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Method Article
Este protocolo describe una metodología para recapitular la neurogénesis alterada del síndrome de Down (SD) utilizando iPSC humanas con SD. El protocolo identificó el defecto del ciclo celular bifásico como la causa de la neurogénesis alterada en el síndrome de Down. Proporciona una plataforma sólida para comprender los mecanismos celulares y moleculares que subyacen a la neurogénesis anormal asociada con el SD.
El síndrome de Down (SD), causado por una copia adicional del cromosoma 21, es una de las principales causas de discapacidad intelectual. Uno de los factores clave que contribuyen a esta discapacidad intelectual es el deterioro de la neurogénesis que se observa desde las etapas fetales en adelante. Para estudiar estas anomalías del desarrollo neurológico, las células madre pluripotentes inducidas por el ser humano (hiPSC) generadas a partir de células obtenidas de pacientes con SD proporcionan un modelo valioso y relevante. Aquí, se describe un protocolo integral para recapitular la neurogénesis alterada del SD observada durante las etapas fetales del SD. Este protocolo utiliza un par de DS-hiPSCs que tienen tres copias del cromosoma 21 y sus hiPSCs euploides isogénicas que tienen dos copias del cromosoma 21. Es importante destacar que el protocolo descrito aquí recapitula la neurogénesis alterada por el SD y encontró que el defecto del ciclo celular bifásico, es decir, la proliferación reducida de las células progenitoras neurales (NPC) del SD durante la fase temprana de la etapa neurogénica seguida de una mayor proliferación de NPC del SD durante la fase tardía de la etapa neurogénica es la causa de la neurogénesis deteriorada del SD. El aumento de la proliferación de NPC DS durante la fase tardía de la etapa neurogénica conduce a una salida retrasada del ciclo celular, lo que provoca una reducción de la generación de neuronas postmitóticas a partir de las NPC DS. Este protocolo incluye pasos detallados para el mantenimiento de las hiPSCs, su diferenciación en linajes neuronales que muestran un defecto del ciclo celular bifásico durante la etapa neurogénica y la posterior validación de la diferenciación neuronal reducida en las células DS. Siguiendo esta metodología, los investigadores pueden crear un sistema experimental robusto que imite las condiciones de neurodesarrollo del SD, lo que les permite explorar las alteraciones específicas en el desarrollo cerebral causadas por la trisomía 21.
El síndrome de Down (SD), o trisomía 21, es la anomalía cromosómica más común y la principal causa de discapacidad intelectual (DI)1. El deterioro de la neurogénesis durante el desarrollo fetal del SD es una de las causas de discapacidad intelectual en el SD2. Los estudios fetales con SD humano muestran una reducción en el peso y volumen del cerebro, neuronas reducidas, aumento de astrocitos 3,4 y distribución anormal de neuronas en las capas II y IV 5,6. Además, la segunda fase del desarrollo cortical, es decir, la aparición de la laminación, se retrasa y se desorganiza en el DS7.
Los defectos del neurodesarrollo en el SD se han estudiado principalmente utilizando modelos de ratones de SD como Ts65Dn, Ts1Rhr y Ts1cje8. Sin embargo, estos modelos de ratones no fueron capaces de recapitular completamente varios fenotipos observados en los estudios de SD debido a las diferencias fisiológicas y de desarrollo entre ratones y humanos9, lo que llevó a ensayos clínicos fallidos10. La invención de las células madre pluripotentes inducidas11,12 proporcionó una oportunidad para modelar el deterioro neurológico del síndrome de Down utilizando células derivadas directamente de individuos con SD. Sin embargo, los intentos anteriores de modelar los defectos del neurodesarrollo del SD utilizando iPSCs humanas encontraron resultados inconsistentes y no pudieron explicar completamente los defectos del neurodesarrollo observados en las secciones del cerebro fetal del SD 13,14,15,16. Por ejemplo, un informe publicado por Shi et al. encontró fenotipos de Alzheimer relacionados con el SD, pero no informó ninguna diferencia en la neurogénesis del SD en comparación con los controles euploides15. De manera similar, Weick et al. informaron una actividad sináptica reducida pero una neurogénesis normal en el SD en comparación con los controles euploides16. Sin embargo, la neurogénesis normal en el SD reportada en estas publicaciones no fue consistente con la observación de las secciones del cerebro fetal del SD. Más tarde, un informe de Hibaoui et al. informó de una reducción de la neurogénesis en el SD, lo que fue consistente con la observación de la sección14 del cerebro fetal del SD. Sin embargo, este informe y otro informe reciente describieron la reducción de la proliferación de NPCs del SD como la causa de la reducción de la neurogénesis en el SD14,17. Sin embargo, solo la reducción de la proliferación de NPCs con SD no pudo explicar el aumento de las células astrogliales y el retraso en la aparición de la laminación durante el desarrollo del cerebro fetal con SD.
