The authors have nothing to disclose.

C. 1. 준비 엘레 배아는 시간 경과 현미경을위한 마이크로 비드를 사용하여 <ol><li> M9 버퍼의 드롭에 웜 픽 (백금선)를 사용하여 임신하는 성인 웜을 전송하고 격렬하게 교반 한 다음 이쑤시개 / 피펫 팁 상에 장착 눈 래시를 사용 M9의 인접 드롭 각 웜 전사 제에 의해 박테리아를 닦아 또는 뾰족한 유리 모세관을 사용합니다. </li><li> , HPO 4, 5g의 NaCl M9 버퍼 (1 L M9 버퍼 3g의 KH 2를 포함 PO 4, 6 g의 2- 나에 20 ㎛의 직경의 폴리스티렌 비드 10 배를 함유하는 분산액을 희석하고, 오토 클레이브 (20 분, 120 ℃ 이후 C)는,) 1 M 황산 용액의 추가 1 ml에 추가 할 수 있습니다. </li><li> 얇은 유리 모세관의 모든 유형에서 입으로 피펫을 확인합니다 (예를 들어, 포인트 모세 혈관이나 모세 혈관 주사 바늘을 ​​당겨하는 데 사용 용융), 고무, 실리콘 또는 유사한 재료 튜브 (이상적으로 투명)의 약 0.5 m 길이의 조각, 200 μl를피펫 팁, 200 ㎕의 PCR 용 튜브의 뚜껑, 작은 주사기 소수성 필터 (예., 0.2에서 0.45 사이 μm의 공경 15-50mm 직경 나일론, PTFE 또는 유사한 물질 필터), 및 1,000 μL 피펫 팁 . 입 피펫이 유형의 생물학적 물질은 실험자에 접촉 얻을 수 없다는 것을 보장한다. </li><li> 튜브 내로 제 팁 200 μL 피펫 팁을 삽입하여 피펫을 조립하여 사용 모세관의 직경과 일치 중심 천공을 가지고 PCR 튜브의 뚜껑을 끼우. 매우 지적 송곳 또는 제제 바늘 천공을 생성하기 위해 사용될 수있다. </li><li> 얇은 모세관을 그리고 구멍에 삽입합니다. 튜브의 다른 쪽 끝으로 필터를 삽입하고 (그림 1) 입 조각으로 1000 μL 피펫 팁을 삽입합니다. </li><li> 깨끗한 면도날이나 메스와 외음부에 가로 벌레를 절단하여 임신하는 성인을 해부하다. 참고 : 일반적으로, 많은 배아 전자됩니다절단 후 xpulsed. 초기 배아가 필요한 경우, 이들은 때때로 눈 래시 또는 뾰족한 바늘을 사용하여 도체로부터 방출되어야한다. </li><li> 입 피펫을 사용하여이 드롭으로 24x60 mm 커버 유리와 이식란 상에 희석 폴리스티렌 비드 분산 (~ 4 μL)의 피펫 한 방울. </li><li> 조심스럽게 작은 (예를 들어, 18 × 18 또는 20 × 20 mm)를 배치 드롭 위에 유리를 커버하고 드롭이 완전히 퍼져 가지고 있는지 확인하십시오. 참고 : 드롭도 작은 커버 유리의 가장자리를 터치하는 것만으로는 충분하지 작아야한다. </li><li> 액화 바셀린으로 마운트를 밀봉. 24x60 mm 커버 슬립 측에 침지 기름 한 방울을 추가하고 &#39;시간 경과 현미경&#39;섹션을 진행합니다. </li></ol> 성인 C. 2. 준비 엘레 동물 시간 경과 현미경은 나노 비드를 사용하는 주 : 일반적으로, 성인 동물을 장착하기위한 프로토콜 (REF)에서 프로토콜의 적응이다. 18.이 프로토콜로, 그것은 성인 동물의 장기 경과 공 초점 현미경 검사를 수행 할 수있다. <ol><li> 1.5 %를 준비 M9 버퍼에 아가로 오스 솔루션 (/ V W), 종기 (1 분, 물 목욕이나 전자 레인지에서 100 ° C). 이 장 및 / 또는 생식선의 부품 압출로 이어질 수 있기 때문에 아가로 오스의 높은 농도의 사용은 권장되지 않습니다. </li><li> 이 현미경 슬라이드 각에 테이프의 2 ~ 3 층을 스틱. 테이프로 두 슬라이드 사이의 테이프없이 슬라이드를 놓습니다. </li><li> 피펫 팁을 사용하고 중간 슬라이드의 중심에서 뜨거운 아가로 오스 솔루션의 한 방울을 배치합니다. 이 양쪽에 테이프 층에 의해 지원 될 수 있도록 신속하게 드롭에 다른 슬라이드를 배치합니다. 이 약 10mm 직경의 원형과 평면 한천 패드를 작성합니다. </li><li> 패드 상 (V) / W (2.6 %로 희석) 100 nm의 비드 용액 한 방울을 넣어. 웜 픽업과 드롭에 1-10 청소 성인 웜을 전송합니다. 보호 해주는에 설명 된대로 18 × 18 mm의 커버 유리와 바셀린과 인감ocol 1. </li></ol> 3. 시간 경과 현미경 <ol><li> 현미경 슬라이드 또는 커버 유리 샌드위치에 침지 기름 방울을 넣어. 샘플을 찾기 위해 낮은 배율 (배 또는 10 배 렌즈)에서 시야를 사용합니다. 참고 : 예를 들어, (C를 배아 엘레 간스를 위해 특히) 가능한 한 푸른 빛에 노출을 제한 / 찾을 시편에 초점을 대신 시야를 사용하는 에피 형광 현미경을 사용하지 마십시오. </li><li> 높은 배율 (40 배 또는 60 배 목표)로 변경, (중앙 평면 또는 수집 소프트웨어에 따라 샘플의 위 / 아래 비행기를) 초점에 샘플을 가져. </li><li> 1 μm의 간격 (30) 평면에 샘플링 간격을 설정마다 1 분을 기록했다. 자동화 xy- 또는 XYZ 스테이지를 사용할 경우, 다수의 반점은 한 세션에 기록 될 수있다. 형광 이미징로 전환하고 초점을 다시 확인합니다. 참고 : 약간 긴 노출 시간을 사용하지 않고, 높은 레이저 파워를 사용하지 않도록하십시오매우 낮은 강도에서. 측정은 역학 범위 작물 포화를 방지하기 위해 이미지 수집 프로그램 또는 ImageJ에에 하나, 바로 이미지를 획득하고 과도한 방사선 노출을 의미한다. </li><li> 시간 경과 시리즈를 녹음 시작합니다. 참고 : 아티팩트를 분석 제외 샘플 검사 사이의 길이 (3-10 분) 시간 간격으로 시작하여 점차적으로 원하는 간격에 시간 샘플링을 증가시킵니다. 통계 분석을 수행 할 때 두 경우 모두 발달 타이밍뿐만 아니라 엔드 포인트는 비슷해야합니다. 또한, 광독성 및 생존율을 평가하는 것이 필요하다. 따라서 장기적으로 시간 경과 현미경 후 마운트에서 표본을 복구하고 라이브 / 개발을 계속 여부를 확인합니다. </li></ol> 4. IMOD와 3D 셀 형상 모델을 재구성 참고 : http://bio3d.colorado.edu/imod/ : IMOD 소프트웨어가 IMOD 웹 페이지에서 사용할 수 있습니다. 소프트웨어의 설치는 설명이다이 d를. 윈도우 OS를 사용하는 경우, 유닉스 툴킷은 또한 IMOD 웹 페이지에 패키지로 찾을 수있는, 설치해야합니다. 또한, IMOD 웹 페이지 (http://bio3d.colorado.edu/imod/doc/3dmodguide.html)에 사용할 수있는 뛰어난 컴파일 3dmod 소개가있다. <ol><li> 유닉스 쉘을 열고 &quot;IMOD&quot;를 입력. IMOD 창이 열립니다. 3D 모델을 생성 할 수있는 원시 데이터 (이상적으로 적층 TIF 또는 이와 유사한 것)을 사용하여 파일을 선택합니다. </li><li> 정보 창 (최대 및 스크롤 도구 아래)를 사용하여 ZAP 창에서 개체의 하단과 상단을 찾습니다. </li><li> 세포 윤곽을 추적 시작합니다. 중요한 것은, 각 셀은 하나의 객체인지 확인하십시오. 각 셀의 상단면과 함께 시작 창 정보를 이용하여이 첫 번째 형상을 만든다. Z에서 아래로 스크롤하여 각 Z 평면을위한 새로운 윤곽을 만들 수 있습니다. </li><li> 3 차원 모델링에 필요한만큼의 세포에 대해서도 똑같이. 새로운 세포로 시작할 때 새로운 객체를 생성하는 것을 잊지 마십시오. 엔OTE는 : 윤곽 추적 및 여러 유용한 플러그인을위한 여러 가지 방법이 있습니다. 자세한 내용은 IMOD 웹 페이지 및 온라인 자습서를 방문하십시오. 