Abschätzung der strukturellen Empfindlichkeit von intrinsisch ungeordneten Regionen als Reaktion auf hyperosmotischen Stress in lebenden Zellen mit FRET

Unser Ziel ist es zu verstehen, wie intrinsisch ungeordnete Regionen Veränderungen der physikalisch-chemischen Eigenschaften der Umwelt wahrnehmen und darauf reagieren. Wir kombinieren biophysikalische, biochemische, genetische und zellbiologische Techniken, um zu überwachen, wie sich das strukturelle Ensemble ungeordneter Regionen in lebenden Zellen verändert. Proteinbiophysikalische Techniken werden derzeit verwendet, um die Bestätigung von IVRs zu untersuchen.

Dazu gehören Kernspinresonanz, Zirkulardichroismus, Kleinwinkel-Röntgenstreuung und FRET. Die meisten dieser Techniken können nur in vitro angewendet werden. Die Untersuchung der Bestätigung von IVRs in einem zellulären Kontext ist eine Herausforderung mit hohen Kosten und zeitaufwändigen Techniken.

Wir bieten eine Alternative, um diese Herausforderungen zu meistern. Unser Protokoll kann die Bestätigung von IVRs auf einfache, schnelle und reproduzierbare Weise überwachen und andere In-vitro-Methoden ergänzen. Unsere Ergebnisse boten ein Verständnis der molekularen Mechanismen, die der strukturellen Empfindlichkeit von IVRs unter Stress zugrunde liegen.

Dies ermöglicht den Einsatz von IVRs als somatische Biosensoren. Die genaue Verfolgung der zellulären Umgebung wird zu einem differenzierteren Verständnis der grundlegenden Prozesse des Lebens beitragen. Unsere Forschung hat zu Fragen zu den Determinanten einer strukturellen Sensitivität in intrinsisch ungeordneten Regionen, ihrer Relevanz für die Funktionen von IVR und den Umweltfaktoren, die diese Sensitivität beeinflussen, geführt.