9.8 : RNA Polymerase II Accessory Proteins

בתאים האיקריוטים, התחלת השעתוק היא תהליך מורכב הדורש תיאום קפדני בין רכיבי דנ"א מסוימים לבין רכיבי חלבון.

מלבד RNA פולימראז II וגורמי שעתוק, גורמים רגולטוריים אחרים מעורבים גם בוויסות ביטוי גנים במהלך התחלת השעתוק.

רצפי Enhancer הם אלמנט בקרת שעתוק כזה שיכול להפעיל את השפעתם ללא תלות במרחק שלהם מהמקדם.

מדובר במקטעי דנ"א רגולטוריים של כ-50 עד 200 זוגות בסיסים המכילים אתרי קישור מרובים לחלבוני בקרה גנטיים המכונים מפעילי שעתוק.

מפעילי שעתוק הם חלבונים מודולריים המורכבים משני תחומים, תחום קשירת DNA ותחום שפעול.

תחום קשירת הדנ"א מעגן את החלבון לרצף משפר ספציפי, בעוד תחום ההפעלה מקיים אינטראקציה עם אלמנטים שונים של מנגנון השעתוק כדי לעורר שעתוק.

עם זאת, אינטראקציה זו בין המפעיל לבין מכונות השעתוק דורשת נוכחות של קומפלקס רב-תת-יחידות הנקרא מתווך.

רשת החלבונים הגמישה מבחינה מבנית במתווך מעבירה אותות מהמפעיל ל-RNA פולימראז II ולגורמי שעתוק, מה שמביא להגברת השעתוק של גן מקושר שאחרת היה משועתק רק ברמה הבסיסית.

בניגוד לאקטיבטורים, המדכאים מווסתים את ביטוי הגנים על ידי עיכוב שעתוק.

מדכאים פעילים מכילים תחומים פונקציונליים המקיימים אינטראקציה עם גורמי שעתוק כלליים כדי להפריע להיקשרותם לדנ"א.

סוג מדכא אחר נקשר ליד אתר התחלת השעתוק, וחוסם את האינטראקציה של RNA פולימראז או גורמי שעתוק כלליים עם המקדם.

הסוג השלישי של מדכא מתחרה עם activators על קשירה למשפרים.

בסך הכל, הפעולות המשולבות של מספר חלבוני בקרת שעתוק שונים אחראיות לבקרת ביטוי גנים במהלך התפתחות עוברית והתמיינות תאים.