여기에 도시 한 경우, 기본 설정이 사용되었다. </li><li> 개체 및 윤곽을 검사 할 수있는 &quot;모델보기&quot;창을 엽니 다. </li><li> &quot;객체&quot;- &quot;모델보기&quot;도구 모음에서 &quot;편집&quot;을 선택합니다. 각각의 편집 창이 열립니다. </li><li> &quot;데이터 형식을 그리기&quot;와 &quot;도면 스타일&quot;로 &quot;입력&quot;으로 &quot;메시&quot;를 선택, 작성 및 폐쇄 개체로 세포를 모델링합니다. 창의 왼쪽에있는 스크롤 선택에서 &quot;메싱&quot;을 클릭합니다. 오른쪽 아래에있는 선택의 옵션 &quot;모자&quot;를 확인합니다. 필요한만큼 많은 개체를 확인하고 &quot;모든 메쉬&quot;을 클릭합니다. 이 프로그램은 윤곽의 스택에서 고체를 생성합니다. Z - 샘플링 인자는 &quot;보기&quot;창에서 &quot;Z 스케일&quot;을 변경하여 조정할 수있다. </li><li> 이동 / 3D의 objec을 회전T ( &quot;편집&quot;- &quot;보기&quot;) 및 스냅 샷 또는 동영상을 저장 ( &quot;파일&quot;- &quot;스냅 티파니로 ...&quot;또는 &quot;영​​화 / 몽타주&quot;). </li></ol> Endrov 5. 추적 형광 표지 된 구조 참고 : 셀 아이디 (예를 들어, H2B, PH-PLC-D1) 및 세포 분열 남은 마커 (예 : 대한 핵 또는 플라즈마 막 마커 변형을 사용하여, 세포 분열의 잔재를 추적하기 위해, NMY-2, 젠-4 ). 핵 또는 플라즈마 막 마커는 세포 분열의 남은 상속 세포 결정하는 것이 중요하다. <ol><li> 빠른 로딩 및 사용의 용이성을 위해, 원시 데이터 (ImageJ에에서, 예) TIFF 파일로 변환 할 수있다. 다음, 오픈 Endrov 및 파일을로드 파일 메뉴에서 &quot;로드 파일&quot;옵션을 선택하여 분석한다. 도구 모음에서 &quot;2D 뷰어&quot;아이콘을 클릭합니다. </li><li> 오른쪽 아래 모서리에 ( &quot;맞춤 범위&quot;아이콘을 파란색 아이콘을 클릭하여 막대 그래프를 조정Endrov 화면). &quot;파일 이름&quot;- - &quot;Imageset에&quot;를 -에 &quot;데이터&quot;를 이동하여 XYZ 해상도를 설정합니다 &quot;채널&quot;- &quot;XYZ 해상도를 설정합니다.&quot; X 및 Y 해상도가 0.2 μm의 경우 예를 들면 X, Y, Z와, 5, 5, 1의 값을 입력하고 Z. 모든 샘플 1 ㎛ </li><li> 핵 주석의 경우, 관심의 평면으로 이동 &quot;2D 뷰어&quot;을 클릭합니다. 드롭 다운 메뉴에서 &quot;리니지&quot;를 선택하고 &quot;새 계보&quot;를 선택합니다. </li><li> 클릭하고 핵에 드래그하여이를 표시 할 수 있습니다. 핵의 이름을 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭하고 드롭 다운 메뉴에서 &quot;입자 이름 바꾸기&quot;를 선택합니다. 증가 또는 원의 직경을 감소하기 위해, 마크 원의 왼쪽에 표시되는 화살표 아이콘을 드래그합니다. 핵의 중심 평면을 표시하려면 오른쪽 아이콘을 클릭합니다. 세포막 마커를 사용하는 경우, 큰 구 셀의 대부분을 커버 할 것이다 그려있다. </li><li> 시간과 평면으로 진행하려면, &quot;프레임&quot;과 &quot;Z&quot;를 선택하단 도구 모음에서 옵션을 설정합니다. 다음 시점에 가고 후 따라서 핵 마크 원의 위치 나 크기를 조정한다. 추적 세포가 분열 할 때까지이 과정을 반복합니다. </li><li> 세포 분열이있을 때, 딸이 핵을 표시하고 &quot;리니지 뷰어&quot;로 전환합니다. 이것은 상단 도구 모음에서 &quot;윈도우&quot;아이콘을 클릭하여 선택할 수 있습니다. 마크 동시에 세 개의 핵, 상단 도구 모음에서 &quot;리니지&quot;옵션에 가서 &quot;준 부모&quot;를 선택합니다. </li><li> 셀 추적이 완료되면, 트래킹 셀 분할 잔여 마킹 채널로 전환. 채널을 전환하려면 도구 모음의 왼쪽 하단에있는 파일 이름을 클릭합니다. 핵에 대해 전술 한 바와 같이 세포 분열의 찌꺼기 (또는 다른 구조)이 추적 될 수있다. </li><li> &quot;리니지&quot;- - &quot;편집&quot;편집 될 혈통 번호를 클릭하여 종료 후 소프트웨어로 복귀 할 때, &quot;2D 뷰어&quot;로 이동하는 것이 필요하다. </리&gt; </ol> 6. PIVlab과 두피 액토 마이 오신 흐름 분석 참고 : PIVlab은에서 자유롭게 사용할 수있는 소프트웨어입니다 : http://pivlab.blogspot.de/은; 그것은 PIVlab_GUI을 입력하여 matlab에 명령 줄 환경 내에서 호출 할 수 있습니다. PIVlab 작업 할 때, 그것은 별도의 폴더에 이미지 시리즈를 저장하는 것이 좋습니다. <ol><li> &quot;파일 메뉴&quot;에서 새로운 세션을 시작합니다. &quot;로드 이미지&quot;버튼을 클릭하여 이미지 파일을로드합니다. </li><li> , 시퀀싱 스타일 1-2, 2-3 ...를 선택하고 원하는 이미지의 순서를 포함하는 디렉토리로 이동합니다. 이미지를 선택하고 &quot;추가&quot;버튼을 가져 오기를 클릭합니다. </li><li> &quot;분석 설정&quot;으로 이동하여 &quot;제외 (투자 수익 (ROI), 마스크)&quot;를 선택합니다. 또는 키를 눌러 &quot;Ctrl 키 + E&quot;. 이미지 / S (배아 외부 즉, 영역)의 원치 않는 부분을 비활성화하려면 &quot;현재 프레임에 대한 마스크 (들)을 그립니다&quot;버튼을 사용합니다. </li><li> &quot;PIV 설정&quot;을 선택 FR&quot;분석 설정&quot;메뉴를 OM. 또는 키를 눌러 &quot;Ctrl + S를&quot;. 원하는 PIV 알고리즘으로 &quot;FFT 윈도우 변형&quot;을 선택합니다. 주 : 고속 푸리에 변환 (FFT)의 계산 비용을 줄일 수 있지만, 신호는 물론 잡음 위 연구 입자의 변위 (6.5 참조) 분석 반 패스 영역을 초과하지 않는 경우이다 권장 만한다. </li><li> 연속 된 이미지 사이의 강도 간 상관 관계에 대한 질문의 영역 세 가지 패스에 대해 다음 값을 입력 : 1 패스 : 심문을 64 픽셀의 영역을 32 패스 2 단계 : 심문 32 픽셀의 영역을 16 단계 . 드롭 다운 메뉴 창 변형에서 &quot;선&quot;을 선택합니다. 서브 픽셀 변위 추정 가우스 2 * 3 점법을 선택한다. </li><li> 선택 &quot;분석!&quot; 분석 메뉴와 버튼을 사용에서 분석을 시작하기 위해 &quot;모든 프레임을 분석&quot;. </li><li> 후 처리를 들어 &quot;&quot;벡터 유효성 검사 &quot;를 선택, 후 처리 &quot;메뉴 7 표준 편차 (표준 편차) 필터 임계 값을 설정하고 모든 프레임에 적용됩니다. </li><li> &quot;플롯&quot;메뉴에서 &quot;데이터를 수정 / 매개 변수를 유도&quot;를 선택합니다. 드롭 다운 메뉴에서 &quot;벡터 [PX / 프레임]&quot;를 선택합니다. 벡터와 하이 패스 필터의 부드러움을 조정하고 모든 프레임에 적용됩니다. </li><li> 모든 프레임의 평균 벡터를 계산 1 &quot;중고 프레임&quot;으로 설정하려면 다음 말을하고 &quot;평균 벡터를 계산&quot;버튼을 클릭합니다. </li></ol>

