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Method Article
* Questi autori hanno contribuito in egual misura
Qui, presentiamo due protocolli per la registrazione della micro-elettrocorticografia ad alta densità (μEcoG) in ratti e topi, inclusi metodi chirurgici, di impianto e di registrazione. Le registrazioni μECoG vengono eseguite in combinazione con la registrazione di politrodi laminari nella corteccia uditiva del ratto o con la manipolazione optogenetica dell'attività neurale nella corteccia somatosensoriale del topo.
L'elettrocorticografia (ECoG) è un ponte metodologico tra le neuroscienze di base e la comprensione della funzione cerebrale umana in salute e malattia. ECoG registra i segnali neurofisiologici direttamente dalla superficie corticale con risoluzione temporale al millisecondo e risoluzione spaziale colonnare su ampie regioni di tessuto corticale contemporaneamente, rendendolo in una posizione unica per studiare calcoli corticali sia locali che distribuiti. In questo articolo, descriviamo la progettazione di dispositivi micro-ECoG (μECoG) personalizzati ad alta densità e il loro utilizzo in due procedure. Queste griglie hanno 128 elettrodi a bassa impedenza con spaziatura di 200 μm fabbricati su un substrato polimerico trasparente con perforazioni tra gli elettrodi; queste caratteristiche consentono la registrazione simultanea di μECoG con registrazioni di politrodi laminari e manipolazioni optogenetiche. In primo luogo, presentiamo un protocollo per la registrazione combinata di μECoG epidurale sulla corteccia somatosensoriale dei baffi di topi con manipolazione optogenetica di specifici tipi di cellule corticali geneticamente definite. Ciò consente la dissezione causale dei contributi distinti di diverse popolazioni neuronali all'elaborazione sensoriale, monitorando anche le loro firme specifiche nei segnali μECoG. In secondo luogo, presentiamo un protocollo per esperimenti acuti per registrare l'attività neurale dalla corteccia uditiva del ratto utilizzando griglie μECoG e politrodi laminari. Ciò consente una mappatura topografica dettagliata delle risposte neurali evocate sensorialmente attraverso la superficie corticale contemporaneamente con registrazioni da più unità neurali distribuite in tutta la profondità corticale. Questi protocolli consentono esperimenti che caratterizzano l'attività corticale distribuita e possono contribuire alla comprensione e agli eventuali interventi per diversi disturbi neurologici.
Le funzioni cerebrali alla base della sensazione, della cognizione e dell'azione sono organizzate e distribuite su vaste scale spaziali e temporali, che vanno dai picchi di singoli neuroni ai campi elettrici generati da popolazioni di neuroni in una colonna corticale all'organizzazione topografica delle colonne attraverso le aree cerebrali (ad esempio, la somatotopia nella corteccia somatosensoriale, la tonotopia nella corteccia uditiva primaria). La comprensione della funzione cerebrale richiede il rilevamento di segnali elettrici su queste scale spaziali1. Le neuroscienze hanno attualmente molti metodi ampiamente utilizzati per monitorare l'attività del cervello. Elettrofisiologicamente, i politrodi laminari (come i neuropixel) consentono il monitoraggio di un numero modesto (~300) di singoli neuroni, tipicamente all'interno di una manciata di colonne distanti tra loro, con un'alta risoluzione temporale (≥1 kHz). L'imaging Ca2+ consente il monitoraggio di un numero da modesto a elevato di singoli neuroni identificati geneticamente e anatomicamente entro un'estensione spaziale di ~1-2 mm a una risoluzione temporale inferiore (~10 Hz)2. La fMRI consente di monitorare lo stato metabolico di un gran numero di neuroni (~1 M di neuroni in un volume di 36 mm3 ) in tutto il cervello a una risoluzione temporale molto bassa (~0,2 Hz). L'EEG/MEG consente il monitoraggio dell'attività elettrica dell'intera superficie corticale/cervello a una risoluzione temporale modesta (<100 Hz) e a una risoluzione spaziale molto bassa (centimetri)3. Mentre ognuna di queste metodologie ha fornito intuizioni fondamentali e sinergiche sulla funzione cerebrale, sono nascenti metodi che consentono il rilevamento diretto di segnali elettrofisiologici ad alta risoluzione temporale da precise posizioni anatomiche in ampie regioni spaziali della corteccia. La necessità di un'ampia copertura spaziale è enfatizzata dal fatto che nel cervello, la funzione neuronale cambia molto più drasticamente sulla superficie rispetto alla profondità4.