En un trabajo publicado recientemente, se desarrolló un modelo de neurogénesis alterada del SD basado en iPSC humano que muestra una neurogénesis reducida. Este modelo encontró que la neurogénesis alterada en el SD se debe a defectos del ciclo celular bifásico durante la etapa neurogénica (la etapa durante la cual se generan células progenitoras neurales a partir de células madre pluripotentes). Durante la primera fase en la etapa neurogénica, las NPC DS exhiben una proliferación reducida en comparación con las células neuronales euploides isogénicas, seguidas de una mayor proliferación de las NPC DS en comparación con las células euploides isogénicas en la fase tardía de la etapa neurogénica18.
En este manuscrito, se ha descrito un protocolo detallado paso a paso para la diferenciación de las hiPSCs del síndrome de Down y sus hiPSCs euploides isogénicas en neuronas corticales. El objetivo general de este método es proporcionar un protocolo detallado, paso a paso, para diferenciar un par de hiPSC DS y sus hiPSC euploides isogénicas en neuronas corticales con un enfoque en el modelado de los defectos de neurogénesis asociados con el SD. Este protocolo está diseñado para ofrecer un sistema robusto y reproducible para investigar los mecanismos celulares y moleculares que subyacen a las anomalías que causan la neurogénesis alterada por el SD.
La razón detrás del desarrollo de este protocolo es permitir la diferenciación de células madre pluripotentes en neuronas corticales mediante la utilización de principios de la neurobiología del desarrollo, permitiendo así la identificación de fenotipos que surgen debido a una enfermedad / trastorno. Su objetivo era adoptar un enfoque minimalista para la diferenciación neuronal de las iPSC evitando compuestos como el AMPc o el DAPT, que pueden enmascarar los fenotipos de enfermedades que surgen debido a defectos en el canal Ca++ o en la vía NOTCH, respectivamente. Del mismo modo, también se evitó el uso de ácido ascórbico, BDNF y GDNF, que pueden enmascarar otros fenotipos relacionados con enfermedades neurológicas al potenciar la neurogénesis.
Las ventajas de esta técnica sobre los métodos alternativos radican en que proporcionan una recapitulación robusta de los fenotipos neurológicos observados en las secciones cerebrales fetales del SD. Cabe destacar que, en comparación con los modelos de ratón, el sistema basado en iPSC humano elimina las diferencias entre especies, proporcionando un modelo más relevante para estudiar los procesos de neurodesarrollo específicos de loshumanos.9 pero hasta ahora no ha logrado recapitular la neurogénesis alterada del SD observada en las etapas fetales del SD en adelante. Además, el uso de pares isogénicos de hiPSCs reduce la variabilidad y mejora la fiabilidad de las diferencias fenotípicas observadas. Este protocolo será de particular interés para los investigadores que estudian los trastornos del neurodesarrollo y la neurogénesis humana. Es especialmente relevante para aquellos que buscan modelar aspectos específicos del SD humano o aquellos interesados en desarrollar intervenciones terapéuticas dirigidas a los defectos de neurogénesis asociados con la trisomía 21.