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R., F&#252;rthauer, S., Nishikawa, M., J&#252;licher, F., Grill, S. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Active+torque+generation+by+the+actomyosin+cell+cortex+drives+left-right+symmetry+breaking.">Active torque generation by the actomyosin cell cortex drives left-right symmetry breaking.</a> Elife. 3, e04165 (2014).</li><li>Kaletta, T., Schnabel, H., Schnabel, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Binary+specification+of+the+embryonic+lineage+in+Caenorhabditis+elegans.">Binary specification of the embryonic lineage in Caenorhabditis elegans.</a> Nature. 390 (6657), 294-298 (1997).</li><li>Schnabel, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Global+cell+sorting+in+the+C.+elegans+embryo+defines+a+new+mechanism+for+pattern+formation.">Global cell sorting in the C. elegans embryo defines a new mechanism for pattern formation.</a> Dev. Biol. 294 (2), 418-431 (2006).</li><li>Murray, J. I., Bao, Z., Boyle, T. J., Waterston, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+lineaging+of+fluorescently-labeled+Caenorhabditis+elegans+embryos+with+StarryNite+and+AceTree.">The lineaging of fluorescently-labeled Caenorhabditis elegans embryos with StarryNite and AceTree.</a> Nat. Protoc. 1 (3), 1468-1476 (2006).</li><li>Giurumescu, C. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitative+semi-automated+analysis+of+morphogenesis+with+single-cell+resolution+in+complex+embryos.">Quantitative semi-automated analysis of morphogenesis with single-cell resolution in complex embryos.</a> Development. 139 (22), 4271-4279 (2012).</li><li>Dejima, K., Kang, S., Mitani, S., Cosman, P. C., Chisholm, A. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Syndecan+defines+precise+spindle+orientation+by+modulating+Wnt+signaling+in+C.+elegans.">Syndecan defines precise spindle orientation by modulating Wnt signaling in C. elegans.</a> Development. 141 (22), 4354-4365 (2014).</li><li>Schnabel, R., Hutter, H., Moerman, D., Schnabel, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Assessing+normal+embryogenesis+in+Caenorhabditis+elegans+using+a+4D+microscope:+variability+of+development+and+regional+specification.">Assessing normal embryogenesis in Caenorhabditis elegans using a 4D microscope: variability of development and regional specification.</a> Dev Biol. 184 (2), 234-265 (1997).</li></ol>

