该协议允许从二维图像中量化细胞内结构的面积、周长和形状。这种技术是快速和容易的,只需要标准的实验室设置和共和显微镜,并使用开源软件。演示这个程序的将是安娜·巴尔塞拉克,一个博士学生从我的实验室。
首先,在四井胶原蛋白一个涂层室幻灯片中,每井在 0.5 毫升培养培养基中播种四倍至第五细胞,在 37 摄氏度和 5 度二氧化碳培养箱中进行 24 小时培养。第二天早上,使用光学倒置显微镜验证是否存在至少90%的汇合单层,并使用共和显微镜获得单片Z切片图像。对于焦距粘附分析,请在 ImageJ 中打开图像并选择分析、设置比例、移除比例和全局以像素为单位设置图像比例。
若要在测量选项中包括文件名和感兴趣区域的区域,请单击分析和设置测量值,并检查区域并显示标签选项。要减去背景,请选择过程并减去背景。将滚动球半径设置为 50 像素,并检查滑动抛物线。
要确定最小感兴趣区域的区域,请勾勒出最小的单个焦点粘附,然后单击分析和测量以测量该区域。当至少选择并测量了 20 个感兴趣区域时,计算并保存获得的结果的均值。将上边界设置为典型单元格区域的 25%。
若要将图像授予二进制图像,请单击图像、调整和阈值,并检查默认、黑白和深色背景。要测量感兴趣区域的数量和面积,请选择分析粒子并检查像素单位、显示结果、明确结果和汇总。将切片、计数和总面积平均大小数据从摘要窗口传输到所选的数据管理程序。
对于焦粘附定量,打开焦粘附 ImageJ 宏,进入最小感兴趣区域的区域作为最小感兴趣区域参数的区域。将阈值类型值设置为手动或自动,并保存更改。然后从 ImageJ 调用宏并选择要处理的图像。
对于手动单元格形状分析,请在适当的图像处理软件程序中打开图像,然后选择要测量的参数。使用徒手选择工具手动划定由所选的结蛋白标记的细胞边框。将自动计算每个单元格的选定参数。
概述所有单元格后,选择编辑、选择并添加到管理器。只应选择具有不间断边框的完整完全可见的单元格。要进行测量,请标记兴趣管理器区域左侧框中显示的所有数字,然后单击"度量"。
结果将显示在结果框中,并可以导入到首选电子表格。自动细胞分析有助于定量大量细胞。对于每个新的单元格类型,首先运行宏以建立参数。
宏完成后,选择设置单元格大小边界。单击最小和最大单元格的标签,然后单击度量值。设置最小单元格和最大单元格变量的值并保存更改。
关闭所有宏窗口,然后选择要以灰度处理的图像。然后再次运行宏。宏将提供一个结果表,其中包括单元格形状索引、纵横比和兴趣选择区域列表数据。
在这里,可以观察到与 ImageJ 一起计数的焦粘附的代表性图像,包括最终编号的轮廓和焦粘附轮廓与原始图像的叠加,用于控制和击倒细胞系。如本分析所示,与控制细胞系细胞相比,击倒细胞表明每个细胞的粘附数以及较大的粘附量。在这些图像中,显示了未经治疗和化疗的细胞单层代表性区域。
轮廓细胞的特征是按照其细胞形状指数值,例如,在此分析中,与未经治疗的对控相比,显示最后一个 bin 的增加和药物治疗细胞的主要峰值的扁平化。然后可以为每个单元培养生成频率分布和累积分布。所演示的单层灰度成像允许对来自12个视场的512个细胞进行分析和定量,揭示细胞形状指数的相对频率分布。
对于此协议来说,使用尽可能高质量的图像非常重要。适当的细胞播种、染色和成像应确保图像具有足够的实验质量。