L'elettrocorticografia (ECoG) è un metodo in cui griglie di elettrodi a bassa impedenza vengono impiantate sulla superficie del cervello e consentono la registrazione o la stimolazione della corteccia 1,5. L'ECoG è tipicamente impiegata in contesti neurochirurgici umani come parte del work-up clinico per il trattamento dell'epilessia farmacologicamente intrattabile. Tuttavia, fornisce anche informazioni uniche sull'elaborazione corticale distribuita negli esseri umani, come la mappatura topografica vocale e sensoriale 6,7. Queste capacità ne hanno motivato l'uso in modelli animali, tra cui scimmie, ratti e topi 5,8,9,10,11. Nei roditori, è stato recentemente dimostrato che la micro-ECoG (μECoG) consente un monitoraggio elettrico diretto ad alta risoluzione temporale (~100 Hz) di popolazioni neuronali con risoluzione spaziale colonnare (~200 μm) e ampia copertura spaziale (molti millimetri). μECoG consente ai ricercatori di studiare le dinamiche neurali distribuite associate a complesse elaborazioni sensoriali, funzioni cognitive e comportamenti motori in modelli animali12,13. Recenti progressi hanno integrato μECoG con l'optogenetica e le registrazioni di politrodi laminari 14,15,16,17,18,19,20, consentendo indagini multiscala delle reti corticali e colmando il divario tra l'attività neuronale su microscala e la dinamica corticale su macroscala 21,22. Criticamente, poiché il segnale μECoG è molto simile negli esseri umani e nei modelli animali non umani, l'uso di μECoG rende la traduzione dei risultati e dei risultati dai modelli animali all'uomo molto più diretta23. Pertanto, gli approcci integrativi sono fondamentali per far progredire la nostra comprensione dei circuiti neurali e sono promettenti per lo sviluppo di nuovi interventi terapeutici per i disturbi neurologici 5,24,25.
Di conseguenza, vi è una necessità emergente di protocolli che integrino array di μECoG ad alta densità con registrazioni laminari e strumenti optogenetici per consentire indagini multiscala complete dell'elaborazione corticale 8,26. Per colmare questa lacuna, abbiamo sviluppato dispositivi μECoG progettati su misura con 128 elettrodi a bassa impedenza con diametro dell'elettrodo di 40 μm e spaziatura tra gli elettrodi di 20 μm su un substrato polimerico flessibile e trasparente (parylene-C e poliimmide) con perforazioni tra gli elettrodi, consentendo registrazioni simultanee di μECoG e politrodi laminari con manipolazioni optogenetiche13,22. Gli aspetti chiave di questo protocollo sperimentale includono: (i) risoluzione spaziale colonnare e copertura su larga scala dell'attività corticale attraverso array μECoG ad alta densità; (ii) la capacità di registrare da più strati corticali utilizzando politrodi laminari inseriti attraverso la griglia μECoG; e (iii) l'incorporazione di tecniche optogenetiche per attivare o inibire selettivamente specifiche popolazioni neuronali, consentendo così la dissezione causale dei circuiti neurali 27,28,29. La configurazione ad alta densità consente registrazioni ad alta risoluzione spaziale, fornendo efficacemente una "vista colonnare" dell'attività corticale, poiché studi precedenti hanno dimostrato che i segnali μECoG possono risolvere l'attività su una scala spaziale paragonabile al diametro della colonna corticale del roditore (~20 μm)11. Questa metodologia integrata consente il monitoraggio e la manipolazione simultanea su più scale dell'attività neurale, consentendo potenzialmente esperimenti causali per determinare le fonti neuronali dei segnali μECoG e l'elaborazione corticale distribuita. Per raggiungere questi obiettivi, questo manoscritto fornisce protocolli dettagliati per l'uso di array μECoG ad alta densità in due combinazioni.