Se siguió el siguiente protocolo con dos pares de iPSCs humanas con síndrome de Down y sus iPSCs euploides. Un par se generó utilizando el método de administración de reprogramación mediado por retrovirales19, y un segundo par (NSi003-A y NSi003-B) se generó utilizando el método de administración del virus Sendai no integrador20. A grandes rasgos, el protocolo consta de dos etapas: la etapa neurogénica (Etapa 1) y la etapa de diferenciación neuronal (Etapa 2). Además, se observan dos fases basadas en las diferencias en la proliferación del síndrome de Down y las líneas celulares euploides isogénicas, es decir, las fases temprana y tardía, en la etapa neurogénica. Los detalles de los reactivos, medios y equipos utilizados en este estudio se enumeran en la Tabla de Materiales.
1. Cultivo y mantenimiento de hiPSCs con síndrome de Down y hiPSCs euploides isogénicas
2. Diferenciación neuronal
NOTA: Preparación del medio acondicionado para el alimentador (FCM): Utilice un matraz T-75 y una placa de 4 x 106 celdas de alimentación por matraz. Al día siguiente, agregue 40 mL de medio hiPSC con 4 ng/mL de bFGF. Recogida durante 7 días. Almacene cada tubo diario a -20 °C durante un máximo de 1 mes. Cubrir un plato de 15 cm con 10 ml de gelatina al 0,1% a 37 °C durante al menos 2 h antes de disociar las células. Cubra una placa de 6 pocillos con matriz de membrana basal calificada para hESC (en lo sucesivo denominada "matriz calificada") 1 día antes de disociar las células. Al disociar células en todo el protocolo, agregue 10 μM de RI a la solución de desprendimiento de células (consulte la Tabla de materiales), DPBS y medios de recubrimiento (FCM suplementado con 25 ng/mL de bFGF). Prepare un medio acondicionado para alimentadores frescos (FCM) para cada diferenciación. Evite el pipeteo excesivo de las hiPSC.
3. Inmunocitoquímica (ICC)
NOTA: Agregue suficiente tampón en todas las etapas para cubrir las celdas y evitar el secado del pocillo mientras aspira durante la etapa de lavado.
4. Adquisición y análisis de imágenes
Las iPSCs humanas singularizadas se sembraron en placas recubiertas de matriz calificadas como suspensiones unicelulares, y la diferenciación se inició mediante la eliminación de bFGF. Para inhibir la diferenciación no ectodérmica, se añadió dorsomorfina, un inhibidor de la señalización de BMP, de DIV 2-1821. Para una mayor diferenciación de las células progenitoras de la etapa neurogénica, las suspensiones de células individuales se replantaron a baj...
En este trabajo, se describe un protocolo eficiente de neurodiferenciación cortical monocapa no dirigida para un par isogénico de hiPSCs euploides, y hiPSCs DS. Al crecer las células como monocapas, están más expuestas a las condiciones de cultivo, lo que no es posible en la misma medida que el uso de cuerpos embrioides para la diferenciación de iPSCs, que generalmente se utilizan en otros protocolos14,16. Si bien la utilid...
Los autores no tienen ningún conflicto de intereses que revelar.