Research in the lab of CP is funded by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (EXC 115; FOR 1756) and the LOEWE Research Cluster Ubiquitin Networks. CP is further supported by the European Union Framework Program 7 (Marie Curie Actions Project 326632).

개발 물체 추적을 통해, 특히 핵 추적, 그것은 C. 중앙 패터닝 메커니즘을 규명 할 수 있었다 엘레은 1,23,24를 배아. 더 높은 처리량이 전략을 확대, 추가적인 패턴 규칙을 발견하고 패턴을 추론하는 방법을 방법은 드 노보 (10) 규칙을 제안 최근에 가능했습니다. 많은 돌연변이를 들어, 그러나, 정확한 패터닝 결함은 여전히​​ 알려져 있지 않다. 여기에 설명 된 ...

형광 단백질, 유전자 공학, 광학 현미경, 컴퓨터 소프트 및 하드웨어의 지속적인 개선과 함께, 그것은 전례가없는 시공간 해상도에서 많은 모델 생물의 개발을 기록 할 수있게되었습니다. 이 연구진은 이전에 해결 될 수없는 질문을하거나 간과 측면을 검색하기 위해 알려진 개발 프로세스를 재 방문 할 수 있습니다. 이 진행은 철저한 측정 및 통계 분석에 의해 정량적 모델로 질적, 비공식적 모델 변환을 목표로 양적 발달 생물학의 분야를 촉발했다. 트래킹 셀과 세포 내 구조는 배아 발달, 신경계 활성, 또는 세포 분열 1-12 정량적 모델을 도출하는 것이 가능했다. C의 초기 개발 과정에서 세포 분열의 잔재를 추적하여 엘레 배아, 우리는 그들이 스테레오를 따르는 것이 밝혀 최근 수경로를 입력하고 구성하는 중요한 편광는 13,14 요인. 여기에, 프로토콜은 양적 발달 생물학 비 전문가를위한 접근에 접근 할 것을되게됩니다. 초점은 표준 공 초점 현미경과 컴퓨터에 액세스 할 수있는 모든 실험실에서 구현 가능한 세 개의 직선 앞으로 자유롭게 사용할 수있는 도구에 놓여있다. 이들은 3D 셀 형상을 생성하는 프로토콜, 세포 분열 잔재를 추적 프로토콜 및 정량적 피질 액토 마이 오신 역학을 설명하는 프로토콜을 포함한다. 선충 C. 엘레가 실시 케이스로 사용하지만, 여기에 기술 된 방법과 도구 등 다른 생물학적 예를 들어 모델, 배양 세포, 조직 외식, organoids 또는 타원체, 다른 배아에 질문의 다양한 적합 일반적으로, 여기에 표시된 분석 중 일부는 (http://imagej.nih.gov/ij/docs/index 인기있는 오픈 소스 도구 ImageJ에 수행 할 수 있습니다.HTML; 또는 피지, 다른 정량 분석​​을위한 많은 플러그인을 사용할 수있는 ImageJ에 버전, http://fiji.sc/Fiji을) &#39;배터리 포함&#39;. 그러나, 프로그램은 여기서 설명하는 특정 문제를 해결하기 위해 설계되었습니다. 우선, IMOD, 화상 처리는, 모델링 및 디스플레이 스위트 전자 또는 광학 현미경 (15)로부터 시리얼 섹션들의 3D 재구성을 위해 사용될 수있다. IMOD는 어떤 방향에서 3D 데이터를보기위한 도구가 포함되어 있습니다. 둘째, Endrov, ImageJ에 플러그인 호환성 16, 네트워크 또는 확장 플러그인 구조의 기초 (다른 사람들) 트랙의 이미지 분석, 데이터 처리, 및 주석을 수행하도록 설계된 자바 프로그램. 그것은 140 이미지 처리 작업과 모델 및 원시 데이터를 개별적으로 표시되는 확장 사용자 인터페이스가 포함되어 있습니다. 소스 코드는 https://github.com/mahogny/Endrov에서 찾을 수 있습니다. 셋째, PIVlab, M정량적 및 정 성적으로 입자 유동장 (17)을 분석 할 수 있도록 사용자를 디지털 입자 화상 속도계 애 트랩 용 도구. 이 프로그램의 사용은 처리 도구 상자 (http://mathworks.com) 이미지를 포함하는 MATLAB 라이센스가 필요합니다. PIVlab 정량적 흐름을 설명하기위한 프로그램이다. 이 이미지 쌍 또는 시리즈 내의 속도 분포, 크기, 소용돌이, 발산, 또는 전단을 계산합니다. 이를 위해 가장 가능성 입자 변위를 유도 이미지 쌍 (프로토콜 부분에서 소위 &#39;패스&#39;) 이미지의 작은 영역을 상호 연관. 이 교차 상관은 직접적인 상호 상관 또는 각각 고속 푸리에 변환 (FFT)을 사용하여 공간 또는 주파수 영역에서 분석 될 수 상관 행렬을 산출한다. 여기에 사용 된 장비는 Nipkow ( &#39;방사&#39;) 디스크, EMCCD, 488 및 561 nm의 표준 솔리드 구비 도립 현미경 인상태 레이저 및 석유 또는 물에 침수 목표 아포 크로 매트 20 배 공기 또는 40 배 또는 60 배 계획 /. 그러나, 다른 영상 방식으로 시간 경과 이미징을 수행하는 것이 가능하다, 예를 들면, 포인트 - 투, 라인 - 또는 컨벌루션 또는 구조화 결합 시트 주사 레이저 기반 현미경 멀티 광자 현미경뿐만 아니라, 에피 형광 현미경 조명. Nipkow 디스크 시스템을 사용하는 이점은 스트리밍 모드 (연속 이동 및 Z 차원 물체의 스캐닝)을 사용할 경우 특히, 매우 빠른 화상 취득한다. 또한 분해능을 향상시키기 위해, EMCCD 앞 1.5 배 확대 증량제를 사용할 수있다.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="573">
	<tbody>
		<tr height="64">
			<td height="64" style="height:64px;width:216px;">Stereo microscope</td>
			<td style="width:71px;">Motic/VWR</td>
			<td style="width:119px;">OT4005S</td>
			<td style="width:167px;">Stereo microscope for dissection and mounting</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Polybead Polystyrene Microspheres,&#160;</td>
			<td rowspan="2" style="width:71px;">Polysciences</td>
			<td rowspan="2" style="width:119px;">18329</td>
			<td rowspan="2" style="width:167px;">Embryo mounting</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">20 &#181;m</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Polybead Polystyrene Microspheres,&#160;</td>
			<td rowspan="2" style="width:71px;">Polysciences</td>
			<td rowspan="2" style="width:119px;">876</td>
			<td rowspan="2" style="width:167px;">Adult animal mounting</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">0.1 &#181;m</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">Microscope slides</td>
			<td style="width:71px;">VWR</td>
			<td style="width:119px;">631-0902</td>
			<td style="width:167px;">Adult animal mounting</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">Cover glass 18x18 mm</td>
			<td style="width:71px;">VWR</td>
			<td style="width:119px;">631-1331</td>
			<td style="width:167px;">Embryo/adult mounting</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">Cover glass 24x60 mm</td>
			<td style="width:71px;">VWR</td>
			<td style="width:119px;">631-1339</td>
			<td style="width:167px;">Embryo mounting</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">Scalpel</td>
			<td style="width:71px;">VWR</td>
			<td style="width:119px;">233-5455</td>
			<td style="width:167px;">Embryo dissection</td>
		</tr>
		<tr height="43">
			<td height="43" style="height:43px;width:216px;">Silicone tubing</td>
			<td style="width:71px;">VWR</td>
			<td style="width:119px;">228-1501</td>
			<td style="width:167px;">Tubing for mouth pipette</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">30 mm PTFE membrane filter</td>
			<td style="width:71px;">NeoLab</td>
			<td style="width:119px;">Jul-01</td>
			<td style="width:167px;">Filter for mouth pipette</td>
		</tr>
		<tr height="43">
			<td height="43" style="height:43px;width:216px;">Capillary tubes</td>
			<td style="width:71px;">VWR</td>
			<td style="width:119px;">621-0003</td>
			<td style="width:167px;">Pipette tip for mouth pipette</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">Vaseline</td>
			<td style="width:71px;">Roth</td>
			<td style="width:119px;">E746.1</td>
			<td style="width:167px;">Embryo/adult mounting</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">Agar</td>
			<td style="width:71px;">Roth</td>
			<td style="width:119px;">5210.5</td>
			<td style="width:167px;">Adult animal mounting</td>
		</tr>
		<tr height="43">
			<td height="43" style="height:43px;width:216px;">Potassium-di-hydrogenphosphate</td>
			<td style="width:71px;">Roth</td>
			<td style="width:119px;">P018.2</td>
			<td style="width:167px;">M9 buffer</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">Di-sodium- hydrogenphosphate</td>
			<td style="width:71px;">Roth</td>
			<td style="width:119px;">P030.2</td>
			<td style="width:167px;">M9 buffer</td>
		</tr>
		<tr height="22">
			<td height="22" style="height:22px;width:216px;">Sodium chloride</td>
			<td style="width:71px;">Roth</td>
			<td style="width:119px;">3957.1</td>
			<td style="width:167px;">M9 buffer</td>
		</tr>
		<tr height="43">
			<td height="43" style="height:43px;width:216px;">VisiScope Spinning Disc Confocal System</td>
			<td style="width:71px;">Visitron Systems</td>
			<td style="width:119px;">n/a</td>
			<td style="width:167px;">Confocal microscopy</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

