forces typically with 98% or better accuracy from the femtonewton range to the nanonewton range. The distance measurements currently are capable of resolving the absolute molecular length down to five nanometers, and relative bead pair separation distances with a precision similar to an optical trap. Also, the GFS can determine stretching or uncoiling where the force is near equilibrium, or provide a graded force to juxtapose against any measured structural changes. It is even possible to determine how many amino acid residues are involved in uncoiling events under physiological force loads 2. Unlike in other methods where there is extensive force calibration that must precede any assay, the GFS requires no such force calibration 5. By complementing the strengths of other methods, the GFS will bridge gaps in understanding the nanomechanics of vital proteins and other macromolecules.

This is a step-by step guide showing the purpose, operation, and representative results from the novel gravitational force spectrometer.

Demonstrar os usos do Spectrometer Novel Força Gravitacional para esticar e Medida Proteínas fibrosas

The study of macromolecular structure has become critical to the elucidation of molecular mechanisms and function. There are several limited, but ...

Non-contact, Label-free Monitoring of Cells and Extracellular Matrix using Raman Spectroscopy

Non-destructive, non-contact and label-free technologies to monitor cell and tissue cultures are needed in the field of biomedical research.1-5 However, currently available routine methods require processing steps and alter sample integrity. Raman spectroscopy is a fast method that enables the measurement of biological samples without the need for further processing steps. This laser-based technology detects the inelastic scattering of monochromatic light.6 As every chemical vibration is assigned to a specific Raman band (wavenumber in cm-1), each biological sample features a typical spectral pattern due to their inherent biochemical composition.7-9 Within Raman spectra, the peak intensities correlate with the amount of the present molecular bonds.1 Similarities and differences of the spectral data sets can be detected by employing a multivariate analysis (e.g. principal component analysis (PCA)).10
Here, we perform Raman spectroscopy of living cells and native tissues. Cells are either seeded on glass bottom dishes or kept in suspension under normal cell culture conditions (37 &deg;C, 5% CO2) before measurement. Native tissues are dissected and stored in phosphate buffered saline (PBS) at 4 &deg;C prior measurements. Depending on our experimental set up, we then either focused on the cell nucleus or extracellular matrix (ECM) proteins such as elastin and collagen. For all studies, a minimum of 30 cells or 30 random points of interest within the ECM are measured. Data processing steps included background subtraction and normalization.

Raman spectroscopy is a suitable technique for the non-contact, label-free analysis of living cells, tissue-engineered constructs and native tissues. Source-specific spectral fingerprints can be generated and analyzed using multivariate analysis.

Sem contato, Monitoramento Label livre de células e matriz extracelular utilizando Espectroscopia Raman

Non-destructive, non-contact and label-free technologies to monitor cell and tissue cultures are needed in the field of biomedical research.1-5 However, ...

Writing Bragg Gratings in Multicore Fibers

Fiber Bragg gratings in multicore fibers can be used as compact and robust filters in astronomical and other research and commercial applications. Strong suppression at a single wavelength requires that all cores have matching transmission profiles. These gratings cannot be inscribed using the same method as for single-core fibers because the curved surface of the cladding acts as a lens, focusing the incoming UV laser beam and causing variations in exposure between cores. Therefore we use an additional optical element to ensure that the beam shape does not change while passing through the cross-section of the multicore fiber. This consists of a glass capillary tube which has been polished flat on one side, which is then placed over the section of the fiber to be inscribed. The laser beam enters the fiber through the flat surface of the capillary tube and hence maintains its original dimensions. This paper demonstrates the improvements in core-to-core uniformity for a 7-core fiber using this method. The technique can be generalized to larger multicore fibers.

We describe a technique for inscribing identical fiber Bragg gratings into each core of a multicore fiber. This is achieved by introducing an additional surface into the optical path to mitigate lensing by the curved surface of the fiber cladding.

Escrevendo redes de Bragg em fibras Multicore

Fiber Bragg gratings in multicore fibers can be used as compact and robust filters in astronomical and other research and commercial applications. Strong ...

