Экономичный транскриптомный скрининг лекарственных препаратов

Транскриптомика позволяет глубже понять клеточные программы и их реакцию на внешние изменения. Однако, несмотря на значительное сокращение затрат на библиотечное производство и секвенирование за последние десятилетия, применение этой технологии в масштабах, необходимых для скрининга лекарств, по-прежнему остается недоступным, что препятствует огромному потенциалу этих методов. В нашем исследовании представлена экономически эффективная система скрининга лекарственных средств на основе транскриптома, сочетающая миниатюрные культуры возмущений с мини-объемной транскриптомикой.

Оптимизированный протокол mini-bulk обеспечивает информативный биологический сигнал на экономически эффективной глубине секвенирования, что позволяет проводить обширный скрининг известных лекарств и новых молекул. Одним из ключевых преимуществ сочетания транскриптомики с объективным скринингом лекарственных препаратов является возможность выявления новых мишеней для лекарственных препаратов, которые ранее не рассматривались. Традиционные подходы к скринингу лекарственных средств часто фокусируются на установленных молекулах-мишенях или путях, что затрудняет идентификацию новых мишеней и потенциально приводит к появлению лекарств с непредвиденными побочными эффектами и ограниченной эффективностью.