tracking and quantifying developmental processes in c. elegans using open-source tools

정량적으로 개발 프로세스를 캡처하는 것은 돌연변이의 표현형을 식별하고 설명하는 기계적인 모델과 키를 유도하는 것이 중요하다. 여기 프로토콜은 배아와 성인 C. 제조되게됩니다 엘레 장단기 시간 경과 현미경 동물과 발달 과정의 추적 및 정량 방법. 제시된 방법은 모든 C.에 기초 쉽게 사용되는 현미경 시스템의 독립적 실험실에서 구현 될 수 Caenorhabditis 엘레 유전학 센터에서 사용할 수 있으며 오픈 소스 소프트웨어에 간스 균주. 모델링 소프트웨어 IMO​​D를 이용하여 3 차원 셀 형상 모델의 재구성, - 형광 표지 된 세포 내 구조물 다목적 이미지 분석 프로그램 Endrov 및 PIVlab를 사용하여 피질 수축 흐름 분석을 사용하여 수동으로 추적 (시분 디지털 입자 화상 유속계 MATLAB에 대한 도구) 표시됩니다. 그것은 T 이러한 방법도 배포 할 수있는 방법을 설명합니다O를 정량적으로 소포 흐름의 추적, 추적 다른 모델, 예를 들면, 세포 추적 및 계보의 다른 발달 과정을 캡처합니다.

프로토콜 2, 3, 4, 야생형 C. 생식선에서의 시간 경과 이미징을 사용하여 엘레 성인이 수행 (변형 OD58 (UNC-119 (ED3) III; ltIs38 [pAA1, 파이-1 :: GFP :: PH (PLC1delta1) + UNC-119 (+)), 생식 세포 프로모터에서 막 마커를 발현하는 ). 생식선의 회전을 중심으로, 생식 세포의 3D 모델은 현미경 데이터 (그림 2)에서 생성됩니다. 이 모델은, 세포의 통과는 기단 아암 선단을 형성하는 동안 셀 크기?...

