בידוד גרעינים מרקמת שומן בין-שרירית אנושית וריצוף RNA חד-גרעיני במורד הזרם

קבוצת המחקר שלנו מנסה להבין את הרכב התא ואת פרופילי השעתוק הספציפיים לתאים של רקמת שומן בין-שרירית או IMAT בבני אדם. IMAT הוא למעשה מחסן שומן חוץ רחמי השוכן בין סיבי שריר וסביבם. טומוגרפיה ממוחשבת ו- MRI הצליחו לכמת נפח IMAT והראו לאחרונה כי הוא עולה הן עם הגיל והן עם ה- BMI, והוא קשור גם למחלות ניווניות שרירים.

מחקרי הפרשה חוץ גופית הראו לאחרונה כי לחלבונים המופרשים ב- IMAT יש יכולת להשפיע על רגישות לאינסולין, על פרופילים דלקתיים וגם על ביטויי חלבונים מתכווצים בשרירי השלד האנושי. הכמות המוגבלת של רקמת IMAT שנאספה במהלך ביופסיות והאופי עמוס השומנים של האדיפוציטים הופכים רקמה זו לבלתי תואמת לעיכול רקמות ולרנ"א של תא בודד. לכן, רצינו לפתח פרוטוקול שמבצע בידוד גרעינים על כמויות קטנות של רקמה שניתן להשתמש בו במורד הזרם של RNA-Seq של גרעינים בודדים.

פרוטוקול זה יאפשר לחוקרים לקבוע את שינויי השעתוק המורכבים והספציפיים לתאים המתרחשים ב- IMAT במצבי מחלה מטבוליים שונים ובתגובה להתערבויות. אנו מקווים שמידע זה יהיה חיוני בפיתוח אסטרטגיות טיפוליות חדשות שיסייעו להקל על מחלות מטבוליות על ידי התמקדות ישירה ב- IMAT או בגורמים המופרשים שלו. בתחום חסרים מאוד נתונים על הביולוגיה של IMAT, מקורותיו התאיים, ותקשורת עם תאים אחרים, השוכנים הן בתוך IMAT והן מחוצה לו, כמו גם תגובותיו המולקולריות להתערבויות באורח החיים, כגון דיאטה ופעילות גופנית או טיפול תרופתי.

כל אלה הן שאלות מחקר מרכזיות עבור הקבוצה שלנו.