質量分析では、シクロアルカンは、直鎖または分岐鎖アルカンと比較して分子イオンの固有の安定性により、明確なフラグメンテーションパターンを示します。シクロアルカンの環構造は分子イオンにさらなる安定性をもたらし、多くの場合、質量スペクトルで顕著なイオンピークをもたらします。
たとえば、シクロヘキサン分子イオンの質量電荷比 (m/z) は 84 で、ヘキサンなどの直鎖アルカンよりも強い信号を生成する傾向があります。この安定性は、イオンを安定化する閉環構造に由来します。シクロヘキサンの一般的なフラグメンテーション経路では、エチレン分子 (C_2H_4) が失われ、m/z が 56 のラジカルカチオンが残ります。この結果として生じるカチオンは非常に安定しており、質量スペクトルで最も強い信号であるベースピークを形成することがよくあります。
図 1. シクロヘキサン分子イオンのフラグメンテーション。
メチルシクロペンタンなどの分岐シクロアルカンは、側鎖による追加のフラグメンテーション経路を示します。典型的なエチレンの損失に加えて、分子イオンはメチル基 (CH_3) などの側鎖も失う可能性があります。たとえば、分子イオンはメチルラジカル (CH_3•) を失い、シクロペンチルカチオンになります。このシクロペンチルカチオンはさらにフラグメント化し、通常はエチレンの損失につながり、安定したプロピルラジカルカチオンになります。
これらのフラグメンテーションパターンは、リング構造と分岐が質量分析計のイオン安定性にどのように影響するかを示しています。エチレンや側鎖などの小さな分子の特徴的な損失により、非常に安定したカチオンが生成され、スペクトルの顕著なピークとして観察されます。
図 2. メチルシクロペンタンが (上) エテンとブチルラジカルカチオンのフラグメンテーション、(下) メチルラジカルとシクロペンチルカルボカチオンは、シクロペンチルカルボカチオンのさらなるフラグメンテーションが続く。
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