ביובנק לרפואה תרגומית: נהלי הפעלה סטנדרטיים לניהול דגימות אופטימלי

ביובנקים הם משאבים חיוניים למחקר תרגומי וקליני בסיסי, אך הם משמשים גם כשחקני מפתח המקשרים בין המחקר האקדמי לתעשיית הפארמה-ביוטק. פרוטוקול זה מציג את נהלי ההפעלה הסטנדרטיים של הביו-בנק ב-IAO, ביו-בנק מוסמך לחלוטין העובד בהתאם לתקן החדש ביותר לביוטכנולוגיה, ביו-בנקאות ודרישות כלליות לביו-בנקים. הזמינות של ביו-פסימנים איכותיים מחולי סרטן היא קריטית לפיתוח כלי אבחון מהדור הבא ומטפלים מתאימים אותם למטופלים בודדים.

Biobanking של חומר ביולוגי מחולה סרטן דורש כוח אדם מיוחד הסמכה רבים. כוח האדם חייב להיות מאומן ומעודכן כל הזמן. פרוטוקול זה חייב, אם כן, להיות נקודת המוצא עבור אלה המעוניינים להקים ביובנק.

כדי להתחיל, לשדר סרטון קריקטורה חינוכית בחדרי המתנה כדי ליידע את המטופלים על החשיבות של ההשפעה של RPA. ספק סימניות גאדג'טים לכל המטופלים. השתמש בתוכנת LIMS כדי לעקוב אחר כל הדגימות הביולוגיות.

זהה מטופלים באמצעות קודים. הקצה קוד ייחודי לכל אדם התואם למספר הרשומה הרפואית. בדוק אם המטופל נרשם לניסוי קליני או לפרויקט מחקר מאושר שצוין על-ידי השלמה נכונה של שדה פרויקט המחקר בכל פרופיל מטופל.

הודע לטכנאים אם הסיכון לזיהום אינו ידוע. השליכו דגימות עם תוצאות חיוביות או סיכונים לא ידועים. לקבלת דגימות טריות, רשום את דגימות הדם בתוכנת הביובנק.

תייג את ה- vacutainers עם קוד מזהה הביו-בנק ומסור אותם למשתמשים המורשים. עבור דגימות קפואות המאוחסנות בביובנק, הכינו שתי שפופרות מצופות קריובנק דו-ממדיות שכל אחת מהן מכילה 900 מיקרוליטרים של דם. רשום את aliquots בתוכנת biobank.

מניחים אותם על צלחת ברקוד מוגדרת ומאחסנים אותם במינוס 80 מעלות צלזיוס כדי להבטיח טמפרטורה קבועה. שופכים את הדם מצינורות האיסוף של EDTA לתוך הצינור החרוטי הסטרילי הריק של 50 מיליליטר ומדללים אותו באמצעות PBS סטרילי 1X. השתמש PBS כדי לשטוף את צינור הדם.

צנטריפוגה של הצינורות ב 400 RCF במשך 30 דקות ב 20 מעלות צלזיוס ולעבד את הצינורות תחת מכסה מנוע biohazard. לשחזר את השכבה הלבנה האמצעית המכילה PBMCs באמצעות פיפטה פסטר ולהניח אותו בצינור חרוטי סטרילי חדש 50 מיליליטר. הוסף עד 45 מיליליטר של PBS כדי לשטוף את PBMCs.

מערבבים וצנטריפוגות ב-400 RCF למשך 10 דקות בטמפרטורה של ארבע מעלות צלזיוס. לשחזר את הכדור ולהשהות אותו ב- PBS. לאחר מכן ספרו את התאים באמצעות תאי בורקר חד פעמיים.

חזור על שטיפת PBS עבור PBMCs כמתואר בכתב היד של הטקסט. דלל את ה- PBMCs בתווך המקפיא והכן צינורות מצופים קריובנק דו-ממדיים על ידי העברת מיליליטר אחד של תאים שעברו החייאה לכל צינור קריו. מניחים את הדוגמאות בקופסת קריו ספציפית ומאחסנים אותן במינוס 80 מעלות צלזיוס בהקדם האפשרי.

צנטריפוגה vacutainer המכיל את כל דגימות הדם ב 2, 000 G במשך 10 דקות בארבע מעלות צלזיוס. הסר את השכבה העליונה של הפלזמה באמצעות פיפטה פסטר שלושה מיליליטר ולהעביר אותו צינור חרוטי סטרילי 15 מיליליטר. ואז צנטריפוגה ב 16, 000 RCF במשך 10 דקות בארבע מעלות צלזיוס כדי לחסל תאי דם מזהמים.

העבר את הפלזמה לתוך מיליליטר אחד cryobank צינורות מצופים 2D. רשום את aliquots בתוכנת biobank. מניחים אותם על צלחת ברקוד ספציפית ומאחסנים אותם במינוס 80 מעלות כדי להבטיח טמפרטורה קבועה.

יש דגימות רקמה נבדקות על ידי פתולוג כדי לקבוע אם החומר שאינו נחוץ להליכי אבחון מספיק למטרות מחקר. במידת האפשר, לאסוף אפילו את המקבילה הלא פתולוגית של הרקמה הפתולוגית. הניחו את הדגימות בתרבית תאים סטרילית צלחות פטרי המסומנות כ-P ו-NP. שמרו את הרקמה על הקרח בארבע מעלות צלזיוס וחלקו אותה לשלושה חלקים כל אחד.

A, B ו-C אם יש מספיק חומר זמין. עבור דגימות רקמה טריות המסומנות כ-A, הניחו את האליקוטים הטריים של רקמת P ו-NP בצינורות עם מדיום התרבית המתאים המוגדר בכל פרוטוקול ספציפי ושלחו אותם ליחידות מחקר חיצוניות. עבור דגימות רקמת OCT המסומנות כ-B, מלאו אותן בשרף OCT והניחו אותן מיד במנגנון הקפאת הבזק בטמפרטורה של מינוס 80 מעלות צלזיוס.

עבור דגימות רקמה המסומנות כ- C, הנח את דגימות הרקמה הנותרות בצינורות מצופים קריובנק דו-ממדיים במנגנון הקפאת ההבזק. אחסנו את הצלחות במינוס 80 מעלות צלזיוס. בסך הכל נאספו 38, 446 ביופסיות נוזליות ביולוגיות מבוארות ו-10, 205 דגימות רקמה מאפריל 2012 עד דצמבר 2021.

מספר הדגימות שנאספו, במיוחד רקמות בין השנים 2020 ל-2021, פחת עקב מגפת הקורונה והירידה בהליכים אונקולוגיים. הדגימות שנאספו שהתקבלו ממחלקות האורולוגיה, הגינקולוגיה, הסונולוגיה וחלוקות הראש והצוואר, הבטן, האגן וניתוחי החזה נותחו בפירוט. המספר הגבוה ביותר של דגימות רקמה נאספו מגידולי שד.

אוסף הדגימות הביולוגיות האחרות, כגון שתן, צואה ומטושים בוקאליים, גדל משמעותית בעקבות הביקוש לאורך השנים. אפשרות זו מספקת פלטפורמה בסיסית לאחסון דגימות ביולוגיות ומשפרת את יכולת ההתרבות של תוכניות לחקר הסרטן. דגימות אלה יכולות לשמש ליישומי מחקר שונים כגון ריצוף הדור הבא או ספקטרומטריית מסות.

הפלטפורמה שלנו מסוגלת להטמיע אלגוריתמים חדשים של בינה מלאכותית במחקר תרגומי עם פוטנציאל לשנות את אופן הטיפול בחולי סרטן.