צינור רב-תכליתי לניתוח שינויים דינמיים בגופים גרעיניים במגוון סוגי תאים

תחום המחקר העיקרי שלנו הוא מנגנון אפיגנטי המווסת את גמישות התא האנושי ואת ההסתגלות לסביבה. כיום אני מתמקד בחקר האופן שבו שינויים בכרומטיזציה בתוך עיבוי גרעיני גורמים לשלושה מצבים תאיים פתולוגיים. אני מאמין שחקר התכונות הביופיזיקליות של הכרומטיזציה פותח תחום חדש ומציע הזדמנויות ייחודיות לפיתוח גישות טיפוליות חדשניות.

מבחני אימונופלואורסנציה הם בעלי ערך לסינון ארגון חלבונים במעבים גרעיניים. עם זאת, גנטיקה אנושית יכולה להיות מאתגרת בגלל בעיות בחירת פרמטרים ונפח נתונים גדול בעת לימוד מצבים מרובים. אנו מציעים הדרכה מקיפה כיצד להשתמש בפרמטרים הנכונים ובצנרת ניתוח אוטומטית כדי לייעל את התהליך.

הפרוטוקול שלנו מנחה את המשתמש משלב הכנת הדגימה ועד לניתוח. סיפקנו תכנון צינור מדומה באמצעות Doza עם מומחיות מוגבלת בחישוב וניתוח תמונות. זרימת העבודה נגישה לכולם ללא עלות, וממנפת תוכנות הניתנות לאימוץ נרחב כמו Imogene ו- Python והשירות מבוסס הענן החינמי Google Colab.