量化 黑腹果蝇 眼睛表型:一种整合 ilastik 和 Flynotyper 的计算方法

我们有兴趣为 ALS、FTD 和多系统蛋白质病等疾病开发疾病模型，以了解它们的分子病理学。我们使用的一个模型是果蝇眼系统。眼睛的规则性和对称性可用于评估引入突变和基因表达变化的影响。

我们的协议解决了量化粗眼表型方式的差距，特别是手动排名造成的差距。手动排名基于融合、Ommatidia 丢失和刷毛组织。但是，这可能会导致偏见。

因此，将 ilastik 和 Flynotyper 相结合，可以创建一种更强大的方法，用于对异常眼表型进行排名。由于其稳健性，我们的协议可能优于手动排名。即使是未经培训的实验室成员也可以成功进行定量，而可能需要训练有素的研究人员进行手动排序，以避免两个不同研究人员之间的分数差异。

因此，该协议可以节省时间和资源。我们的研究结果推动了研究，因为该协议可以更准确地量化粗糙的眼睛表型，尤其是眼睛形态的微弱改变，由于手动排名时的偏差，结合 ilastik 和 Flynotyper 将导致更准确的评分，因此会产生更准确的发表结果。