Engenharia

High-speed Continuous-wave Stimulated Brillouin Scattering Spectrometer for Material Analysis

Recent years have witnessed a significant increase in the use of spontaneous Brillouin spectrometers for non-contact analysis of soft matter, such as aqueous solutions and biomaterials, with fast acquisition times. Here, we discuss the assembly and operation of a Brillouin spectrometer that uses stimulated Brillouin scattering (SBS) to measure stimulated Brillouin gain (SBG) spectra of water and lipid emulsion-based tissue-like samples in transmission mode with &lt;10 MHz spectral-resolution and &lt;35 MHz Brillouin-shift measurement precision at &lt;100 ms. The spectrometer consists of two nearly counter-propagating continuous-wave (CW) narrow-linewidth lasers at 780 nm whose frequency detuning is scanned through the material Brillouin shift. By using an ultra-narrowband hot rubidium-85 vapor notch filter and a phase-sensitive detector, the signal-to-noise-ratio of the SBG signal is significantly enhanced compared to that obtained with existing CW-SBS spectrometers. This improvement enables measurement of SBG spectra with up to 100-fold faster acquisition times, thereby facilitating high spectral-resolution and high-precision Brillouin analysis of soft materials at high speed.

We describe the construction of a rapid continuous-wave-stimulated-Brillouin-scattering (CW-SBS) spectrometer. The spectrometer employs single-frequency diode-lasers and an atomic vapor notch-filter to acquire transmission spectra of turbid/non-turbid samples with high spectral-resolution at speeds up to 100-fold faster than those of existing CW-SBS spectrometers. This improvement enables high-speed Brillouin material analysis.

Espectrômetro de espalhamento Brillouin estimulado assemelhace de alta velocidade para análise de Material

Recent years have witnessed a significant increase in the use of spontaneous Brillouin spectrometers for non-contact analysis of soft matter, such as ...

OaAEP1-Mediated Enzymatic Synthesis and Immobilization of Polymerized Protein for Single-Molecule Force Spectroscopy

Chemical and bio-conjugation techniques have been developed rapidly in recent years and allow the building of protein polymers. However, a controlled protein polymerization process is always a challenge. Here, we have developed an enzymatic methodology for constructing polymerized protein step by step in a rationally-controlled sequence. In this method, the C-terminus of a protein monomer is NGL for protein conjugation using OaAEP1 (Oldenlandia affinis asparaginyl endopeptidases) 1) while the N-terminus was a cleavable TEV (tobacco etch virus) cleavage site plus an L (ENLYFQ/GL) for temporary N-terminal protecting. Consequently, OaAEP1 was able to add only one protein monomer at a time, and then the TEV protease cleaved the N-terminus between Q and G to expose the NH2-Gly-Leu. Then the unit is ready for next OaAEP1 ligation. The engineered polyprotein is examined by unfolding individual protein domain using atomic force microscopy-based single-molecule force spectroscopy (AFM-SMFS). Therefore, this study provides a useful strategy for polyprotein engineering and immobilization.

Here, we present a protocol to conjugate protein monomer by enzymes forming protein polymer with a controlled sequence and immobilize it on the surface for single-molecule force spectroscopy studies.

Síntese Enzimática Mediada oOAEP1 e Imobilização de Proteína Polimerizada para Espectroscopia de Força De Molécula Única

Chemical and bio-conjugation techniques have been developed rapidly in recent years and allow the building of protein polymers. However, a controlled ...

Bioquímica

Synthesis of Keratin-based Nanofiber for Biomedical Engineering

Electrospinning, due to its versatility and potential for applications in various fields, is being frequently used to fabricate nanofibers. Production of these porous nanofibers is of great interest due to their unique physiochemical properties. Here we elaborate on the fabrication of keratin containing poly (&#949;-caprolactone) (PCL) nanofibers (i.e., PCL/keratin composite fiber). Water soluble keratin was first extracted from human hair and mixed with PCL in different ratios. The blended solution of PCL/keratin was transformed into nanofibrous membranes using a laboratory designed electrospinning set up. Fiber morphology and mechanical properties of the obtained nanofiber were observed and measured using scanning electron microscopy and tensile tester. Furthermore, degradability and chemical properties of the nanofiber were studied by FTIR. SEM images showed uniform surface morphology for PCL/keratin fibers of different compositions. These PCL/keratin fibers also showed excellent mechanical properties such as Young&#39;s modulus and failure point. Fibroblast cells were able to attach and proliferate thus proving good cell viability. Based on the characteristics discussed above, we can strongly argue that the blended nanofibers of natural and synthetic polymers can represent an excellent development of composite materials that can be used for different biomedical applications.

Electrospun nanofibers have a high surface area to weight ratio, excellent mechanical integrity, and support cell growth and proliferation. These nanofibers have a wide range of biomedical applications. Here we fabricate keratin/ PCL nanofibers, using the electrospinning technique, and characterize the fibers for possible applications in tissue engineering.

