כימות עמוד השדרה הדנדריטי באמצעות תוכנה אוטומטית לשחזור נוירונים תלת מימדיים

היקף המחקר שלנו הוא לבחון את הפרופיל המבני של עמוד השדרה הדנדריטי בהיפוקמפוס, במיוחד הדנדריט האפי CA-one. באמצעות זה, אנו מנסים לענות על שאלות המתמקדות באופן שבו קלטים שונים לחלקים שונים של אותו דנדריט יכולים להיות מקודדים ברמה התאית. אתגר אחד הוא השגת תמונות ברזולוציה גבוהה של קוצים דנדריטיים לניתוח עמוד השדרה.

ברגע שיש לך את התמונות האלה, השיטה לנתח את עמוד השדרה בצורה המדויקת והמהימנה ביותר באופן שאינו מכביד יתר על המידה על החוקר מהווה אתגר נוסף. יש לאזן בין שני המרכיבים. פרוטוקול זה מציע תווך שמח בין ניתוח ידני לחלוטין ואוטומטי לחלוטין של עמוד השדרה הדנדריטי.

הפרוטוקול שלנו מפחית את הנטל של ספירה ידנית של עמוד שדרה בודד. בנוסף, השחזור התלת-ממדי מאפשר לקבל נפח בעמוד השדרה. סווג את הקוצים בתת-הסוגים באופן אוטומטי.