Наш протокол использует высокодоступную и открытую программу, которая позволяет быстро вычислять краткосрочные побочные эффекты эндокринных разрушающих химических веществ. Этот набор инструментов ОЭСР по ОЭСР полезен для прогнозирования токсичности химических веществ и обеспечивает эффективный метод оценки острой экотоксичности эндокринных разрушителей удобным для пользователя образом. При запуске инструментария «SSAR» пользователь начинает работу на этапе input Toolbox по умолчанию, и Toolbox автоматически создает рабочий файл под названием Document 1.
После нажатия номера химической абстрактной службы введите химический абстрактный номер службы целевого вещества в доступном текстовом поле и нажмите Поиск. С помощью кнопки «Структура» вещество также можно искать с помощью упрощенного молекулярного кода входной линии. Для выполнения анализа в силико для нескольких целевых веществ напишите простой список веществ в текстовом редакторе, в котором каждый химический абстрактный номер службы указан в одном ряду, и сохраните текстовый файл с соответствующим именем.
Далее щелкните Данные и подтвердите, что базы данных, перечисленные в Экотоксикологической информации, проверяются. Нажмите Вход, выберите запрос и нажмите Да в окне диалога, чтобы принять выбранные настройки. В соответствии с вкладкой Химическая абстрактная служба выберите список нагрузок для загрузки списка веществ, сохраненного в качестве текстового файла.
Нажмите Добавить в нижней части всплывающего меню и нажмите Выполнить. В наборе инструментов ЗСАР будет отображаться сообщение с указанием количества веществ, которые были извлечены для поиска. Для профилирования нажмите кнопку «Профильный инструментарий» и перейдите на кнопку «Методы профилирования» в панели опций этапа.
Нажмите Кнопку «Все в окне методов профилирования» и подтвердите, что все профилеры, перечисленные в предопределимых и профилаторах, связанных с водной токсичностью в соответствии с конкретными конечными точками, проверяются, а затем нажмите Apply, right click Parameters для запуска интегрированных 2D и 3D моделей SSAR по желанию. Для сбора данных нажмите кнопку «Инструментбокс данных» и нажмите «Соберите панель инструментов действий». Выберите все конечные точки, чтобы собрать все экспериментальные данные или выбрать Выбрать для сбора конечной точки конкретных экспериментальных данных.
Право нажмите на конечную точку интереса и организовать дерево конечной точки в предпочтительной манере, используя доступные термины и стрелки, прежде чем нажать Хорошо. Затем нажмите на конечную точку интереса и выберите Матрицу экспортных данных для экспорта собранных данных в электронную таблицу. Появится мастер экспорта матрицы, позволяющий добавление других конечных точек в список экспорта.
Закончите выбор и нажмите Экспорт, чтобы сохранить файл. Для заполнения пробелов в данных нажмите кнопку «Заполнение пробелов в данных» и нажмите кнопку «Автоматичный». Выберите Экотоксикологическую информацию и рыбу, смертельную концентрацию на 50% в 96 часов и нажмите Хорошо.
Появится окно контроллера рабочего процесса. При запуске режима Batch укажите диапазон веществ, над которыми выполняется рабочий процесс. Если предсказание было успешно выполнено, нажмите кнопку «Отчетный инструментарий», нажмите кнопку «Далее» на полученное значение прогноза, нажмите «Прогноз» и наполните содержимое отчета и его внешний вид во всплывающем мастере.
После нажатия Далее нажмите «Создайте отчет» и сохраните отчеты о прогнозах и категориях в качестве PDF-файлов и матрицы данных в качестве файла электронной таблицы. В этом количественном анализе прогнозируемых острых токсичностей отдельных эндокринных разрушителей, когда были построены прогнозируемые точки данных по сравнению с экспериментальными точками данных в виде шкалы журнала, была обнаружена положительная корреляция между обоими параметрами для всех проанализированных рыб, а также для наших репрезентативных видов. Для обеспечения оценки безопасности наивысшей надежности был проведен дальнейший вычислительный анализ путем построения прогнозируемого нижнего предела интервала уверенности в 95% смертельной концентрации на уровне 50% по сравнению с экспериментально полученными значениями.
В ходе этой оценки с повышенным порогом безопасности было показано, что 92% всех проверенных эндокринных разрушающих соединений попадают в защитный диапазон по сравнению с экспериментально полученными значениями. Здесь средние уровни прогнозируемой смертельной концентрации на 50%значения для связующих рецепторов эстрогена были выше, чем у не-связующих. В отличие от экспериментальной смертельной концентрации на 50%значения, три уровня не-и слабых связующих были выше, чем у сильных рецепторов эстрогена связующих.
Эта процедура может быть применена только к химическим веществам с уникальным идентификатором, который в данном случае является кодом SMILES. Есть еще один автоматизированный рабочий процесс, интегрированный в инструментарий ОЭСР, который может быть применен аналогичным образом и для сенсибилизации кожи.