Síntese de nanofibras baseado em queratina de Engenharia Biomédica

Electrospinning, due to its versatility and potential for applications in various fields, is being frequently used to fabricate nanofibers. Production of ...

High Speed Sub-GHz Spectrometer for Brillouin Scattering Analysis

The goal of this protocol is to build a parallel high-extinction and high-resolution optical Brillouin spectrometer. Brillouin spectroscopy is a non-contact measurement method that can be used to obtain direct readouts of viscoelastic material properties. It has been a useful tool in material characterization, structural monitoring and environmental sensing. In the past, Brillouin spectroscopy has usually employed scanning Fabry-Perot etalons to perform spectral analysis. This process requires high illumination power and long acquisition times, making the technique unsuitable for biomedical applications. A recently introduced novel spectrometer overcomes this challenge by employing two VIPAs in a cross-axis configuration. This innovation enables sub-Gigahertz (GHz) resolution spectral analysis with sub-second acquisition time and illumination power within the safety limits of biological tissue. The multiple new applications facilitated by this improvement are currently being explored in biological research and clinical application.

Here we present a protocol to build a rapid Brillouin spectrometer. Cascading virtually imaged phase array (VIPA) etalons achieve a measurement speed more than 1,000 times faster than traditional scanning Fabry-Perot spectrometers. This improvement provides the means for Brillouin analysis of tissue and biomaterials at low power levels in vivo.

Alta velocidade Spectrometer Sub-GHz para Brillouin Scattering Análise

The goal of this protocol is to build a parallel high-extinction and high-resolution optical Brillouin spectrometer. Brillouin spectroscopy is a ...

Production of Extracellular Matrix Fibers via Sacrificial Hollow Fiber Membrane Cell Culture

Engineered scaffolds derived from extracellular matrix (ECM) have driven significant interest in medicine for their potential in expediting wound closure and healing. Extraction of extracellular matrix from fibrogenic cell cultures in vitro has potential for generation of ECM from human- and potentially patient-specific cell lines, minimizing the presence of xenogeneic epitopes which has hindered the clinical success of some existing ECM products. A significant challenge in in vitro production of ECM suitable for implantation is that ECM production by cell culture is typically of relatively low yield. In this work, protocols are described for the production of ECM by cells cultured within sacrificial hollow fiber membrane scaffolds. Hollow fiber membranes are cultured with fibroblast cell lines in a conventional cell medium and dissolved after cell culture to yield continuous threads of ECM. The resulting ECM fibers produced by this method can be decellularized and lyophilized, rendering it suitable for storage and implantation.

The goal of this protocol is production of whole extracellular matrix fibers targeted for wound repair which are suitable for preclinical evaluation as part of a regenerative scaffold implant. These fibers are produced by the culture of fibroblasts on hollow fiber membranes and extracted by dissolution of the membranes.

Produção de fibras da matriz extracelular através de cultura de células de membrana de fibra oca Sacrificial

Engineered scaffolds derived from extracellular matrix (ECM) have driven significant interest in medicine for their potential in expediting wound closure ...

Light-Induced Molecular Adsorption of Proteins Using the PRIMO System for Micro-Patterning to Study Cell Responses to Extracellular Matrix Proteins

Cells sense a variety of extracellular cues, including the composition and geometry of the extracellular matrix, which is synthesized and remodeled by the cells themselves. Here, we present the method of Light-Induced Molecular Adsorption of Proteins (LIMAP) using the PRIMO system as a patterning technique to produce micro-patterned extracellular matrix (ECM) substrates using a single or combination of proteins. The method enables printing of ECM patterns in micron resolution with excellent reproducibility. We provide a step-by-step protocol and demonstrate how this can be applied to study the processes of neuronal pathfinding. LIMAP has significant advantages over existing micro-printing methods in terms of the ease of patterning more than one component and the ability to generate a pattern with any geometry or gradient. The protocol can easily be adapted to study the contribution of almost any chemical component towards cell fate and cell behavior. Finally, we discuss common issues that can arise and how these can be avoided.

Our overall aim is to understand how cells sense extracellular cues that lead to directed axonal growth. Here, we describe the methodology of Light-Induced Molecular Adsorption of Proteins, used to produce defined micro-patterns of extracellular matrix components in order to study specific events that govern axon outgrowth and pathfinding.

Adsorção molecular induzida por luz de proteínas usando o sistema PRIMO para Micropadronização para estudar as respostas celulares às proteínas da matriz extracelular

Cells sense a variety of extracellular cues, including the composition and geometry of the extracellular matrix, which is synthesized and remodeled by the ...