Los autores agradecen al Prof. Stuart H. Orkin por proporcionarnos un par de hiPSC con síndrome de Down y euploides isogénicas. Los autores también están agradecidos al Centro Nacional de Ciencia Celular (BRIC-NCCS), Pune, por proporcionar los fondos para llevar a cabo este trabajo.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
MEF medium: | |||
DMEM High Glucose | Gibco | 11965-092 | |
FBS | VWR | 97068-085 | 10% final concentration |
Non-Essential Amino Acids | Hyclone | SH30238.01 | 1X final concentration |
Penicillin/Streptomycin | Hyclone | SV30010 | 1X final concentration |
β-Mercaptoethanol | Gibco | 21985-023 | 1X final concentration |
hiPSC medium: | |||
Knockout DMEM/F12 | Gibco | 12660-012 | |
Knockout Serum Replacement (KOSR) | Gibco | 10828-028 | 20% final concentration |
Non-Essential Amino Acids | Hyclone | SH30238.01 | 1X final concentration |
Glutamax | Gibco | 35050061 | 1X final concentration |
Penicillin/Streptomycin | Hyclone | SV30010 | 1X final concentration |
β-Mercaptoethanol (1000X) | Gibco | 21985-023 | 1X final concentration |
DDM medium: | |||
Knockout DMEM/F12 | Gibco | 12660-012 | |
Non-Essential Amino Acids | Hyclone | SH30238.01 | 1X final concentration |
Glutamax | Gibco | 35050061 | 1X final concentration |
Penicillin/Streptomycin | Hyclone | SV30010 | 1X final concentration |
Albumax (10%) | Invitrogen | 11020-021 | 0.5 X of 10% Albumax is final concentration |
NPC medium: | |||
DDM medium | |||
N2 Supplement | Gibco | 17502048 | 1X final concentration |
B-27 Supplement (50X), minus vitamin A | Gibco | 12587010 | 1X final concentration |
Neural Differentiation medium (ND): | |||
DDM medium | 1/2 of volume | ||
Neurobasal Medium | Gibco | 21103-049 | 1/2 of volume |
N2 Supplement | Gibco | 17502048 | 0.5 X final concentration |
B-27 Supplement (50X) | Gibco | 17504044 | 0.5 X final concentration |
Glutamax | Gibco | 35050061 | 1X of Neurobasal medium |
Penicillin/Streptomycin | Hyclone | SV30010 | 1X of Neurobasal medium |
Antibodies and reagents for immunostaining: | |||
Paraformaldehyde | Sigma-Aldrich | 158127-500G | 4% |
DPBS, no calcium, no magnesium | Sigma-Aldrich | D5652 | |
Triton-X-100 Solution | Sigma-Aldrich | X100-500ML | 0.20% |
BSA | Hyclone | A7979-50ML | 1.00% |
Purified anti-tubulin β-3 (TUBB3) (TUJ1) | BioLegend | 801202 | 1:500 dilution |
Donkey anti-Mouse IgG (H+L) Secondary Antibody, Alexa fluor 594 conjugate | Life Tech Invitrogen | A21203 | 1:250 dilution |
Purified Mouse-Anti-Human Ki67 | BD Pharmingen | 550609 | 1:100 dilution |
Purified anti-PAX6 | BioLegends | 901302 | 1:100 dilution |
Alexa fluor 488 Donkey (anti-rabbit) | Life Tech Invitrogen | A21206 | 1:250 dilution |
DAPI Solution (5 mg/mL) | Sigma | D9542 | 1:1000 dilution |
Others | |||
Cell detachment solution (Accutase) | Gibco | A11105-01 | Ready to use working solution |
Rock inhibitor (RI) | Sellechckem | Y27632 | 10 mM/ml final concentration |
Dorsomorphin | Sellechckem | S7306 | 0.125 nM/ml final concentration |
DPBS with calcium and magnisium (DPBS+ Ca, Mg) | Gibco | 14040133 | Ready to use working solution |
DPBS without calcium and magnisium | Gibco | 14190136 | Ready to use working solution |
Gelatin Type A | Sigma | G2500-100G | 0.10% |
hESC-qualified basement membrane matrix (Matrigel GFR) | Corning | 356230 | 1 mg stock vial diluted 1:240 |
Trypsin 0.05% | Gibco | 25300054 | |
Trypan Blue | Gibco | 15250-061 | 0.40% |
Basic Fibrablast Growth Factor (bFGF) | Peprotech | 100-18B | 25 ng/ml final concentration |
Collagenase | Gibco | 17104-019 | 1mg/ml final concentration |
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