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Tracking and Quantifying Developmental Processes in C. elegans Using Open-source Tools

의 발달 프로세스 추적 및 정량화<em&gt; C. 엘레</em&gt; 오픈 소스 도구를 사용하여

Here it is shown how to track and quantify developmental processes in C. elegans. The methods presented are based on open-source tools that can be easily implemented. It is demonstrated how to reconstruct 3D cell-shape models, how to manually track subcellular structures, and how to analyze cortical contractile flow.

Quantitatively capturing developmental processes is crucial to derive mechanistic models and key to identify and describe mutant phenotypes. Here ...

tracking-quantifying-developmental-processes-c-elegans-using-open

Universidad de Cartagena UDEC

Research

JoVE Journal

Biology

Tracking and Quantifying Developmental Processes in C. elegans Using Open-source Tools

8.8K 조회수.  Goethe University. Here it is shown how to track and quantify developmental processes in C. elegans. The methods presented are based on open-source tools that can be easily implemented. It is demonstrated how to reconstruct 3D cell-shape models, how to manually track subcellular structures, and how to analyze cortical contractile flow.

비디오: Tracking and Quantifying Developmental Processes in C. elegans Using Open-source Tools

Using Micro-Electro-Mechanical Systems (MEMS) to Develop Diagnostic Tools

Using Micro-Electro-Mechanical Systems MEMS to Develop Diagnostic Tools

진단 도구를 개발하기 위해 마이크로 전자 기계 시스템 (MEMS)를 사용

연구

생물학

Generation of Stable Transgenic C. elegans Using Microinjection

Transgenic Caenorhabditis elegans can be readily created via microinjection of a DNA plasmid solution into the gonad 1. The plasmid DNA rearranges to form extrachromosomal concatamers that are stably inherited, though not with the same efficiency as actual chromosomes 2. A gene of interest is co-injected with an obvious phenotypic marker, such as rol-6 or GFP, to allow selection of transgenic animals under a dissecting microscope. The exogenous gene may be expressed from its native promoter for cellular localization studies. Alternatively, the transgene can be driven by a different tissue-specific promoter to assess the role of the gene product in that particular cell or tissue. This technique efficiently drives gene expression in all tissues of C. elegans except for the germline or early embryo 3. Creation of transgenic animals is widely utilized for a range of experimental paradigms. This video demonstrates the microinjection procedure to generate transgenic worms. Furthermore, selection and maintenance of stable transgenic C. elegans lines is described.

This video demonstrates the technique of microinjection into the gonad of C. elegans to create transgenic animals.

Microinjection을 사용하여 안정적인 트렌스​​ 제닉 C. 엘레간스의 생성

Transgenic Caenorhabditis elegans can be readily created via microinjection of a DNA plasmid solution into the gonad 1.  The plasmid DNA rearranges to ...

Imaging C. elegans Embryos using an Epifluorescent Microscope and Open Source Software

Cellular processes, such as chromosome assembly, segregation and cytokinesis,are inherently dynamic. Time-lapse imaging of living cells, using fluorescent-labeled reporter proteins or differential interference contrast (DIC) microscopy, allows for the examination of the temporal progression of these dynamic events which is otherwise inferred from analysis of fixed samples1,2. Moreover, the study of the developmental regulations of cellular processes necessitates conducting time-lapse experiments on an intact organism during development. The Caenorhabiditis elegans embryo is light-transparent and has a rapid, invariant developmental program with a known cell lineage3, thus providing an ideal experiment model for studying questions in cell biology4,5and development6-9. C. elegans is amendable to genetic manipulation by forward genetics (based on random mutagenesis10,11) and reverse genetics to target specific genes (based on RNAi-mediated interference and targeted mutagenesis12-15). In addition, transgenic animals can be readily created to express fluorescently tagged proteins or reporters16,17. These traits combine to make it easy to identify the genetic pathways regulating fundamental cellular and developmental processes in vivo18-21. In this protocol we present methods for live imaging of C. elegans embryos using DIC optics or GFP fluorescence on a compound epifluorescent microscope. We demonstrate the ease with which readily available microscopes, typically used for fixed sample imaging, can also be applied for time-lapse analysis using open-source software to automate the imaging process.

Imaging C. elegans Embryos using an Epifluorescent Microscope and Open Source Software

The C. elegans embryo is a powerful system for studying cell biology and development. We present a protocol for live imaging of C. elegans embryos utilizing DIC optics or fluorescence using readily available epifluorescent microscopes and open-source software.

이미징 C. 엘레간스</emEpifluorescent 현미경과 오픈 소스 소프트웨어를 사용> 태아

Cellular processes, such as chromosome assembly, segregation and cytokinesis,are inherently dynamic. Time-lapse imaging of living cells, using ...

Activation of Apoptosis by Cytoplasmic Microinjection of Cytochrome c

Apoptosis, or programmed cell death, is a conserved and highly regulated pathway by which cells die1. Apoptosis can be triggered when cells encounter a wide range of cytotoxic stresses. These insults initiate signaling cascades that ultimately cause the release of cytochrome c from the mitochondrial intermembrane space to the cytoplasm2. The release of cytochrome c from mitochondria is a key event that triggers the rapid activation of caspases, the key cellular proteases which ultimately execute cell death3-4.
The pathway of apoptosis is regulated at points upstream and downstream of cytochrome c release from mitochondria5. In order to study the post-mitochondrial regulation of caspase activation, many investigators have turned to direct cytoplasmic microinjection of holocytochrome c (heme-attached) protein into cells6-9. Cytochrome c is normally localized to the mitochondria where attachment of a heme group is necessary to enable it to activate apoptosis10-11. Therefore, to directly activate caspases, it is necessary to inject the holocytochrome c protein instead of its cDNA, because while the expression of cytochrome c from cDNA constructs will result in mitochondrial targeting and heme attachment, it will be sequestered from cytosolic caspases. Thus, the direct cytosolic microinjection of purified heme-attached cytochrome c protein is a useful tool to mimic mitochondrial cytochrome c release and apoptosis without the use of toxic insults which cause cellular and mitochondrial damage.
In this article, we describe a method for the microinjection of cytochrome c protein into cells, using mouse embryonic fibroblasts (MEFs) and primary sympathetic neurons as examples. While this protocol focuses on the injection of cytochrome c for investigations of apoptosis, the techniques shown here can also be easily adapted for microinjection of other proteins of interest.