In primo luogo, descriviamo la μECoG combinata con la manipolazione delle cellule piramidali dello strato 5 (L5) nella corteccia somatosensoriale primaria del topo (S1). Nel topo, l'array μECoG viene posizionato per via epidurale (a causa dell'intrattabilità chirurgica della durotomia nei topi). Una fibra ottica è posizionata sopra la griglia o combinata con una lente per focalizzare la luce optogenetica su una piccola area target della superficie corticale. La strategia optogenetica è qui descritta per l'inibizione dei neuroni eccitatori dello strato 5, ma può essere facilmente adattata a qualsiasi popolazione di neuroni dotati della corrispondente linea murina che esprime Cre. In secondo luogo, descriviamo l'uso combinato di μECoG con politrodi laminari di silicio per registrare simultaneamente i potenziali elettrici di superficie corticale (CSEP) e l'attività di picco di una singola unità da più neuroni attraverso gli strati corticali dalla corteccia uditiva di ratto (A1). L'array è dotato di perforazioni tra gli elettrodi, che consentono l'inserimento di politrodi laminari multicanale attraverso la griglia per registrare l'attività neuronale attraverso diversi strati corticali. Durante la procedura di craniotomia, l'array μECoG viene posizionato subduralmente sopra la corteccia uditiva e il politrodo laminare viene inserito attraverso le perforazioni. I segnali neurali provenienti dal μECoG e dalla sonda laminare vengono registrati simultaneamente, campionati rispettivamente a 6 kHz e 24 kHz, utilizzando un sistema di amplificazione collegato otticamente a un processore di segnale digitale.
Entrambi i protocolli seguono gli stessi passaggi chiave (anestesia, fissazione, craniotomia, registrazione μECoG) ma presentano notevoli differenze. Nella descrizione seguente, i passaggi condivisi sono uniti, mentre le specificità di ciascun protocollo sono annotate. Questi passaggi seguenti corrispondono alla registrazione μECoG con optogenetica (topo) o alla registrazione μECoG con una sonda laminare (ratto). Tutte le procedure qui descritte sono state condotte in conformità con le autorità etiche o legali locali (IACUC o Comitati Etici). I farmaci utilizzati possono variare in base al protocollo etico approvato.
1. Preparazione e protocollo per le procedure su topi e ratti
2. Chirurgia
3. Registrazione
Abbiamo descritto i protocolli per la registrazione dei segnali elettrocorticografici combinati con metodi optogenetici e registrazioni laminari. Qui vengono presentati i segnali tipici ottenuti dalla corteccia somatosensoriale del topo (Figura 1, Figura 2 e Figura 3) e all'interno della corteccia uditiva dei ratti in risposta alla stimolazione sensoriale (Figura 4,
I protocolli qui descritti consentono l'integrazione di array di micro-elettrocorticografia ad alta densità (μECoG) con sonde laminari e tecniche optogenetiche. La facilità d'uso di questo protocollo nei modelli di roditori lo rende un potente strumento per l'indagine della dinamica corticale e il numero di soggetti può essere facilmente aumentato. La griglia μECoG ad alta densità consente una mappatura efficiente e spazialmente precisa della topografia corticale in più aree in to...
Gli autori dichiarano di non avere interessi finanziari concorrenti.
Questo lavoro è stato supportato dal Lawrence Berkeley National Laboratory LDRD for the Neural Systems and Machine Learning Lab (K.E.B.), NINDSR01 NS118648A (K.E.B.& D.E.F.) e NINDS R01 NS092367 (D.E.F.).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1 disposable #11 blade | Swann Morton | 303 | For surgical procedures |
2 disposable #10 blades | Swann Morton | 3901 | For surgical procedures |
30 mm cage bars | Thorlabs | ER | cage components |
30 mm cage plate | Thorlabs | CP33T | holding the lenses |
70% ethanol | Decon Labs | V1016 | Cleaning / Disinfectant (diluted to 70%) |
Amalgambond PLUS Adjustable Precision Applicator Brush Teal 200/Bx | Henry Schein | 1869563 | precision applicator for the cement |
Amalgambond PLUS Catalyst 0.7 mL Syringe Ea | Henry Schein | 1861119 | cement component |
Amplifier (Tucker-Davis Technologies) | Tucker-Davis Technologies | PZ5M-512 | Used for auditory stimulus and recording software. |
Articulated arm | Noga | DG60103 | for holding the fine adjustment screw system |
Aspheric lenses for light collection (and one for focusing the light) | Thorlabs | ACL25416U-B | for collecting LED light |
Auditory equipment | Tucker-Davis Technologies, Sony, Cortera | RP2.1 Enhanced Real-Time Processor/HB7 Headphone Drive | Used for auditory stimulus and recording software. |