Activation of Apoptosis by Cytoplasmic Microinjection of Cytochrome c

In this protocol, we describe the direct cytoplasmic microinjection of cytochrome c protein into fibroblasts and primary sympathetic neurons. This technique allows for the introduction of cytochrome c protein into the cytoplasm of cells and mimics the release of cytochrome c from mitochondria, which occurs during apoptosis.

시토크롬의 세포질 Microinjection 의한 Apoptosis의 활성화 C</em

Apoptosis, or programmed cell death, is a conserved and highly regulated pathway by which cells die1.  Apoptosis can be triggered when cells encounter a ...

Antibody Staining in C. Elegans Using &quot;Freeze-Cracking&quot;

To stain C. elegans with antibodies, the relatively impermeable cuticle must be bypassed by chemical or mechanical methods. "Freeze-cracking" is one method used to physically pull the cuticle from nematodes by compressing nematodes between two adherent slides, freezing them, and pulling the slides apart. Freeze-cracking provides a simple and rapid way to gain access to the tissues without chemical treatment and can be used with a variety of fixatives. However, it leads to the loss of many of the specimens and the required compression mechanically distorts the sample. Practice is required to maximize recovery of samples with good morphology. Freeze-cracking can be optimized for specific fixation conditions, recovery of samples, or low non-specific staining, but not for all parameters at once. For antibodies that require very hard fixation conditions and tolerate the chemical treatments needed to chemically permeabilize the cuticle, treatment of intact nematodes in solution may be preferred. If the antibody requires a lighter fix or if the optimum fixation conditions are unknown, freeze-cracking provides a very useful way to rapidly assay the antibody and can yield specific subcellular and cellular localization information for the antigen of interest.

Antibody Staining in C. Elegans Using "Freeze-Cracking"

"Freeze-cracking," a method for exposing the inner tissues of the nematode C. elegans to antibodies for protein localization, is demonstrated.

항체 염색법에<em&gt; C. 엘레</em&gt; &quot;동결 크래킹 사용&quot;

To stain C.  elegans with antibodies, the relatively impermeable cuticle must be  bypassed by chemical or mechanical methods.  "Freeze-cracking" is one ...

Methods for Skin Wounding and Assays for Wound Responses in C. elegans

The C. elegans epidermis and cuticle form a simple yet sophisticated skin layer that can repair localized damage resulting from wounding. Studies of wound responses and repair in this model have illuminated our understanding of the cytoskeletal and genomic responses to tissue damage. The two most commonly used methods to wound the C. elegans adult skin are pricks with microinjection needles, and local laser irradiation. Needle wounding locally disrupts the cuticle, epidermis, and associated extracellular matrix, and may also damage internal tissues. Laser irradiation results in more localized damage. Wounding triggers a succession of readily assayed responses including elevated epidermal Ca2+ (seconds-minutes), formation and closure of an actin-containing ring at the wound site (1-2 hr), elevated transcription of antimicrobial peptide genes (2-24 hr), and scar formation. Essentially all wild type adult animals survive wounding, whereas mutants defective in wound repair or other responses show decreased survival. Detailed protocols for needle and laser wounding, and assays for quantitation and visualization of wound responses and repair processes (Ca dynamics, actin dynamics, antimicrobial peptide induction, and survival) are presented.

Methods for Skin Wounding and Assays for Wound Responses in C. elegans

The adult C. elegans skin is a tractable model for studies of epithelial wound responses, including wound closure, scar formation, and innate immunity.

에 상처 응답에 대한 피부 상처에 대한 방법 및 분석 실험<em&gt; C. 엘레</em

The C. elegans epidermis and cuticle form a simple yet sophisticated skin layer that can repair localized damage resulting from wounding. Studies of wound ...

Open Source High Content Analysis Utilizing Automated Fluorescence Lifetime Imaging Microscopy

We present an open source high content analysis instrument utilizing automated fluorescence lifetime imaging (FLIM) for assaying protein interactions using F&#246;rster resonance energy transfer (FRET) based readouts of fixed or live cells in multiwell plates. This provides a means to screen for cell signaling processes read out using intramolecular FRET biosensors or intermolecular FRET of protein interactions such as oligomerization or heterodimerization, which can be used to identify binding partners. We describe here the functionality of this automated multiwell plate FLIM instrumentation and present exemplar data from our studies of HIV Gag protein oligomerization and a time course of a FRET biosensor in live cells. A detailed description of the practical implementation is then provided with reference to a list of hardware components and a description of the open source data acquisition software written in &#181;Manager. The application of FLIMfit, an open source MATLAB-based client for the OMERO platform, to analyze arrays of multiwell plate FLIM data is also presented. The protocols for imaging fixed and live cells are outlined and a demonstration of an automated multiwell plate FLIM experiment using cells expressing fluorescent protein-based FRET constructs is presented. This is complemented by a walk-through of the data analysis for this specific FLIM FRET data set.

We present an open source high content analysis (HCA) instrument utilizing automated fluorescence lifetime imaging (FLIM) for assaying protein interactions using F&#246;rster resonance energy transfer (FRET) based readouts. Data acquisition for this openFLIM-HCA instrument is controlled by software written in &#181;Manager and data analysis is undertaken in FLIMfit.

자동 형광 수명 이미징 현미경을 활용하여 오픈 소스 높은 콘텐츠 분석

We present an open source high content analysis instrument utilizing automated fluorescence lifetime imaging (FLIM) for assaying protein interactions ...

Open-source Single-particle Analysis for Super-resolution Microscopy with VirusMapper

Super-resolution fluorescence microscopy is currently revolutionizing cell biology research. Its capacity to break the resolution limit of around 300 nm allows for the routine imaging of nanoscale biological complexes and processes. This increase in resolution also means that methods popular in electron microscopy, such as single-particle analysis, can readily be applied to super-resolution fluorescence microscopy. By combining this analytical approach with super-resolution optical imaging, it becomes possible to take advantage of the molecule-specific labeling capacity of fluorescence microscopy to generate structural maps of molecular elements within a metastable structure. To this end, we have developed a novel algorithm &#8212; VirusMapper &#8212; packaged as an easy-to-use, high-performance, and high-throughput ImageJ plugin. This article presents an in-depth guide to this software, showcasing its ability to uncover novel structural features in biological molecular complexes. Here, we present how to assemble compatible data and provide a step-by-step protocol on how to use this algorithm to apply single-particle analysis to super-resolution images.

This manuscript uses the Fiji-based open-source software package VirusMapper to apply single-particle analysis to super-resolution microscopy images in order to generate precise models of nanoscale structure.

VirusMapper 슈퍼 해상도 현미경을위한 오픈 소스 단일 입자 분석

Super-resolution fluorescence microscopy is currently revolutionizing cell biology research. Its capacity to break the resolution limit of around 300 nm ...

Visualizing and Tracking Endogenous mRNAs in Live Drosophila melanogaster Egg Chambers

Fluorescence-based imaging techniques, in combination with developments in light microscopy, have revolutionized how cell biologists conduct live cell imaging studies. Methods for detecting RNAs have expanded greatly since seminal studies linked site-specific mRNA localization to gene expression regulation. Dynamic mRNA processes can now be visualized via approaches that detect mRNAs, coupled with microscopy set-ups that are fast enough to capture the dynamic range of molecular behavior. The molecular beacon technology is a hybridization-based approach capable of direct detection of endogenous transcripts in living cells. Molecular beacons are hairpin-shaped, internally quenched, single-nucleotide discriminating nucleic acid probes, which fluoresce only upon hybridization to a unique target sequence. When coupled with advanced fluorescence microscopy and high-resolution imaging, they enable one to perform spatial and temporal tracking of intracellular movement of mRNAs. Although this technology is the only method capable of detecting endogenous transcripts, cell biologists have not yet fully embraced this technology due to difficulties in designing such probes for live cell imaging. A new software application, PinMol, allows for enhanced and rapid design of probes best suited to efficiently hybridize to mRNA target regions within a living cell. In addition, high-resolution, real-time image acquisition and current, open source image analysis software allow for a refined data output, leading to a finer evaluation of the complexity underlying the dynamic processes involved in the mRNA&#39;s life cycle.
Here we present a comprehensive protocol for designing and delivering molecular beacons into Drosophila melanogaster egg chambers. Direct and highly specific detection and visualization of endogenous maternal mRNAs is performed via spinning disc confocal microscopy. Imaging data is processed and analyzed using object detection and tracking in Icy software to obtain details about the dynamic movement of mRNAs, which are transported and localized to specialized regions within the oocyte.

Visualizing and Tracking Endogenous mRNAs in Live Drosophila melanogaster Egg Chambers

Here, we present a protocol for the visualization, detection, analysis and tracking of endogenous mRNA trafficking in live Drosophila melanogaster egg chamber using molecular beacons, spinning disc confocal microscopy, and open-source analysis software.

라이브 드로소필라 멜라노가스터 에그 챔버에서 내인성 mRNA 를 시각화하고 추적

Fluorescence-based imaging techniques, in combination with developments in light microscopy, have revolutionized how cell biologists conduct live cell ...

Measuring RAN Peptide Toxicity in C. elegans

C. elegans is commonly used to model age-related neurodegenerative diseases caused by repeat expansion mutations, such as Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) and Huntington&#8217;s disease. Recently, repeat expansion-containing RNA was shown to be the substrate for a novel type of protein translation called repeat-associated non-AUG-dependent (RAN) translation. Unlike canonical translation, RAN translation does not require a start codon and only occurs when repeats exceed a threshold length. Because there is no start codon to determine the reading frame, RAN translation occurs in all reading frames from both sense and antisense RNA templates that contain a repeat expansion sequence. Therefore, RAN translation expands the number of possible disease-associated toxic peptides from one to six. Thus far, RAN translation has been documented in eight different repeat expansion-based neurodegenerative and neuromuscular diseases. In each case, deciphering which RAN products are toxic, as well as their mechanisms of toxicity, is a critical step towards understanding how these peptides contribute to disease pathophysiology. In this paper, we present strategies to measure the toxicity of RAN peptides in the model system C. elegans. First, we describe procedures for measuring RAN peptide toxicity on the growth and motility of developing C. elegans. Second, we detail an assay for measuring postdevelopmental, age-dependent effects of RAN peptides on motility. Finally, we describe a neurotoxicity assay for evaluating the effects of RAN peptides on neuron morphology. These assays provide a broad assessment of RAN peptide toxicity and may be useful for performing large-scale genetic or small molecule screens to identify disease mechanisms or therapies.

Measuring RAN Peptide Toxicity in C. elegans

Repeat-associated non-ATG-dependent translational products are emerging pathogenic features of several repeat expansion-based diseases. The goal of the protocol described is to evaluate toxicity caused by these peptides using behavioral and cellular assays in the model system C. elegans.

C. 예쁜꼬마선충에서 RAN 펩타이드 독성 측정

C. elegans is commonly used to model age-related neurodegenerative diseases caused by repeat expansion mutations, such as Amyotrophic Lateral Sclerosis ...

의 발달 프로세스 추적 및 정량화

요약

더 많은 비디오 탐색

이 비디오의 챕터

진단 도구를 개발하기 위해 마이크로 전자 기계 시스템 (MEMS)를 사용

Microinjection을 사용하여 안정적인 트렌스 제닉 C. 엘레간스의 생성

이미징 C. 엘레간스 태아

시토크롬의 세포질 Microinjection 의한 Apoptosis의 활성화 C

항체 염색법에

에 상처 응답에 대한 피부 상처에 대한 방법 및 분석 실험

자동 형광 수명 이미징 현미경을 활용하여 오픈 소스 높은 콘텐츠 분석

VirusMapper 슈퍼 해상도 현미경을위한 오픈 소스 단일 입자 분석

라이브 드로소필라 멜라노가스터 에그 챔버에서 내인성 mRNA 를 시각화하고 추적

C. 예쁜꼬마선충에서 RAN 펩타이드 독성 측정

의 발달 프로세스 추적 및 정량화

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진단 도구를 개발하기 위해 마이크로 전자 기계 시스템 (MEMS)를 사용

Microinjection을 사용하여 안정적인 트렌스​​ 제닉 C. 엘레간스의 생성

이미징 C. 엘레간스 태아

시토크롬의 세포질 Microinjection 의한 Apoptosis의 활성화 C

항체 염색법에

에 상처 응답에 대한 피부 상처에 대한 방법 및 분석 실험

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VirusMapper 슈퍼 해상도 현미경을위한 오픈 소스 단일 입자 분석

라이브 드로소필라 멜라노가스터 에그 챔버에서 내인성 mRNA 를 시각화하고 추적

C. 예쁜꼬마선충에서 RAN 펩타이드 독성 측정

Microinjection을 사용하여 안정적인 트렌스 제닉 C. 엘레간스의 생성