Buprenorphine | Sterile Products LLC | #42023017905 | General analgesia |
C&B Metabond Base Cement Ea | Henry Schein | 1864477 | cement component |
C&B Metabond L-Powder Cement Clear 3 g | Henry Schein | 1861068 | cement component |
Chlorprothixene hydrochloride (mouse) | Sigma Aldrich | Cat. No. C1671 | For sedation, must be prepared the same day and kept at 4 |
Custom-designed 128-channel micro-electrocorticography (μECoG) grids | Neuronexus | E128-200-8-40-HZ64 | For neurophysiology recordings. Placed onto the cortex. |
Dengofoam gelatin sponges | Dengen dental | 600034 (SKU) | can be used dry or wet, saturated with sterile sodium chloride solution |
Drill bit, size 5 to 9 (Mouse) | Fine Science Tools | 19007-XX | XX is the size of the drill bit e.g. 05 or 09. For mouse procedures |
Drill bitSteel Round Bur (5.5 mm/7.5 mm) | LZQ Tools | Dental Bar Drill Bit Stainless Steel Bur | For rat procedures |
Dumont No. 5 forceps | Fine Science Tools | 11251-10 | For surgical procedures |
Dumont tweezers #5 bent 45° | World precision instruments | 14101 | for removing craniotomy window |
DVD Player (Sony) | Sony | CDP-C345 | System used to accept and play back stimulus sets |
Electrostatic Speaker | Sony | XS-162ES | Used for auditory stimulus and recording software. Located within the rig, plays sound to the sedated rodent |
Enzymatic detergent (Enzol) | Advanced sterilization products | 2252 | Cleaning/Disinfectant |
EverEdge 2.0 Scaler Sickle Double End H6/H7 #9 | Henry Schein | 6011862 | for scrubing the skull |
Fine adjustment screw system in 3 dimension | Narishige | U-3C | for precise positioning of the optical fiber end |
Gold pin | Harwin Inc | G125-1020005 | Used for contact reference in mouse Soldered to the silver wire |
Gripping forceps | Fine Science Tools | 00632-11 | For surgical procedures |
Isoflurane | Covetrus | 11695067772 | require a vaporizer |
Ketamine (Hydrochloride Injection) (Rat) | Dechra | 17033-101-10 | Anesthesia/Analgesic |
LED | New Energy | LED XLAMP XPE2 BLUE STARBOARD | Blue LED light source |
LED driver | Thorlabs | LEDD1B | LED driver |
Lidocaine | Covetrus | VINB-0024-6800 | to be diluted to 1% in saline |
Meloxicam | Covetrus | 6451603845 | Anti-inflammatory used for general analgesia |
Micromanipulator | Narishige (Stereotaxic Rig) | SR-6R + SR-10R-HT components | Used to manipulate ECoG and rodent with fine movements |
No. 2 forceps | Fine Science Tools | 91117-10 | For surgical procedures |
No. 55 forceps | Fine Science Tools | 1129551 | For surgical procedures |
Ophtalmic lubricant (Artificial tears) | Akorn | 17478-062-35 | Used to protect eyes from dessication during surgical procedures |
Optical fiber 200µm Core diameter | Thorlabs | M133L02 | FC/PC connector 2 m long |
Pentobarbital (Rat) | Covetrus / Dechra | VINV-C0II-0008 | Anesthesia/Analgesic |
Platinum Black | Sigma | 205915-250MG | For neurophysiology recordings (Used for electroplating the contacts on the μECoG grids). |
Povidone Iodine 10% | Betadine | https://betadine.com/medical-professionals/betadine-solution/ | no catalog number ( not retail ) |
Powder detergent (Contrex AP) | Decon Labs | 5204 | Cleaning / Disinfectant |
Pre-cut tape for oxygen tube | ULINE (Various Providers) | S-14726 | Used to attach oxygen tube to the nose-cone of the rodent stereotaxic rig |
Scalpel handle # 3 | World precision instruments | 500236-G | for blades # 10, #11 and #15 |
Scraper | Fine Science Tools | 1007516 | For surgical procedures |
Short 30 G needles | ExelInt | 26437 | For surgical procedures and injections |
Silver Wire | Warner Instruments | 63-1319 | For neurophysiology recordings (Used for grounding and as a reference electrode). |
Sterilized saline (0.9% sodium chloride for injection) | Hospira | 00409-7101-67 (NDC) | For dilution of injectable, and replacement of body fluids |
Stoelting Hopkins Bulldog | Fine Science Tools | 10-000-481 | For surgical procedures |
Surface disinfectant (Coverage Plus NDP Disinfectant) | Steris life science | 638708 | Cleaning/Disinfectant |
TDT ZIF-clip connectors for acquisition. | Tucker-Davis Technologies | ZIF-Clip Analog Headstages | Connects ECoG with outside acquisition equipement |
Two-pronged holding fork | Tucker-Davis Technologies | Z-ROD128 | Used to connect the TDT-clips with the micromanipulator |
Xylazine (Rat) | Covetrus | 1XYL006 | Anesthesia/Analgesic |
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